RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000624145.3

ANKRD28-215, Transcript of ankyrin repeat domain 28, human

TSL 2 BASIC

Gene ANKRD28, Length 6,383 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ANKRD28-215	ENST00000624145	NSMCE1	Q8WV22	266 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145		A0A1B0GUA9	196 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	BICDL2	A1A5D9	508 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	DAPK3	O43293	454 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	AFM	P43652	599 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	ARID5A	Q03989	594 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	FLII	Q13045	1269 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	TAOK1	Q7L7X3	1001 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	ARHGAP24	Q8N264	748 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	ZEB2	O60315	1214 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	STX10	O60499	249 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	PTGS1	P23219	599 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	CCT6A	P40227	531 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	GNAQ	P50148	359 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	VAV2	P52735	878 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	TSNAXIP1	Q2TAA8	658 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	PHLDB2	Q86SQ0	1253 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	CCDC125	Q86Z20	511 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	UBLCP1	Q8WVY7	318 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	EVI5L	Q96CN4	794 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	KRT23	Q9C075	422 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	ZHX1	Q9UKY1	873 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	TUBB4A	P04350	444 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	WTAP	Q15007	396 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	CCDC62	Q6P9F0	684 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	IFT81	Q8WYA0	676 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	KIFAP3	Q92845	792 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	TSGA10	Q9BZW7	698 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	STX8	Q9UNK0	236 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	MCM7	P33993	719 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	MCUR1	Q96AQ8	359 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	CCDC42	Q96M95	316 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	BACH2	Q9BYV9	841 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	NOD1	Q9Y239	953 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	NAPA	P54920	295 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	IRX3	P78415	501 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	CDR2	Q01850	454 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	WDR44	Q5JSH3	913 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	ANKLE2	Q86XL3	938 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	CCDC26	Q8TAB7	109 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	NACA2	Q9H009	215 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	TSPYL2	Q9H2G4	693 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	CABP1	Q9NZU7	370 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	BCAP29	Q9UHQ4	241 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	DNAI1	Q9UI46	699 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	PPME1	Q9Y570	386 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	NAA16	Q6N069	864 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	OGFOD1	Q8N543	542 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	FAM76A	Q8TAV0	307 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	CAPZA3	Q96KX2	299 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	PPP1R12C	Q9BZL4	782 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	VPS18	Q9P253	973 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	PPAN-P2RY11	A0A0B4J1V8	794 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	KRT5	P13647	590 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	NFE2L2	Q16236	605 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	AKNAD1	Q5T1N1	836 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	KRT79	Q5XKE5	535 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	PPAN	Q9NQ55	473 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	KRT3	P12035	628 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	ZNF131	P52739	623 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	PPP2R5C	Q13362	524 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	TMTC2	Q8N394	836 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	KCNG4	Q8TDN1	519 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	CCDC94	Q9BW85	323 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	SUDS3	Q9H7L9	328 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	CNNM2	Q9H8M5	875 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	TFIP11	Q9UBB9	837 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145		I3L4J1	428 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	BUB1B	O60566	1050 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	SMIM24	O75264	130 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	XRCC6	P12956	609 aa	Known RBP eCLIP	4.54	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	UBE2H	P62256	183 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	IRX5	P78411	483 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	NBPF6	Q5VWK0	638 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	C10orf67	Q8IYJ2	551 aa		4.54	□□□□□ -1.68
ANKRD28-215	ENST00000624145	ARHGEF2	Q92974	986 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68

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