RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621665.1

GRAMD4P3-201, Transcript of GRAM domain containing 4 pseudogene 3, humanhuman

BASIC

Gene GRAMD4P3, Length 1,669 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4P3-201ENST00000621665 CREBZFQ9NS37 354 aa20.19■□□□□ 0.82
GRAMD4P3-201ENST00000621665 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
GRAMD4P3-201ENST00000621665 TAF5LO75529 589 aa20.19■□□□□ 0.82
GRAMD4P3-201ENST00000621665 TRIM27P14373 513 aa20.19■□□□□ 0.82
GRAMD4P3-201ENST00000621665 PASKQ96RG2 1323 aa20.19■□□□□ 0.82
GRAMD4P3-201ENST00000621665 PLIN1O60240 522 aa20.18■□□□□ 0.82
GRAMD4P3-201ENST00000621665 MS4A1P11836 297 aa20.18■□□□□ 0.82
GRAMD4P3-201ENST00000621665 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
GRAMD4P3-201ENST00000621665 OGFOD1Q8N543 542 aa20.18■□□□□ 0.82
GRAMD4P3-201ENST00000621665 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
GRAMD4P3-201ENST00000621665 METTL24Q5JXM2 366 aa20.17■□□□□ 0.82
GRAMD4P3-201ENST00000621665 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
GRAMD4P3-201ENST00000621665 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
GRAMD4P3-201ENST00000621665 PGAP2Q9UHJ9 254 aa20.17■□□□□ 0.82
GRAMD4P3-201ENST00000621665 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa20.17■□□□□ 0.82
GRAMD4P3-201ENST00000621665 PSME4Q14997 1843 aa20.17■□□□□ 0.82
GRAMD4P3-201ENST00000621665 USP17L8P0C7I0 530 aa20.16■□□□□ 0.82
GRAMD4P3-201ENST00000621665 TTLL5Q6EMB2 1281 aa20.16■□□□□ 0.82
GRAMD4P3-201ENST00000621665 CD209Q9NNX6 404 aa20.16■□□□□ 0.82
GRAMD4P3-201ENST00000621665 KCNQ5Q9NR82 932 aa20.16■□□□□ 0.82
GRAMD4P3-201ENST00000621665 TMEM88BA6NKF7 163 aa20.16■□□□□ 0.82
GRAMD4P3-201ENST00000621665 KCNA4P22459 653 aa20.16■□□□□ 0.82
GRAMD4P3-201ENST00000621665 CDC37L1Q7L3B6 337 aa20.16■□□□□ 0.82
GRAMD4P3-201ENST00000621665 FBXW7Q969H0 707 aa20.16■□□□□ 0.82
GRAMD4P3-201ENST00000621665 HDAC9Q9UKV0 1011 aa20.16■□□□□ 0.82
GRAMD4P3-201ENST00000621665 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
GRAMD4P3-201ENST00000621665 PDE8BO95263 885 aa20.14■□□□□ 0.81
GRAMD4P3-201ENST00000621665 IL1R1P14778 569 aa20.14■□□□□ 0.81
GRAMD4P3-201ENST00000621665 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
GRAMD4P3-201ENST00000621665 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa20.14■□□□□ 0.81
GRAMD4P3-201ENST00000621665 CAVIN4Q5BKX8 364 aa20.14■□□□□ 0.81
GRAMD4P3-201ENST00000621665 DACT2Q5SW24 774 aa20.14■□□□□ 0.81
GRAMD4P3-201ENST00000621665 TXNRD3Q86VQ6 643 aa20.14■□□□□ 0.81
GRAMD4P3-201ENST00000621665 KLRG1Q96E93 195 aa20.14■□□□□ 0.81
GRAMD4P3-201ENST00000621665 MEIS3Q99687 375 aa20.14■□□□□ 0.81
GRAMD4P3-201ENST00000621665 SCN9AQ15858 1988 aa20.14■□□□□ 0.81
GRAMD4P3-201ENST00000621665 A0A1B0GUL6 1792 aa20.14■□□□□ 0.81
GRAMD4P3-201ENST00000621665 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
GRAMD4P3-201ENST00000621665 EYA2O00167 538 aa20.13■□□□□ 0.81
GRAMD4P3-201ENST00000621665 CIAO1O76071 339 aa20.13■□□□□ 0.81
GRAMD4P3-201ENST00000621665 GNAI2P04899 355 aa20.13■□□□□ 0.81
GRAMD4P3-201ENST00000621665 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
GRAMD4P3-201ENST00000621665 VPS37DQ86XT2 251 aa20.13■□□□□ 0.81
GRAMD4P3-201ENST00000621665 CLUAP1Q96AJ1 413 aa20.13■□□□□ 0.81
GRAMD4P3-201ENST00000621665 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
GRAMD4P3-201ENST00000621665 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
GRAMD4P3-201ENST00000621665 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
GRAMD4P3-201ENST00000621665 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
GRAMD4P3-201ENST00000621665 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
