RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259365.8

TMOD1-201, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD1, Length 3,343 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-201ENST00000259365 GPR173Q9NS66 373 aa11.86□□□□□ -0.51
TMOD1-201ENST00000259365 HSPB6O14558 160 aa11.86□□□□□ -0.51
TMOD1-201ENST00000259365 EFNA2O43921 213 aa11.86□□□□□ -0.51
TMOD1-201ENST00000259365 SSX5O60225 188 aa11.86□□□□□ -0.51
TMOD1-201ENST00000259365 IGHG1P01857 330 aa11.86□□□□□ -0.51
TMOD1-201ENST00000259365 CRHP06850 196 aa11.86□□□□□ -0.51
TMOD1-201ENST00000259365 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
TMOD1-201ENST00000259365 GLULP15104 373 aa11.86□□□□□ -0.51
TMOD1-201ENST00000259365 OMGP23515 440 aa11.86□□□□□ -0.51
TMOD1-201ENST00000259365 MPPED2Q15777 294 aa11.86□□□□□ -0.51
TMOD1-201ENST00000259365 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa11.86□□□□□ -0.51
TMOD1-201ENST00000259365 KRBOX4Q5JUW0 171 aa11.86□□□□□ -0.51
TMOD1-201ENST00000259365 LDLRAD3Q86YD5 345 aa11.86□□□□□ -0.51
TMOD1-201ENST00000259365 RPS4Y2Q8TD47 263 aa11.86□□□□□ -0.51
TMOD1-201ENST00000259365 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
TMOD1-201ENST00000259365 TMEM218A2RU14 115 aa11.86□□□□□ -0.51
TMOD1-201ENST00000259365 H0YIZ8 118 aa11.86□□□□□ -0.51
TMOD1-201ENST00000259365 SCRG1O75711 98 aa11.86□□□□□ -0.51
TMOD1-201ENST00000259365 CSTBP04080 98 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
TMOD1-201ENST00000259365 CD27P26842 260 aa11.86□□□□□ -0.51
TMOD1-201ENST00000259365 PDZK1IP1Q13113 114 aa11.86□□□□□ -0.51
TMOD1-201ENST00000259365 OR2A2Q6IF42 318 aa11.86□□□□□ -0.51
TMOD1-201ENST00000259365 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
TMOD1-201ENST00000259365 SVBPQ8N300 66 aa11.86□□□□□ -0.51
TMOD1-201ENST00000259365 SUMF1Q8NBK3 374 aa11.86□□□□□ -0.51
TMOD1-201ENST00000259365 OR10S1Q8NGN2 331 aa11.86□□□□□ -0.51
TMOD1-201ENST00000259365 MITD1Q8WV92 249 aa11.86□□□□□ -0.51
TMOD1-201ENST00000259365 GPHA2Q96T91 129 aa11.86□□□□□ -0.51
TMOD1-201ENST00000259365 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
TMOD1-201ENST00000259365 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
TMOD1-201ENST00000259365 SLCO5A1Q9H2Y9 848 aa11.86□□□□□ -0.51
TMOD1-201ENST00000259365 FN3KRPQ9HA64 309 aa11.86□□□□□ -0.51
TMOD1-201ENST00000259365 GLS2Q9UI32 602 aa11.86□□□□□ -0.51
TMOD1-201ENST00000259365 LMO7DNF2Z398 122 aa11.85□□□□□ -0.51
TMOD1-201ENST00000259365 NME2P1O60361 137 aa11.85□□□□□ -0.51
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF806P0C7X5 589 aa11.85□□□□□ -0.51
TMOD1-201ENST00000259365 GABRA4P48169 554 aa11.85□□□□□ -0.51
TMOD1-201ENST00000259365 CCR5P51681 352 aa11.85□□□□□ -0.51
TMOD1-201ENST00000259365 ANKRD55Q3KP44 614 aa11.85□□□□□ -0.51
TMOD1-201ENST00000259365 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
TMOD1-201ENST00000259365 CD300LFQ8TDQ1 290 aa11.85□□□□□ -0.51
TMOD1-201ENST00000259365 LIPHQ8WWY8 451 aa11.85□□□□□ -0.51
TMOD1-201ENST00000259365 MRGPRFQ96AM1 343 aa11.85□□□□□ -0.51
TMOD1-201ENST00000259365 RPS10P5Q9NQ39 176 aa11.85□□□□□ -0.51
TMOD1-201ENST00000259365 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
TMOD1-201ENST00000259365 TUBAL3A6NHL2 446 aa11.85□□□□□ -0.51
TMOD1-201ENST00000259365 OR6C65A6NJZ3 312 aa11.85□□□□□ -0.51
TMOD1-201ENST00000259365 HNF4GQ14541 408 aa11.85□□□□□ -0.51
TMOD1-201ENST00000259365 FAM166AQ6J272 317 aa11.85□□□□□ -0.51
