RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000289865.12

USP21-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 21, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP21, Length 2,195 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21-201ENST00000289865 ZNF799Q96GE5 643 aa16.88■□□□□ 0.29
USP21-201ENST00000289865 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
USP21-201ENST00000289865 C9orf170A2RU37 121 aa16.88■□□□□ 0.29
USP21-201ENST00000289865 CRYZL1O95825 349 aa16.88■□□□□ 0.29
USP21-201ENST00000289865 CD8AP01732 235 aa16.88■□□□□ 0.29
USP21-201ENST00000289865 GP1BAP07359 652 aa16.88■□□□□ 0.29
USP21-201ENST00000289865 TCN2P20062 427 aa16.88■□□□□ 0.29
USP21-201ENST00000289865 IL13RA1P78552 427 aa16.88■□□□□ 0.29
USP21-201ENST00000289865 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
USP21-201ENST00000289865 MICBQ29980 383 aa16.88■□□□□ 0.29
USP21-201ENST00000289865 TCEAL6Q6IPX3 200 aa16.88■□□□□ 0.29
USP21-201ENST00000289865 CRIP3Q6Q6R5 217 aa16.88■□□□□ 0.29
USP21-201ENST00000289865 C1QL2Q7Z5L3 287 aa16.88■□□□□ 0.29
USP21-201ENST00000289865 OR51T1Q8NGJ9 327 aa16.88■□□□□ 0.29
USP21-201ENST00000289865 COQ8AQ8NI60 647 aa16.88■□□□□ 0.29
USP21-201ENST00000289865 TCEAL3Q969E4 200 aa16.88■□□□□ 0.29
USP21-201ENST00000289865 FN3KRPQ9HA64 309 aa16.88■□□□□ 0.29
USP21-201ENST00000289865 PIGLQ9Y2B2 252 aa16.88■□□□□ 0.29
USP21-201ENST00000289865 LOXL2Q9Y4K0 774 aa16.88■□□□□ 0.29
USP21-201ENST00000289865 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
USP21-201ENST00000289865 PMS2P1A4D2B8 440 aa16.87■□□□□ 0.29
USP21-201ENST00000289865 OR5H14A6NHG9 310 aa16.87■□□□□ 0.29
USP21-201ENST00000289865 STMND1H3BQB6 276 aa16.87■□□□□ 0.29
USP21-201ENST00000289865 IL2RAP01589 272 aa16.87■□□□□ 0.29
USP21-201ENST00000289865 ZNF250P15622 560 aa16.87■□□□□ 0.29
USP21-201ENST00000289865 AKR1C4P17516 323 aa16.87■□□□□ 0.29
USP21-201ENST00000289865 ACP1P24666 158 aa16.87■□□□□ 0.29
USP21-201ENST00000289865 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
USP21-201ENST00000289865 PTGFRP43088 359 aa16.87■□□□□ 0.29
USP21-201ENST00000289865 RAC3P60763 192 aa16.87■□□□□ 0.29
USP21-201ENST00000289865 UBE2V2Q15819 145 aa16.87■□□□□ 0.29
USP21-201ENST00000289865 CCDC157Q569K6 752 aa16.87■□□□□ 0.29
USP21-201ENST00000289865 ZNF546Q86UE3 836 aa16.87■□□□□ 0.29
USP21-201ENST00000289865 ESX1Q8N693 406 aa16.87■□□□□ 0.29
USP21-201ENST00000289865 CASTOR1Q8WTX7 329 aa16.87■□□□□ 0.29
USP21-201ENST00000289865 SEC22AQ96IW7 307 aa16.87■□□□□ 0.29
USP21-201ENST00000289865 OR10A2Q9H208 303 aa16.87■□□□□ 0.29
USP21-201ENST00000289865 ANAPC10Q9UM13 185 aa16.87■□□□□ 0.29
USP21-201ENST00000289865 MFNGO00587 321 aa16.87■□□□□ 0.29
USP21-201ENST00000289865 RFPL3SP0C7P2 107 aa16.87■□□□□ 0.29
USP21-201ENST00000289865 VAMP1P23763 118 aa16.87■□□□□ 0.29
USP21-201ENST00000289865 CHAF1BQ13112 559 aa16.87■□□□□ 0.29
USP21-201ENST00000289865 DEFB123Q8N688 67 aa16.87■□□□□ 0.29
USP21-201ENST00000289865 OR10K1Q8NGX5 313 aa16.87■□□□□ 0.29
USP21-201ENST00000289865 MARCH1Q8TCQ1 289 aa16.87■□□□□ 0.29
USP21-201ENST00000289865 SCARB1Q8WTV0 552 aa16.87■□□□□ 0.29
USP21-201ENST00000289865 CT55Q8WUE5 264 aa16.87■□□□□ 0.29
USP21-201ENST00000289865 SPTSSAQ969W0 71 aa16.87■□□□□ 0.29
USP21-201ENST00000289865 PHB2Q99623 299 aa16.87■□□□□ 0.29
USP21-201ENST00000289865 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
