RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 OR4D11Q8NGI4 311 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 GPR148Q8TDV2 347 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 METTL9Q9H1A3 318 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 HIPK2Q9H2X6 1198 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 NTN4Q9HB63 628 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 POLE4Q9NR33 117 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 C20orf141Q9NUB4 165 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 GHRLQ9UBU3 117 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 PITPNC1Q9UKF7 332 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 RAB26Q9ULW5 256 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 SORL1Q92673 2214 aa3.85□□□□□ -1.79
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PTPRC-201ENST00000348564 TMEM229AB2RXF0 380 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 M0QZ24 198 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 PDCD5O14737 125 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 GASTP01350 101 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 FBP1P09467 338 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 FAHP16930 419 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 ACHEP22303 614 aa3.85□□□□□ -1.79
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PTPRC-201ENST00000348564 ABCA11PQ4W5N1 156 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 NUP37Q8NFH4 326 aa3.85□□□□□ -1.79
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PTPRC-201ENST00000348564 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 SPACA5Q96QH8 159 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
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PTPRC-201ENST00000348564 DIABLOQ9NR28 239 aa3.85□□□□□ -1.79
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PTPRC-201ENST00000348564 CLCF1Q9UBD9 225 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 LRRC42Q9Y546 428 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 C7orf72A4D263 438 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 FAM172BPA6NC97 362 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 C17orf100A8MU93 164 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 CYB5BO43169 146 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 SELENOFO60613 162 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 CELA3BP08861 270 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 CAPGP40121 348 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
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PTPRC-201ENST00000348564 EMC4Q5J8M3 183 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 NCMAPQ5T1S8 102 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 FADS6Q8N9I5 356 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 C1orf162Q8NEQ5 155 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 OR4K15Q8NH41 348 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 POC1BQ8TC44 478 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 OIT3Q8WWZ8 545 aa3.85□□□□□ -1.79
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PTPRC-201ENST00000348564 RDH12Q96NR8 316 aa3.85□□□□□ -1.79
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PTPRC-201ENST00000348564 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 KCNE5Q9UJ90 142 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 KCNG2Q9UJ96 466 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 ADAM30Q9UKF2 790 aa3.85□□□□□ -1.79
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PTPRC-201ENST00000348564 NGFP01138 241 aa3.84□□□□□ -1.79
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PTPRC-201ENST00000348564 PPIAL4GP0DN37 164 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 POLR2IP36954 125 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 MDH2P40926 338 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 GNG10P50151 68 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 PRRX1P54821 245 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 TESK1Q15569 626 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 SLC16A9Q7RTY1 509 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 OR4C13Q8NGP0 309 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM186Q96B77 213 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 C14orf79Q96F83 325 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 ARHGDIGQ99819 225 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 ABHD6Q9BV23 337 aa3.84□□□□□ -1.79
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PTPRC-201ENST00000348564 LPAR3Q9UBY5 353 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 SCOCQ9UIL1 159 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 TRAV40A0A0B4J280 105 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa3.84□□□□□ -1.79
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PTPRC-201ENST00000348564 E7EQL1 145 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 SCGB2A1O75556 95 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 TOX4O94842 621 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 DIRAS3O95661 229 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 CST2P09228 141 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 DEFA4P12838 97 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRC-201ENST00000348564 ADRA2CP18825 462 aa3.84□□□□□ -1.79
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