RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331222.5

CLN8-201, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLN8, Length 7,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-201ENST00000331222 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 XKRY2A2RUG3 117 aa9.54□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 DFFBO76075 338 aa9.54□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 AQP8O94778 261 aa9.54□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 POM121L2Q96KW2 1035 aa9.54□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 LINC00052Q96N35 136 aa9.54□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 TAAR6Q96RI8 345 aa9.54□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 NUDT9Q9BW91 350 aa9.54□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 KPTNQ9Y664 436 aa9.54□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 GPRIN2O60269 458 aa9.54□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 TRAPPC2P0DI81 140 aa9.54□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 TRAPPC2BP0DI82 140 aa9.54□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 ACHEP22303 614 aa9.54□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 FOXF1Q12946 379 aa9.54□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 VWA1Q6PCB0 445 aa9.54□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 CYHR1Q6ZMK1 362 aa9.54□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 SEH1LQ96EE3 360 aa9.54□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 LURAP1Q96LR2 239 aa9.54□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 OR1A1Q9P1Q5 309 aa9.54□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 DOCK2Q92608 1830 aa9.54□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 A0A0A6YYJ9 748 aa9.54□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 A0A1W2PNV4 684 aa9.54□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 FCGR3BO75015 233 aa9.54□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 CD80P33681 288 aa9.54□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 RPS19P39019 145 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 GSCP56915 257 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 RAB1AP62820 205 aa9.54□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 Q6ZSR9 355 aa9.54□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 CLDN23Q96B33 292 aa9.54□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 MMP25Q9NPA2 562 aa9.54□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 CBR3O75828 277 aa9.53□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 IL5P05113 134 aa9.53□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 CTSLP07711 333 aa9.53□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 USF1P22415 310 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 G6PCP35575 357 aa9.53□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 OR2T2Q6IF00 324 aa9.53□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 SPRED1Q7Z699 444 aa9.53□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 OR13C8Q8NGS7 320 aa9.53□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 DHRS4Q9BTZ2 278 aa9.53□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 PMS2P2O95744 297 aa9.53□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 SPI1P17947 270 aa9.53□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 ABCD3P28288 659 aa9.53□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 METAP1P53582 386 aa9.53□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 HMGN3Q15651 99 aa9.53□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 FBXL6Q8N531 539 aa9.53□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 TMED6Q8WW62 240 aa9.53□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 SIAEQ9HAT2 523 aa9.53□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 LAMB1P07942 1786 aa9.53□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa9.53□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 TMPRSS11DO60235 418 aa9.53□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 PATE4P0C8F1 98 aa9.53□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 BTF3L4Q96K17 158 aa9.53□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 CHRM2P08172 466 aa9.53□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 CST5P28325 142 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 LYZP61626 148 aa9.53□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 RTL10Q7L3V2 364 aa9.53□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 OR4S1Q8NGB4 309 aa9.53□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 PECRQ9BY49 303 aa9.53□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa9.53□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 DLL4Q9NR61 685 aa9.53□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 MED17Q9NVC6 651 aa9.53□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 FBXL4Q9UKA2 621 aa9.53□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 ZNHIT1O43257 154 aa9.53□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa9.53□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 CD22P20273 847 aa9.53□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 ECI1P42126 302 aa9.53□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 OXA1LQ15070 435 aa9.53□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 PCK2Q16822 640 aa9.53□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 SLC35E4Q6ICL7 350 aa9.53□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 OSR2Q8N2R0 312 aa9.53□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa9.53□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 FBXO34Q9NWN3 711 aa9.53□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 PPIL1Q9Y3C6 166 aa9.53□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa9.52□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 PRSS37A4D1T9 235 aa9.52□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 RFPL4AA6NLU0 287 aa9.52□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa9.52□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 SYT5O00445 386 aa9.52□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 ACOT8O14734 319 aa9.52□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 IGKV3-15P01624 115 aa9.52□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 CCR2P41597 374 aa9.52□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 SLC35D3Q5M8T2 416 aa9.52□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 RETREG3Q86VR2 466 aa9.52□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 OR4C3Q8NH37 302 aa9.52□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 MYEOVQ96EZ4 313 aa9.52□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 IGHV3OR16-12A0A075B7B8 117 aa9.52□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa9.52□□□□□ -0.88
CLN8-201ENST00000331222 KIR2DS4P43632 304 aa9.52□□□□□ -0.88
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