RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359128.9

NLRC3-202, Transcript of NLR family CARD domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NLRC3, Length 6,401 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC3-202ENST00000359128 SPP1P10451 314 aa11.65□□□□□ -0.54
NLRC3-202ENST00000359128 KIR2DS2P43631 304 aa11.65□□□□□ -0.54
NLRC3-202ENST00000359128 LILRA6Q6PI73 481 aa11.65□□□□□ -0.54
NLRC3-202ENST00000359128 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.54
NLRC3-202ENST00000359128 CYSLTR2Q9NS75 346 aa11.65□□□□□ -0.54
NLRC3-202ENST00000359128 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
NLRC3-202ENST00000359128 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa11.65□□□□□ -0.54
NLRC3-202ENST00000359128 RAB19A4D1S5 217 aa11.65□□□□□ -0.54
NLRC3-202ENST00000359128 OR2A25A4D2G3 310 aa11.65□□□□□ -0.54
NLRC3-202ENST00000359128 TMEM235A6NFC5 223 aa11.65□□□□□ -0.54
NLRC3-202ENST00000359128 FZD6O60353 706 aa11.65□□□□□ -0.54
NLRC3-202ENST00000359128 B4GALT3O60512 393 aa11.65□□□□□ -0.54
NLRC3-202ENST00000359128 SIX6O95475 246 aa11.65□□□□□ -0.54
NLRC3-202ENST00000359128 AKR1C3P42330 323 aa11.65□□□□□ -0.54
NLRC3-202ENST00000359128 RAB7AP51149 207 aa11.65□□□□□ -0.54
NLRC3-202ENST00000359128 PIGPP57054 158 aa11.65□□□□□ -0.54
NLRC3-202ENST00000359128 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
NLRC3-202ENST00000359128 ETFRF1Q6IPR1 90 aa11.65□□□□□ -0.54
NLRC3-202ENST00000359128 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
NLRC3-202ENST00000359128 ZNF788Q6ZQV5 615 aa11.65□□□□□ -0.54
NLRC3-202ENST00000359128 TVP23CQ96ET8 276 aa11.65□□□□□ -0.54
NLRC3-202ENST00000359128 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
NLRC3-202ENST00000359128 TMEM147Q9BVK8 224 aa11.65□□□□□ -0.54
NLRC3-202ENST00000359128 NPAP1Q9NZP6 1156 aa11.65□□□□□ -0.54
NLRC3-202ENST00000359128 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP11.65□□□□□ -0.55
NLRC3-202ENST00000359128 EVPLQ92817 2033 aa11.65□□□□□ -0.55
NLRC3-202ENST00000359128 LRP3O75074 770 aa11.64□□□□□ -0.55
NLRC3-202ENST00000359128 FOSL1P15407 271 aa11.64□□□□□ -0.55
NLRC3-202ENST00000359128 hADV38S2A0JD32 116 aa11.64□□□□□ -0.55
NLRC3-202ENST00000359128 DBX1A6NMT0 343 aa11.64□□□□□ -0.55
NLRC3-202ENST00000359128 MT-ND4LP03901 98 aa11.64□□□□□ -0.55
NLRC3-202ENST00000359128 HRH1P35367 487 aa11.64□□□□□ -0.55
NLRC3-202ENST00000359128 CEACAM6P40199 344 aa11.64□□□□□ -0.55
NLRC3-202ENST00000359128 OPRK1P41145 380 aa11.64□□□□□ -0.55
NLRC3-202ENST00000359128 FAM122CQ6P4D5 195 aa11.64□□□□□ -0.55
NLRC3-202ENST00000359128 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa11.64□□□□□ -0.55
NLRC3-202ENST00000359128 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
NLRC3-202ENST00000359128 NRARPQ7Z6K4 114 aa11.64□□□□□ -0.55
NLRC3-202ENST00000359128 LYG1Q8N1E2 194 aa11.64□□□□□ -0.55
NLRC3-202ENST00000359128 SYS1Q8N2H4 156 aa11.64□□□□□ -0.55
NLRC3-202ENST00000359128 FAM26EQ8N5C1 309 aa11.64□□□□□ -0.55
NLRC3-202ENST00000359128 OR52I2Q8NH67 350 aa11.64□□□□□ -0.55
NLRC3-202ENST00000359128 SLC25A46Q96AG3 418 aa11.64□□□□□ -0.55
NLRC3-202ENST00000359128 C20orf24Q9BUV8 137 aa11.64□□□□□ -0.55
NLRC3-202ENST00000359128 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP11.64□□□□□ -0.55
NLRC3-202ENST00000359128 RHOBP62745 196 aa11.64□□□□□ -0.55
NLRC3-202ENST00000359128 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
NLRC3-202ENST00000359128 PLAC9Q5JTB6 97 aa11.64□□□□□ -0.55