GRAMD4P3-201ENST00000621665 SAMD7Q7Z3H4 446 aa20.13■□□□□ 0.81
GRAMD4P3-201ENST00000621665 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
GRAMD4P3-201ENST00000621665 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa20.13■□□□□ 0.81
GRAMD4P3-201ENST00000621665 TRPM4Q8TD43 1214 aa20.13■□□□□ 0.81
GRAMD4P3-201ENST00000621665 GMLQ99445 158 aa20.13■□□□□ 0.81
GRAMD4P3-201ENST00000621665 GTF2IP78347 998 aa20.12■□□□□ 0.81
GRAMD4P3-201ENST00000621665 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
GRAMD4P3-201ENST00000621665 IRS2Q9Y4H2 1338 aa20.11■□□□□ 0.81
GRAMD4P3-201ENST00000621665 KLRK1P26718 216 aa20.11■□□□□ 0.81
GRAMD4P3-201ENST00000621665 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
GRAMD4P3-201ENST00000621665 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
GRAMD4P3-201ENST00000621665 LRRC24Q50LG9 513 aa20.11■□□□□ 0.81
GRAMD4P3-201ENST00000621665 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
GRAMD4P3-201ENST00000621665 MYOZ2Q9NPC6 264 aa20.11■□□□□ 0.81
GRAMD4P3-201ENST00000621665 SASH1O94885 1247 aa20.1■□□□□ 0.81
GRAMD4P3-201ENST00000621665 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
GRAMD4P3-201ENST00000621665 MTX1Q13505 466 aa20.1■□□□□ 0.81
GRAMD4P3-201ENST00000621665 IL15P40933 162 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
GRAMD4P3-201ENST00000621665 TMEM57Q8N5G2 664 aa20.1■□□□□ 0.81
GRAMD4P3-201ENST00000621665 COPRSQ9NQ92 184 aa20.1■□□□□ 0.81
GRAMD4P3-201ENST00000621665 CEP126Q9P2H0 1117 aa20.1■□□□□ 0.81
GRAMD4P3-201ENST00000621665 SLC5A1P13866 664 aa20.09■□□□□ 0.81
GRAMD4P3-201ENST00000621665 SULF1Q8IWU6 871 aa20.09■□□□□ 0.81
GRAMD4P3-201ENST00000621665 SHTN1A0MZ66 631 aa20.08■□□□□ 0.81
GRAMD4P3-201ENST00000621665 SNAP23O00161 211 aa20.08■□□□□ 0.81
GRAMD4P3-201ENST00000621665 SRGAP3O43295 1099 aa20.08■□□□□ 0.81
GRAMD4P3-201ENST00000621665 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
GRAMD4P3-201ENST00000621665 HTRA3P83110 453 aa20.08■□□□□ 0.81
GRAMD4P3-201ENST00000621665 VGLL2Q8N8G2 317 aa20.08■□□□□ 0.81
GRAMD4P3-201ENST00000621665 KLHDC4Q8TBB5 520 aa20.08■□□□□ 0.81
GRAMD4P3-201ENST00000621665 LPIN2Q92539 896 aa20.08■□□□□ 0.81
GRAMD4P3-201ENST00000621665 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
GRAMD4P3-201ENST00000621665 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa20.08■□□□□ 0.8
GRAMD4P3-201ENST00000621665 KRT26Q7Z3Y9 468 aa20.07■□□□□ 0.8
GRAMD4P3-201ENST00000621665 ITPRIPQ8IWB1 547 aa20.07■□□□□ 0.8
GRAMD4P3-201ENST00000621665 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
GRAMD4P3-201ENST00000621665 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
GRAMD4P3-201ENST00000621665 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
GRAMD4P3-201ENST00000621665 FAM205AQ6ZU69 1335 aa20.07■□□□□ 0.8
GRAMD4P3-201ENST00000621665 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
GRAMD4P3-201ENST00000621665 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa20.07■□□□□ 0.8
GRAMD4P3-201ENST00000621665 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
GRAMD4P3-201ENST00000621665 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
GRAMD4P3-201ENST00000621665 GYG1P46976 350 aa20.06■□□□□ 0.8
GRAMD4P3-201ENST00000621665 SCARF1Q14162 830 aa20.06■□□□□ 0.8
GRAMD4P3-201ENST00000621665 FBXO33Q7Z6M2 555 aa20.06■□□□□ 0.8
GRAMD4P3-201ENST00000621665 KIAA0825Q8IV33 1275 aa20.06■□□□□ 0.8
GRAMD4P3-201ENST00000621665 JMYQ8N9B5 988 aa20.06■□□□□ 0.8
GRAMD4P3-201ENST00000621665 SIL1Q9H173 461 aa20.06■□□□□ 0.8
GRAMD4P3-201ENST00000621665 RCAN3Q9UKA8 241 aa20.06■□□□□ 0.8
GRAMD4P3-201ENST00000621665 TRPM7Q96QT4 1865 aa20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 91.6 ms