RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000606714.5

TRAM2-AS1-204, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 2,453 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ATP2B3Q16720 1220 aa25.73■■□□□ 1.71
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 GIMAP6Q6P9H5 292 aa25.73■■□□□ 1.71
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FBXO3Q9UK99 471 aa25.73■■□□□ 1.71
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa25.73■■□□□ 1.71
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa25.72■■□□□ 1.71
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FAM177BA6PVY3 158 aa25.72■■□□□ 1.71
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TRAM2-AS1-204ENST00000606714 HAND2P61296 217 aa25.72■■□□□ 1.71
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CCT2P78371 535 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CDHR2Q9BYE9 1310 aa25.71■■□□□ 1.71
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RIC1Q4ADV7 1423 aa25.71■■□□□ 1.71
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ACSBG1Q96GR2 724 aa25.71■■□□□ 1.71
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
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TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ITGB4P16144 1822 aa25.69■■□□□ 1.7
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TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FAM184AQ8NB25 1140 aa25.69■■□□□ 1.7
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MCAMP43121 646 aa25.69■■□□□ 1.7
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FOXP2O15409 715 aa25.68■■□□□ 1.7
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PFKFB2O60825 505 aa25.68■■□□□ 1.7
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
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TRAM2-AS1-204ENST00000606714 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
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TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PDE8AO60658 829 aa25.65■■□□□ 1.7
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CTDNEP1O95476 244 aa25.65■■□□□ 1.7
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP25.65■■□□□ 1.7
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP25.65■■□□□ 1.7
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TICAM2Q86XR7 235 aa25.65■■□□□ 1.7
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 LRP6O75581 1613 aa25.65■■□□□ 1.7
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PTPDC1A2A3K4 754 aa25.65■■□□□ 1.7
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FGAP02671 866 aa25.65■■□□□ 1.7
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TRAM2-AS1-204ENST00000606714 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
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TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CAMK4Q16566 473 aa25.64■■□□□ 1.69
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 VGLL2Q8N8G2 317 aa25.64■■□□□ 1.69
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TRAM2-AS1-204ENST00000606714 DDB1Q16531 1140 aa25.63■■□□□ 1.69
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TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ERVV-1B6SEH8 477 aa25.63■■□□□ 1.69
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TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa25.63■■□□□ 1.69
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PDE8BO95263 885 aa25.62■■□□□ 1.69
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TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 HS1BP3Q53T59 392 aa25.62■■□□□ 1.69
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ZNF34Q8IZ26 560 aa25.62■■□□□ 1.69
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 AGXT2Q9BYV1 514 aa25.62■■□□□ 1.69
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CTNNA3Q9UI47 895 aa25.62■■□□□ 1.69
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SNAP23O00161 211 aa25.62■■□□□ 1.69
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 IDH1O75874 414 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ATP6V1AP38606 617 aa25.62■■□□□ 1.69
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PHKA1P46020 1223 aa25.62■■□□□ 1.69
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MPNDQ8N594 471 aa25.62■■□□□ 1.69
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ELP1O95163 1332 aa25.62■■□□□ 1.69
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa25.61■■□□□ 1.69
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SUSD4Q5VX71 490 aa25.61■■□□□ 1.69
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 TERF1P54274 439 aa25.61■■□□□ 1.69
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 FUCA2Q9BTY2 467 aa25.61■■□□□ 1.69
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 GUCY1B3Q02153 619 aa25.6■■□□□ 1.69
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP25.6■■□□□ 1.69
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CRKLP46109 303 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CCDC102BQ68D86 513 aa25.6■■□□□ 1.69
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa25.6■■□□□ 1.69
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SPEF2Q9C093 1822 aa25.6■■□□□ 1.69
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PTMAP06454 111 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 EIF5P55010 431 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 DACT1Q9NYF0 836 aa25.59■■□□□ 1.69
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 CCDC87Q9NVE4 849 aa25.59■■□□□ 1.69
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa25.58■■□□□ 1.69
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 PLCB2Q00722 1185 aa25.58■■□□□ 1.69
TRAM2-AS1-204ENST00000606714 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
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