RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373159.1

TRAPPC3-201, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 590 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-201ENST00000373159 FMO3P31513 532 aa10.7□□□□□ -0.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 KIR2DS4P43632 304 aa10.7□□□□□ -0.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 SLC15A1P46059 708 aa10.7□□□□□ -0.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 ENTPD1P49961 510 aa10.7□□□□□ -0.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 CSNK2BP67870 215 aa10.7□□□□□ -0.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 IKZF1Q13422 519 aa10.7□□□□□ -0.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 SAMD5Q5TGI4 173 aa10.7□□□□□ -0.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 STUMQ69YW2 141 aa10.7□□□□□ -0.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa10.7□□□□□ -0.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 PGBD2Q6P3X8 592 aa10.7□□□□□ -0.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 C11orf88Q6PI97 169 aa10.7□□□□□ -0.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 LYPD4Q6UWN0 246 aa10.7□□□□□ -0.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 ZNF511Q8NB15 262 aa10.7□□□□□ -0.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 BEND2Q8NDZ0 799 aa10.7□□□□□ -0.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 OR51L1Q8NGJ5 315 aa10.7□□□□□ -0.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa10.7□□□□□ -0.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 PPA2Q9H2U2 334 aa10.7□□□□□ -0.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 CCDC134Q9H6E4 229 aa10.7□□□□□ -0.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 EGLN3Q9H6Z9 239 aa10.7□□□□□ -0.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 SP140LQ9H930 580 aa10.7□□□□□ -0.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 SPAG4Q9NPE6 437 aa10.7□□□□□ -0.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 HAO2Q9NYQ3 351 aa10.7□□□□□ -0.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 IL20Q9NYY1 176 aa10.7□□□□□ -0.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 DNAJB11Q9UBS4 358 aa10.7□□□□□ -0.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 CDH10Q9Y6N8 788 aa10.7□□□□□ -0.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 A0A1W2PRD5 423 aa10.69□□□□□ -0.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 A0A1W2PRF3 423 aa10.69□□□□□ -0.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 A0A1W2PRM7 423 aa10.69□□□□□ -0.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 ZNF878C9JN71 531 aa10.69□□□□□ -0.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 M0R1W7 72 aa10.69□□□□□ -0.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 TBX1O43435 398 aa10.69□□□□□ -0.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 SASH3O75995 380 aa10.69□□□□□ -0.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 SPARCP09486 303 aa10.69□□□□□ -0.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 CFL1P23528 166 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 SAA4P35542 130 aa10.69□□□□□ -0.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 GSK3AP49840 483 aa10.69□□□□□ -0.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 EFNB2P52799 333 aa10.69□□□□□ -0.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 HMGA2P52926 109 aa10.69□□□□□ -0.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 DLX1P56177 255 aa10.69□□□□□ -0.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 GRB2P62993 217 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 KLRD1Q13241 179 aa10.69□□□□□ -0.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 NCR3LG1Q68D85 454 aa10.69□□□□□ -0.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa10.69□□□□□ -0.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 ZNF788Q6ZQV5 615 aa10.69□□□□□ -0.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 PRSS45Q7RTY3 260 aa10.69□□□□□ -0.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 PNKDQ8N490 385 aa10.69□□□□□ -0.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 SLC37A3Q8NCC5 494 aa10.69□□□□□ -0.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa10.69□□□□□ -0.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 OR5T2Q8NGG2 359 aa10.69□□□□□ -0.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 OR52L1Q8NGH7 329 aa10.69□□□□□ -0.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 OR52H1Q8NGJ2 320 aa10.69□□□□□ -0.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 OR10Z1Q8NGY1 313 aa10.69□□□□□ -0.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 PPP1R35Q8TAP8 253 aa10.69□□□□□ -0.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 CFHR4Q92496 578 aa10.69□□□□□ -0.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 MCUR1Q96AQ8 359 aa10.69□□□□□ -0.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 MED30Q96HR3 178 aa10.69□□□□□ -0.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 REEP6Q96HR9 211 aa10.69□□□□□ -0.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 RAB3IPQ96QF0 476 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 MICU1Q9BPX6 476 aa10.69□□□□□ -0.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa10.69□□□□□ -0.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 TOR3AQ9H497 397 aa10.69□□□□□ -0.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP10.69□□□□□ -0.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 MAB21L2Q9Y586 359 aa10.69□□□□□ -0.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa10.68□□□□□ -0.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa10.68□□□□□ -0.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 DHRS12A0PJE2 317 aa10.68□□□□□ -0.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 KRT36O76013 467 aa10.68□□□□□ -0.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 APOC1P02654 83 aa10.68□□□□□ -0.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 FABP3P05413 133 aa10.68□□□□□ -0.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 RRM2P31350 389 aa10.68□□□□□ -0.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 GNALP38405 381 aa10.68□□□□□ -0.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 CX3CR1P49238 355 aa10.68□□□□□ -0.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 BLVRAP53004 296 aa10.68□□□□□ -0.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 SLC25A1P53007 311 aa10.68□□□□□ -0.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 IL5RAQ01344 420 aa10.68□□□□□ -0.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 SNCBQ16143 134 aa10.68□□□□□ -0.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 TIGD6Q17RP2 521 aa10.68□□□□□ -0.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 KLHL12Q53G59 568 aa10.68□□□□□ -0.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 FAM76BQ5HYJ3 339 aa10.68□□□□□ -0.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 Q6ZPA2 131 aa10.68□□□□□ -0.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 REC114Q7Z4M0 266 aa10.68□□□□□ -0.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 RNF148Q8N7C7 305 aa10.68□□□□□ -0.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 ANGPTL6Q8NI99 470 aa10.68□□□□□ -0.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 ITPKCQ96DU7 683 aa10.68□□□□□ -0.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 CMTM5Q96DZ9 223 aa10.68□□□□□ -0.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 FAM234AQ9H0X4 552 aa10.68□□□□□ -0.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 MEGF9Q9H1U4 602 aa10.68□□□□□ -0.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa10.68□□□□□ -0.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 IL1RAPQ9NPH3 570 aa10.68□□□□□ -0.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 SIGLEC9Q9Y336 463 aa10.68□□□□□ -0.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP10.68□□□□□ -0.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa10.68□□□□□ -0.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 MPC1Q9Y5U8 109 aa10.68□□□□□ -0.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 V9GYQ6 96 aa10.68□□□□□ -0.7
TRAPPC3-201ENST00000373159 ANXA2P2A6NMY6 339 aa10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms