RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 RAB12Q6IQ22 244 aa23.2■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 FAHD2AQ96GK7 314 aa23.2■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 KLHDC3Q9BQ90 382 aa23.2■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 KCNG2Q9UJ96 466 aa23.2■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 RAB6AP20340 208 aa23.19■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 CCR4P51679 360 aa23.19■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 CD226Q15762 336 aa23.19■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 KTI12Q96EK9 354 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 B9D1Q9UPM9 204 aa23.19■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa23.18■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 GMFGO60234 142 aa23.18■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 TACR3P29371 465 aa23.18■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 ZDHHC22Q8N966 263 aa23.18■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF563Q8TA94 476 aa23.18■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 LRRC46Q96FV0 321 aa23.18■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 WIF1Q9Y5W5 379 aa23.18■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 H7C1C5 153 aa23.18■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF735P0CB33 412 aa23.18■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 RIDAP52758 137 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 LCN6P62502 163 aa23.18■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 DHRS2Q13268 280 aa23.18■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 HYAL4Q2M3T9 481 aa23.18■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP23.18■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa23.18■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 NKAIN3Q8N8D7 197 aa23.18■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 ASB5Q8WWX0 329 aa23.18■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 TAAR8Q969N4 342 aa23.18■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa23.18■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa23.18■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 HEATR5AQ86XA9 2040 aa23.17■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 OR14I1A6ND48 311 aa23.17■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 NUDT19A8MXV4 375 aa23.17■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 LDLRAD4O15165 306 aa23.17■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 OR6A2O95222 327 aa23.17■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 BGLAPP02818 100 aa23.17■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 CATSPERDQ86XM0 798 aa23.17■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 BPIFB2Q8N4F0 458 aa23.17■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 ZBTB8AQ96BR9 441 aa23.17■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM41AQ96HV5 264 aa23.17■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM185BQ9H7F4 350 aa23.17■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP23.17■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 KCNK7Q9Y2U2 307 aa23.17■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 PRSS37A4D1T9 235 aa23.16■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 MEIS3P1A6NDR6 274 aa23.16■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 ANKUB1A6NFN9 424 aa23.16■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 EDN3P14138 238 aa23.16■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 C1orf100Q5SVJ3 147 aa23.16■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 GFRALQ6UXV0 394 aa23.16■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF627Q7L945 461 aa23.16■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 TMED4Q7Z7H5 227 aa23.16■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC25A42Q86VD7 318 aa23.16■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa23.16■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 SCGNO76038 276 aa23.16■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 HLA-DQA2P01906 255 aa23.16■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 CXCR1P25024 350 aa23.16■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 RPL27P61353 136 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 SGCBQ16585 318 aa23.16■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 ODF4Q2M2E3 257 aa23.16■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 PDSS1Q5T2R2 415 aa23.16■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 ST6GALNAC3Q8NDV1 305 aa23.16■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 AMELYQ99218 206 aa23.16■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP23.16■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 PDCD10Q9BUL8 212 aa23.16■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa23.16■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 PCNX1Q96RV3 2341 aa23.16■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 MYO7BQ6PIF6 2116 aa23.15■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 J3QKU1 62 aa23.15■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 OIP5O43482 229 aa23.15■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 IL2RAP01589 272 aa23.15■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 ISG15P05161 165 aa23.15■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 GDF1P27539 372 aa23.15■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 PMPCAQ10713 525 aa23.15■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 GLYATL3Q5SZD4 288 aa23.15■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 CBLN3Q6UW01 205 aa23.15■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 LYG2Q86SG7 212 aa23.15■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF584Q8IVC4 421 aa23.15■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 OR1J2Q8NGS2 313 aa23.15■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 MARC2Q969Z3 335 aa23.15■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 NPAS1Q99742 590 aa23.15■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 TBL1XR1Q9BZK7 514 aa23.15■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 METTL21EPA6NDL7 271 aa23.14■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 IGHMP01871 453 aa23.14■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 H2AFB1P0C5Y9 115 aa23.14■■□□□ 1.3
CAPNS1-201ENST00000246533 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.3
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