NLRC3-202ENST00000359128 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
NLRC3-202ENST00000359128 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
NLRC3-202ENST00000359128 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
NLRC3-202ENST00000359128 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa11.64□□□□□ -0.55
NLRC3-202ENST00000359128 FBXO34Q9NWN3 711 aa11.64□□□□□ -0.55
NLRC3-202ENST00000359128 CLEC5AQ9NY25 188 aa11.64□□□□□ -0.55
NLRC3-202ENST00000359128 GAB2Q9UQC2 676 aa11.64□□□□□ -0.55
NLRC3-202ENST00000359128 DEFB108AA8MXU0 73 aa11.64□□□□□ -0.55
NLRC3-202ENST00000359128 NGFP01138 241 aa11.64□□□□□ -0.55
NLRC3-202ENST00000359128 B4GALNT1Q00973 533 aa11.64□□□□□ -0.55
NLRC3-202ENST00000359128 ZNF793Q6ZN11 406 aa11.64□□□□□ -0.55
NLRC3-202ENST00000359128 OR13C5Q8NGS8 318 aa11.64□□□□□ -0.55
NLRC3-202ENST00000359128 PLPPR2Q96GM1 343 aa11.64□□□□□ -0.55
NLRC3-202ENST00000359128 ASB1Q9Y576 335 aa11.64□□□□□ -0.55
NLRC3-202ENST00000359128 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa11.64□□□□□ -0.55
NLRC3-202ENST00000359128 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
NLRC3-202ENST00000359128 MDH2P40926 338 aaKnown RBP11.64□□□□□ -0.55
NLRC3-202ENST00000359128 RHOUQ7L0Q8 258 aa11.64□□□□□ -0.55
NLRC3-202ENST00000359128 C4orf45Q96LM5 186 aa11.64□□□□□ -0.55
NLRC3-202ENST00000359128 TCEAL7Q9BRU2 100 aa11.64□□□□□ -0.55
NLRC3-202ENST00000359128 SPNS1Q9H2V7 528 aa11.64□□□□□ -0.55
NLRC3-202ENST00000359128 CLCF1Q9UBD9 225 aa11.64□□□□□ -0.55
NLRC3-202ENST00000359128 LRP12Q9Y561 859 aa11.64□□□□□ -0.55
NLRC3-202ENST00000359128 ZNF724A8MTY0 619 aa11.63□□□□□ -0.55
NLRC3-202ENST00000359128 TAAR5O14804 337 aa11.63□□□□□ -0.55
NLRC3-202ENST00000359128 NHLRC1Q6VVB1 395 aa11.63□□□□□ -0.55
NLRC3-202ENST00000359128 STAC2Q6ZMT1 411 aa11.63□□□□□ -0.55
NLRC3-202ENST00000359128 TMUB2Q71RG4 321 aa11.63□□□□□ -0.55
NLRC3-202ENST00000359128 MFSD4AQ8N468 514 aa11.63□□□□□ -0.55
NLRC3-202ENST00000359128 ASB5Q8WWX0 329 aa11.63□□□□□ -0.55
NLRC3-202ENST00000359128 SLC7A6Q92536 515 aa11.63□□□□□ -0.55
NLRC3-202ENST00000359128 EXTL1Q92935 676 aa11.63□□□□□ -0.55
NLRC3-202ENST00000359128 GPR78Q96P69 363 aa11.63□□□□□ -0.55
NLRC3-202ENST00000359128 A0A1W2PRD5 423 aa11.63□□□□□ -0.55
NLRC3-202ENST00000359128 A0A1W2PRF3 423 aa11.63□□□□□ -0.55
NLRC3-202ENST00000359128 A0A1W2PRM7 423 aa11.63□□□□□ -0.55
NLRC3-202ENST00000359128 LY86O95711 162 aa11.63□□□□□ -0.55
NLRC3-202ENST00000359128 HRASP01112 189 aa11.63□□□□□ -0.55
NLRC3-202ENST00000359128 BRS3P32247 399 aa11.63□□□□□ -0.55
NLRC3-202ENST00000359128 SMIM19Q96E16 107 aa11.63□□□□□ -0.55
NLRC3-202ENST00000359128 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
NLRC3-202ENST00000359128 FAM53CQ9NYF3 392 aa11.63□□□□□ -0.55
NLRC3-202ENST00000359128 MS4A18H0YCH9 400 aa11.63□□□□□ -0.55
NLRC3-202ENST00000359128 ACTL6AO96019 429 aa11.63□□□□□ -0.55
NLRC3-202ENST00000359128 FBP1P09467 338 aa11.63□□□□□ -0.55
NLRC3-202ENST00000359128 OR4A8P0C604 315 aa11.63□□□□□ -0.55
NLRC3-202ENST00000359128 OR5H8P0DN80 308 aa11.63□□□□□ -0.55
NLRC3-202ENST00000359128 MS4A18Q3C1V0 323 aa11.63□□□□□ -0.55
NLRC3-202ENST00000359128 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
NLRC3-202ENST00000359128 KCNRGQ8N5I3 272 aa11.63□□□□□ -0.55
NLRC3-202ENST00000359128 PP6455Q8WZ26 134 aa11.63□□□□□ -0.55
NLRC3-202ENST00000359128 OR2A5Q96R48 311 aa11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.6 ms