RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 DCTDP32321 178 aa6.43□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 CD200P41217 278 aa6.43□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 GATA4P43694 442 aa6.43□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 MTNR1AP48039 350 aa6.43□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 CX3CR1P49238 355 aa6.43□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 EFNB1P98172 346 aa6.43□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 RIPK1Q13546 671 aa6.43□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 OR8G1Q15617 311 aa6.43□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF181Q2M3W8 571 aa6.43□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 ESCO2Q56NI9 601 aa6.43□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 C1orf87Q8N0U7 546 aa6.43□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 DHRSXQ8N5I4 330 aa6.43□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa6.43□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa6.43□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 SLC29A1Q99808 456 aa6.43□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 SLC22A4Q9H015 551 aa6.43□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 C7orf69Q9H7B7 122 aa6.43□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 MOB1AQ9H8S9 216 aa6.43□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 FAM118AQ9NWS6 357 aa6.43□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 LRCH1Q9Y2L9 728 aa6.43□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa6.43□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 A0A0A6YYJ9 748 aa6.42□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 TBX1O43435 398 aa6.42□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 GMDSO60547 372 aa6.42□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 SELENOFO60613 162 aa6.42□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 FAM20BO75063 409 aa6.42□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 FADS2O95864 444 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 OR2T7P0C7T2 308 aa6.42□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 IRF2P14316 349 aa6.42□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 ALOX5APP20292 161 aa6.42□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 PEX2P28328 305 aa6.42□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 DDOSTP39656 456 aa6.42□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 PMELP40967 661 aa6.42□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 OPRL1P41146 370 aa6.42□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 NAA10P41227 235 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 ACTA2P62736 377 aa6.42□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 ACTG2P63267 376 aa6.42□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 ROM1Q03395 351 aa6.42□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 EGR3Q06889 387 aa6.42□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 MZT1Q08AG7 82 aa6.42□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 MAB21L1Q13394 359 aa6.42□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 MED21Q13503 144 aa6.42□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 TIGD6Q17RP2 521 aa6.42□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 LRRC36Q1X8D7 754 aa6.42□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 GFOD2Q3B7J2 385 aa6.42□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF404Q494X3 552 aa6.42□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 KLHL22Q53GT1 634 aa6.42□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa6.42□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 LPCAT4Q643R3 524 aa6.42□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 FAM220AQ7Z4H9 259 aa6.42□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa6.42□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 KRT77Q7Z794 578 aa6.42□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF679Q8IYX0 411 aa6.42□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 LINC00528Q8N1L1 170 aa6.42□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 GALNT4Q8N4A0 578 aa6.42□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 DEFB108BQ8NET1 73 aa6.42□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 BBS1Q8NFJ9 593 aa6.42□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa6.42□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 OR56B2PQ8NGI1 322 aa6.42□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 OR11L1Q8NGX0 322 aa6.42□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 OR2T27Q8NH04 317 aa6.42□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 RHOXF1Q8NHV9 184 aa6.42□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 Q8TCH9 128 aa6.42□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 THEM6Q8WUY1 208 aa6.42□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 CYGBQ8WWM9 190 aa6.42□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 ERGIC1Q969X5 290 aa6.42□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 SPSB4Q96A44 273 aa6.42□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 MBOAT4Q96T53 435 aa6.42□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 AMELYQ99218 206 aa6.42□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM246Q9BRR3 403 aa6.42□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 ABHD6Q9BV23 337 aa6.42□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 OR10A2Q9H208 303 aa6.42□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 MMP26Q9NRE1 261 aa6.42□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 INPP5EQ9NRR6 644 aa6.42□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 UFSP2Q9NUQ7 469 aa6.42□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa6.42□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 MRPL15Q9P015 296 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 OR5V1Q9UGF6 321 aa6.42□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 OPN4Q9UHM6 478 aa6.42□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa6.42□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 CCDC182A6NF36 153 aa6.41□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 TRAPPC2LH3BP13 241 aa6.41□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 DLGAP1O14490 977 aa6.41□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 SULT1C4O75897 302 aa6.41□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 VENTXO95231 258 aa6.41□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 FSTL3O95633 263 aa6.41□□□□□ -1.38
SGMS1-201ENST00000361543 FSHBP01225 129 aa6.41□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 84.1 ms