RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366686.1

CCSAP-202, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCSAP, Length 4,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-202ENST00000366686 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 PLEK2Q9NYT0 353 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 UTS2RQ9UKP6 389 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 TTC28Q96AY4 2481 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 A0A087WXM4 84 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 A0A0X1KG70 313 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 LRRN3E7EW58 273 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 H3BQF6 201 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 ETV2O00321 342 aaPredicted RBP2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 UPK2O00526 184 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 PEX11BO96011 259 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 FSHBP01225 129 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 STSP08842 583 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 CTXN2P0C2S0 81 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 CTSEP14091 401 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 CHRNB2P17787 502 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 BCKDHBP21953 392 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 HLA-DMAP28067 261 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 PYCR1P32322 319 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 PIGAP37287 484 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 BDKRB1P46663 353 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 SLURP1P55000 103 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 MTPNP58546 118 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 RPL26P61254 145 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 PITPNAQ00169 270 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 MOGQ16653 247 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 LIN52Q52LA3 116 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 PYDC2Q56P42 97 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 S100A7L2Q5SY68 101 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 TIGD3Q6B0B8 471 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 GDPD4Q6W3E5 623 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 SLC47A2Q86VL8 602 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 VRK3Q8IV63 474 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 SLC38A6Q8IZM9 456 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 GABRG1Q8N1C3 465 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 C10orf126Q8N4M7 172 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 OR4A15Q8NGL6 344 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 OR9A2Q8NGT5 310 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 SPATA3Q8NHX4 192 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 ACER1Q8TDN7 264 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 DNAJB3Q8WWF6 145 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 IL4I1Q96RQ9 567 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 SULT4A1Q9BR01 284 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 DEFB129Q9H1M3 183 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 OR51I2Q9H344 312 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 ASB8Q9H765 288 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 LRTM1Q9HBL6 345 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 CISHQ9NSE2 258 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 TAS2R13Q9NYV9 303 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 RIMS3Q9UJD0 308 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 CACNG2Q9Y698 323 aa2.15□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 ISPDA4D126 451 aa2.14□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 AQP9O43315 295 aa2.14□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP2.14□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 ADAP1O75689 374 aa2.14□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 KLK1P06870 262 aa2.14□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 LINC00032P0C843 101 aa2.14□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP2.14□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 NFYBP25208 207 aa2.14□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 DDTP30046 118 aa2.14□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP2.14□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 FAUP35544 74 aaKnown RBP2.14□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 ACVR1BP36896 505 aa2.14□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 MNDAP41218 407 aa2.14□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 RPL29P47914 159 aaKnown RBP2.14□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 TCL1AP56279 114 aa2.14□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 PIGPP57054 158 aa2.14□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 TFF2Q03403 129 aa2.14□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 TRAM2Q15035 370 aa2.14□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 OR8B8Q15620 311 aa2.14□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 ZBED5Q49AG3 693 aa2.14□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 MARCH8Q5T0T0 291 aa2.14□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa2.14□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 SMARCD3Q6STE5 483 aa2.14□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 UQCC3Q6UW78 93 aa2.14□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 DHRS11Q6UWP2 260 aa2.14□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 SCGB1D4Q6XE38 83 aa2.14□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 SLC35D2Q76EJ3 337 aa2.14□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 MOB3BQ86TA1 216 aa2.14□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 MDP1Q86V88 176 aa2.14□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF677Q86XU0 584 aa2.14□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 TMEM156Q8N614 296 aa2.14□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 SDR9C7Q8NEX9 313 aa2.14□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 OR13C9Q8NGT0 318 aa2.14□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 RHEBL1Q8TAI7 183 aa2.14□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 ZNF596Q8TC21 504 aa2.14□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 ABHD3Q8WU67 409 aa2.14□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 ASB13Q8WXK3 278 aa2.14□□□□□ -2.07
CCSAP-202ENST00000366686 TMEM37Q8WXS4 190 aa2.14□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.9 ms