RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216416.8

CNIH1-201, Transcript of cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNIH1, Length 4,793 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF83P51522 516 aa5.7□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 OXA1LQ15070 435 aa5.7□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 SIAH3Q8IW03 269 aa5.7□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa5.7□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 PNPLA2Q96AD5 504 aa5.7□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 OR2J1Q9GZK6 312 aa5.7□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 SP140LQ9H930 580 aa5.7□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 NEK6Q9HC98 313 aa5.7□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 MSL2Q9HCI7 577 aa5.7□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 NPIPB13A6NJU9 1138 aa5.7□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 NPIPB4C9JG80 1138 aa5.7□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 SMLR1H3BR10 107 aa5.7□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 M0QYG6 137 aa5.7□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP5.7□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 TMEM225BP0DP42 221 aa5.7□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 GABRR1P24046 479 aa5.7□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 GIFP27352 417 aa5.7□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 GRNP28799 593 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 ETV6P41212 452 aa5.7□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 WNT5AP41221 380 aa5.7□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 PITPNBP48739 271 aa5.7□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 NKAPLQ5M9Q1 402 aa5.7□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 TMEM244Q5VVB8 128 aa5.7□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 IGFL2Q6UWQ7 119 aa5.7□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 LIX1LQ8IVB5 337 aa5.7□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 OR1M1Q8NGA1 313 aa5.7□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 MED18Q9BUE0 208 aa5.7□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 DUSP13Q9UII6 198 aa5.7□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa5.7□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 MTORP42345 2549 aa5.69□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 TENM4Q6N022 2769 aa5.69□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 A0A0B4J293 547 aa5.69□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 FAM240BA0A1B0GVZ2 78 aa5.69□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 FUOMA2VDF0 154 aa5.69□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 ORC5O43913 435 aa5.69□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 ACTL6AO96019 429 aa5.69□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 VSIG8P0DPA2 414 aa5.69□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 MTCP1P56278 107 aa5.69□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 CBX3Q13185 183 aa5.69□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 FAM205BPQ63HN1 556 aa5.69□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 GFRALQ6UXV0 394 aa5.69□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 Q6ZNX1 250 aa5.69□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 C17orf107Q6ZR85 190 aa5.69□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 OR14K1Q8NGZ2 314 aa5.69□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa5.69□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 HPS1Q92902 700 aa5.69□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa5.69□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 PHYHO14832 338 aa5.69□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 PTH2RP49190 550 aa5.69□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 LSM6P62312 80 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 RIN1Q13671 783 aa5.69□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 KISS1Q15726 138 aa5.69□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 TFAP2EQ6VUC0 442 aa5.69□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 UXS1Q8NBZ7 420 aa5.69□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 YIPF5Q969M3 257 aa5.69□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 SARAFQ96BY9 339 aa5.69□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 BCO1Q9HAY6 547 aa5.69□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 UFSP2Q9NUQ7 469 aa5.69□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 PARPBPQ9NWS1 579 aa5.69□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 EMC3Q9P0I2 261 aa5.69□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa5.69□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 TNFSF13O75888 250 aa5.69□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 CA6P23280 308 aa5.69□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 BDKRB2P30411 391 aa5.69□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 CCR9P51686 369 aa5.69□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 RAB11BQ15907 218 aa5.69□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 GSG1Q2KHT4 349 aa5.69□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 MZT2AQ6P582 158 aa5.69□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 FAM180AQ6UWF9 173 aa5.69□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 MOB3CQ70IA8 216 aa5.69□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 OR5D14Q8NGL3 314 aa5.69□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 OR56B4Q8NH76 319 aa5.69□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 RPS4Y2Q8TD47 263 aa5.69□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 STARD4Q96DR4 205 aa5.69□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 NUDT15Q9NV35 164 aa5.69□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 CLCF1Q9UBD9 225 aa5.69□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 BOLA1Q9Y3E2 137 aa5.69□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 WDR1O75083 606 aa5.68□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 CEACAM4O75871 244 aa5.68□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 CPN1P15169 458 aa5.68□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 CRYGSP22914 178 aa5.68□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 GDNFP39905 211 aa5.68□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 GPM6AP51674 278 aa5.68□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 ART1P52961 327 aa5.68□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 TPTEP56180 551 aa5.68□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 TAS2R20P59543 309 aa5.68□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 FAM3AP98173 230 aa5.68□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 GPR176Q14439 515 aa5.68□□□□□ -1.5
CNIH1-201ENST00000216416 PIGYQ3MUY2 71 aa5.68□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.9 ms