RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284957.9

RABGEF1-201, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF610Q8N9Z0 462 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 TRIM63Q969Q1 353 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 SPSB4Q96A44 273 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 CHST5Q9GZS9 411 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 PLSCR3Q9NRY6 295 aa8.1□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 FIGNL2A6NMB9 653 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 CDK2P24941 298 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 PTH2RP49190 550 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 PER3P56645 1201 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 RAB40AQ8WXH6 277 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 SORCS2Q96PQ0 1159 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 ITPR1Q14643 2758 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 DHRS7CA6NNS2 312 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 SCO1O75880 301 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 NGFP01138 241 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 ARSBP15848 533 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 PTGER4P35408 488 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 THBS4P35443 961 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 RFX2P48378 723 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 NDUFA5Q16718 116 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 OR10K2Q6IF99 312 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF101Q8IZC7 436 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 BOD1Q96IK1 185 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 ZFP3Q96NJ6 502 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 UQCC2Q9BRT2 126 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 ASF1BQ9NVP2 202 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 SPTA1P02549 2419 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 CIB4A0PJX0 185 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 CTAG2O75638 210 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 SERPINA5P05154 406 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 CELA3BP08861 270 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 TIMP3P35625 211 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 QRFPP83859 136 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 TGFBR3Q03167 851 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 SCN1BQ07699 218 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 OR8B8Q15620 311 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 DPPA2Q7Z7J5 298 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 DOLPP1Q86YN1 238 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 PP6455Q8WZ26 134 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 C10orf35Q96D05 121 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 RGCCQ9H4X1 137 aa8.09□□□□□ -1.11
RABGEF1-201ENST00000284957 KDM4BO94953 1096 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 ALX3O95076 343 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 PTTG1O95997 202 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 ALDOBP05062 364 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 PTHLHP12272 177 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 WNT5AP41221 380 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 GSK3AP49840 483 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 MMP15P51511 669 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 DGCR2P98153 550 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 ASAH1Q13510 395 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 CCDC54Q8NEL0 328 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 SETD6Q8TBK2 473 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 SP140LQ9H930 580 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 ZNF391Q9UJN7 358 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 TUBD1Q9UJT1 453 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 RELNP78509 3460 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 PRF1P14222 555 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 PLP2Q04941 152 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 UNC119Q13432 240 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM42Q69YG0 159 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 MTFR2Q6P444 385 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 NRARPQ7Z6K4 114 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 WDR31Q8NA23 367 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 NPRL2Q8WTW4 380 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 YIPF5Q969M3 257 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 POFUT1Q9H488 388 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 PROCRQ9UNN8 238 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 CTDSPLO15194 276 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 XRCC2O43543 280 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 CRHP06850 196 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 GLI4P10075 376 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 OR3A4PP47883 348 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 DEFA1P59665 94 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 DEFA3P59666 94 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM69Q5SWH9 247 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 ANGPTL5Q86XS5 388 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 MINDY2Q8NBR6 621 aa8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM246Q9BRR3 403 aa8.08□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.6 ms