USP21-201ENST00000289865 RDH8Q9NYR8 311 aa16.87■□□□□ 0.29
USP21-201ENST00000289865 ZNF224Q9NZL3 707 aa16.87■□□□□ 0.29
USP21-201ENST00000289865 SHOXO15266 292 aa16.86■□□□□ 0.29
USP21-201ENST00000289865 FCGR2AP12318 317 aa16.86■□□□□ 0.29
USP21-201ENST00000289865 ICAM2P13598 275 aa16.86■□□□□ 0.29
USP21-201ENST00000289865 NAT1P18440 290 aa16.86■□□□□ 0.29
USP21-201ENST00000289865 CARD18P57730 90 aa16.86■□□□□ 0.29
USP21-201ENST00000289865 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
USP21-201ENST00000289865 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
USP21-201ENST00000289865 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
USP21-201ENST00000289865 FGL1Q08830 312 aa16.86■□□□□ 0.29
USP21-201ENST00000289865 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
USP21-201ENST00000289865 FAM189A2Q15884 450 aa16.86■□□□□ 0.29
USP21-201ENST00000289865 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa16.86■□□□□ 0.29
USP21-201ENST00000289865 SNAI3Q3KNW1 292 aa16.86■□□□□ 0.29
USP21-201ENST00000289865 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa16.86■□□□□ 0.29
USP21-201ENST00000289865 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
USP21-201ENST00000289865 RHBDD1Q8TEB9 315 aa16.86■□□□□ 0.29
USP21-201ENST00000289865 MITD1Q8WV92 249 aa16.86■□□□□ 0.29
USP21-201ENST00000289865 PP6455Q8WZ26 134 aa16.86■□□□□ 0.29
USP21-201ENST00000289865 CHST5Q9GZS9 411 aa16.86■□□□□ 0.29
USP21-201ENST00000289865 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa16.86■□□□□ 0.29
USP21-201ENST00000289865 TECTAO75443 2155 aa16.86■□□□□ 0.29
USP21-201ENST00000289865 POM121CA8CG34 1229 aa16.85■□□□□ 0.29
USP21-201ENST00000289865 FAM25EA8MYX2 175 aa16.85■□□□□ 0.29
USP21-201ENST00000289865 EFSO43281 561 aa16.85■□□□□ 0.29
USP21-201ENST00000289865 DNPH1O43598 174 aa16.85■□□□□ 0.29
USP21-201ENST00000289865 SERPINA2P20848 420 aa16.85■□□□□ 0.29
USP21-201ENST00000289865 AVPR2P30518 371 aa16.85■□□□□ 0.29
USP21-201ENST00000289865 AGTR1P30556 359 aa16.85■□□□□ 0.29
USP21-201ENST00000289865 NTF4P34130 210 aa16.85■□□□□ 0.29
USP21-201ENST00000289865 SIGLEC14Q08ET2 396 aa16.85■□□□□ 0.29
USP21-201ENST00000289865 ARFRP1Q13795 201 aa16.85■□□□□ 0.29
USP21-201ENST00000289865 FAM27BQ5VT28 67 aa16.85■□□□□ 0.29
USP21-201ENST00000289865 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP16.85■□□□□ 0.29
USP21-201ENST00000289865 TIPARPQ7Z3E1 657 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
USP21-201ENST00000289865 GGNQ86UU5 652 aa16.85■□□□□ 0.29
USP21-201ENST00000289865 HOGA1Q86XE5 327 aa16.85■□□□□ 0.29
USP21-201ENST00000289865 KCNE4Q8WWG9 221 aa16.85■□□□□ 0.29
USP21-201ENST00000289865 PIGTQ969N2 578 aa16.85■□□□□ 0.29
USP21-201ENST00000289865 FAHD2AQ96GK7 314 aa16.85■□□□□ 0.29
USP21-201ENST00000289865 CXorf58Q96LI9 332 aa16.85■□□□□ 0.29
USP21-201ENST00000289865 COMMD9Q9P000 198 aa16.85■□□□□ 0.29
USP21-201ENST00000289865 CCDC187A0A096LP49 1063 aa16.85■□□□□ 0.29
USP21-201ENST00000289865 LRRC3CA6NJW4 275 aa16.85■□□□□ 0.29
USP21-201ENST00000289865 CXCL13O43927 109 aa16.85■□□□□ 0.29
USP21-201ENST00000289865 HPP00738 406 aa16.85■□□□□ 0.29
USP21-201ENST00000289865 APOC1P02654 83 aa16.85■□□□□ 0.29
USP21-201ENST00000289865 MPGP29372 298 aa16.85■□□□□ 0.29
USP21-201ENST00000289865 STARP49675 285 aa16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.6 ms