TMOD1-201ENST00000259365 PGAP1Q75T13 922 aa11.85□□□□□ -0.51
TMOD1-201ENST00000259365 NKAIN3Q8N8D7 197 aa11.85□□□□□ -0.51
TMOD1-201ENST00000259365 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa11.85□□□□□ -0.51
TMOD1-201ENST00000259365 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa11.85□□□□□ -0.51
TMOD1-201ENST00000259365 FAM131CQ96AQ9 280 aa11.85□□□□□ -0.51
TMOD1-201ENST00000259365 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
TMOD1-201ENST00000259365 LPAR5Q9H1C0 372 aa11.85□□□□□ -0.51
TMOD1-201ENST00000259365 OR10A2Q9H208 303 aa11.85□□□□□ -0.51
TMOD1-201ENST00000259365 PIGMQ9H3S5 423 aa11.85□□□□□ -0.51
TMOD1-201ENST00000259365 PARPBPQ9NWS1 579 aa11.85□□□□□ -0.51
TMOD1-201ENST00000259365 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
TMOD1-201ENST00000259365 PIGLQ9Y2B2 252 aa11.85□□□□□ -0.51
TMOD1-201ENST00000259365 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa11.85□□□□□ -0.51
TMOD1-201ENST00000259365 ICE1Q9Y2F5 2266 aa11.85□□□□□ -0.51
TMOD1-201ENST00000259365 DMDP11532 3685 aa11.85□□□□□ -0.51
TMOD1-201ENST00000259365 JMJD7P0C870 316 aa11.85□□□□□ -0.51
TMOD1-201ENST00000259365 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
TMOD1-201ENST00000259365 KCNG3Q8TAE7 436 aa11.85□□□□□ -0.51
TMOD1-201ENST00000259365 RNF133Q8WVZ7 376 aa11.85□□□□□ -0.51
TMOD1-201ENST00000259365 AQP3Q92482 292 aa11.85□□□□□ -0.51
TMOD1-201ENST00000259365 ISOC2Q96AB3 205 aa11.85□□□□□ -0.51
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
TMOD1-201ENST00000259365 C5orf66Q9H5L9 145 aa11.85□□□□□ -0.51
TMOD1-201ENST00000259365 FAM206AQ9NX38 181 aa11.85□□□□□ -0.51
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF581Q9P0T4 197 aa11.85□□□□□ -0.51
TMOD1-201ENST00000259365 LHFPL6Q9Y693 200 aa11.85□□□□□ -0.51
TMOD1-201ENST00000259365 A0A0A6YYD4 124 aa11.84□□□□□ -0.51
TMOD1-201ENST00000259365 CDC14BO60729 498 aa11.84□□□□□ -0.51
TMOD1-201ENST00000259365 TMEM50BP56557 158 aa11.84□□□□□ -0.51
TMOD1-201ENST00000259365 RNF141Q8WVD5 230 aa11.84□□□□□ -0.51
TMOD1-201ENST00000259365 AKR1E2Q96JD6 320 aa11.84□□□□□ -0.51
TMOD1-201ENST00000259365 UCN2Q96RP3 112 aa11.84□□□□□ -0.51
TMOD1-201ENST00000259365 KCNK17Q96T54 332 aa11.84□□□□□ -0.51
TMOD1-201ENST00000259365 FAAP24Q9BTP7 215 aa11.84□□□□□ -0.51
TMOD1-201ENST00000259365 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
TMOD1-201ENST00000259365 TO15178 435 aa11.84□□□□□ -0.51
TMOD1-201ENST00000259365 C1QL1O75973 258 aa11.84□□□□□ -0.51
TMOD1-201ENST00000259365 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
TMOD1-201ENST00000259365 GLAP06280 429 aa11.84□□□□□ -0.51
TMOD1-201ENST00000259365 MTCP1P56278 107 aa11.84□□□□□ -0.51
TMOD1-201ENST00000259365 SMCO1Q147U7 214 aa11.84□□□□□ -0.51
TMOD1-201ENST00000259365 ABCA11PQ4W5N1 156 aa11.84□□□□□ -0.51
TMOD1-201ENST00000259365 TMEM128Q5BJH2 165 aa11.84□□□□□ -0.51
TMOD1-201ENST00000259365 PLXDC2Q6UX71 529 aa11.84□□□□□ -0.51
TMOD1-201ENST00000259365 BLACEA4D250 179 aa11.83□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 LIPT2A6NK58 231 aa11.83□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 E9PLN8 166 aa11.83□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 TRAPPC6AO75865 159 aa11.83□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 S100A6P06703 90 aa11.83□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 RD3LP0DJH9 198 aa11.83□□□□□ -0.52
TMOD1-201ENST00000259365 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.4 ms