RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 FN3KRPQ9HA64 309 aa13.01□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 GCM1Q9NP62 436 aa13.01□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 G6PC2Q9NQR9 355 aa13.01□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP13.01□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 TREM2Q9NZC2 230 aa13.01□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa13.01□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 CACNG2Q9Y698 323 aa13.01□□□□□ -0.33
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PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF19P17023 458 aa13□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 MYL12AP19105 171 aa13□□□□□ -0.33
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PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF181Q2M3W8 571 aa13□□□□□ -0.33
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PGGT1B-202ENST00000379615 DOK3Q7L591 496 aa13□□□□□ -0.33
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PGGT1B-202ENST00000379615 ENPP5Q9UJA9 477 aa13□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 MYRFQ9Y2G1 1151 aa13□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 WIPI2Q9Y4P8 454 aa13□□□□□ -0.33
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PGGT1B-202ENST00000379615 DHRS7CA6NNS2 312 aa12.99□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 IGLV3-1P01715 115 aa12.99□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 HTR1AP08908 422 aa12.99□□□□□ -0.33
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PGGT1B-202ENST00000379615 OR12D2P58182 307 aa12.99□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 MAB21L1Q13394 359 aa12.99□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 SPRNQ5BIV9 151 aa12.99□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 FDX2Q6P4F2 183 aa12.99□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa12.99□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 KRT74Q7RTS7 529 aa12.99□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 Q8TCH9 128 aa12.99□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 C4orf36Q96KX1 117 aa12.99□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 RTL8AQ9BWD3 113 aa12.99□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 ERVK13-1Q9NX77 482 aa12.99□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC22A13Q9Y226 551 aa12.99□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa12.98□□□□□ -0.33
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PGGT1B-202ENST00000379615 LRP5LA4QPB2 252 aa12.98□□□□□ -0.33
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PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF850A8MQ14 1090 aa12.98□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM178BH3BS89 294 aa12.98□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 P2RY10O00398 339 aa12.98□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 SYT7O43581 403 aa12.98□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 CD5LO43866 347 aa12.98□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 GRPP07492 148 aa12.98□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 ACKR3P25106 362 aa12.98□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 CCR9P51686 369 aa12.98□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 CDH15P55291 814 aa12.98□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 PRDX4Q13162 271 aa12.98□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 C6orf52Q5T4I8 152 aa12.98□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 AVPI1Q5T686 147 aa12.98□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM244Q5VVB8 128 aa12.98□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa12.98□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 SPICQ8N5J4 248 aa12.98□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 OR2G2Q8NGZ5 317 aa12.98□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 FBLIM1Q8WUP2 373 aa12.98□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 PIGCQ92535 297 aa12.98□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 PPP1R14AQ96A00 147 aa12.98□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 RAB39BQ96DA2 213 aa12.98□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM80Q96HE8 168 aa12.98□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 GAL3ST1Q99999 423 aa12.98□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa12.98□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 PCDHB10Q9UN67 800 aa12.98□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 PIGLQ9Y2B2 252 aa12.98□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 WNK2Q9Y3S1 2297 aa12.97□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM210A6NLX4 147 aa12.97□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 FSTL3O95633 263 aa12.97□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 PIPP12273 146 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 CCL1P22362 96 aa12.97□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 CPT2P23786 658 aa12.97□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 PSMB10P40306 273 aa12.97□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 MDH2P40926 338 aaKnown RBP12.97□□□□□ -0.33
PGGT1B-202ENST00000379615 BTG1P62324 171 aa12.97□□□□□ -0.33
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