RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587373.1

RDH13-208, Transcript of retinol dehydrogenase 13, humanhuman

TSL 2

Gene RDH13, Length 722 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH13-208ENST00000587373 UBE2Q2LH0YL09 131 aa14.7□□□□□ -0.06
RDH13-208ENST00000587373 GPR25O00155 361 aa14.7□□□□□ -0.06
RDH13-208ENST00000587373 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
RDH13-208ENST00000587373 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
RDH13-208ENST00000587373 CCDC152Q4G0S7 254 aa14.7□□□□□ -0.06
RDH13-208ENST00000587373 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
RDH13-208ENST00000587373 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
RDH13-208ENST00000587373 USP17L1Q7RTZ2 530 aa14.7□□□□□ -0.06
RDH13-208ENST00000587373 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
RDH13-208ENST00000587373 GCC1Q96CN9 775 aa14.7□□□□□ -0.06
RDH13-208ENST00000587373 GMLQ99445 158 aa14.7□□□□□ -0.06
RDH13-208ENST00000587373 HYPKQ9NX55 129 aa14.7□□□□□ -0.06
RDH13-208ENST00000587373 XDHP47989 1333 aa14.69□□□□□ -0.06
RDH13-208ENST00000587373 CACNA1FO60840 1977 aa14.69□□□□□ -0.06
RDH13-208ENST00000587373 SPEF2Q9C093 1822 aa14.69□□□□□ -0.06
RDH13-208ENST00000587373 NF2P35240 595 aa14.69□□□□□ -0.06
RDH13-208ENST00000587373 SREBF2Q12772 1141 aa14.69□□□□□ -0.06
RDH13-208ENST00000587373 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
RDH13-208ENST00000587373 CCDC30Q5VVM6 783 aa14.69□□□□□ -0.06
RDH13-208ENST00000587373 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa14.69□□□□□ -0.06
RDH13-208ENST00000587373 RIC3Q7Z5B4 369 aa14.69□□□□□ -0.06
RDH13-208ENST00000587373 PODNQ7Z5L7 613 aa14.69□□□□□ -0.06
RDH13-208ENST00000587373 CHMP4AQ9BY43 222 aa14.69□□□□□ -0.06
RDH13-208ENST00000587373 TM4SF4P48230 202 aa14.68□□□□□ -0.06
RDH13-208ENST00000587373 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP14.68□□□□□ -0.06
RDH13-208ENST00000587373 SLFN5Q08AF3 891 aa14.68□□□□□ -0.06
RDH13-208ENST00000587373 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
RDH13-208ENST00000587373 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
RDH13-208ENST00000587373 PDE8AO60658 829 aa14.67□□□□□ -0.06
RDH13-208ENST00000587373 FKTNO75072 461 aa14.67□□□□□ -0.06
RDH13-208ENST00000587373 ATP2B4P23634 1241 aa14.67□□□□□ -0.06
RDH13-208ENST00000587373 NBPF9Q3BBW0 867 aa14.67□□□□□ -0.06
RDH13-208ENST00000587373 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa14.67□□□□□ -0.06
RDH13-208ENST00000587373 CDCA7LQ96GN5 454 aa14.67□□□□□ -0.06
RDH13-208ENST00000587373 MYH3P11055 1940 aa14.66□□□□□ -0.06
RDH13-208ENST00000587373 VAMP4O75379 141 aa14.66□□□□□ -0.06
RDH13-208ENST00000587373 OGFOD1Q8N543 542 aa14.66□□□□□ -0.06
RDH13-208ENST00000587373 FBXW7Q969H0 707 aa14.66□□□□□ -0.06
RDH13-208ENST00000587373 MYD88Q99836 296 aa14.66□□□□□ -0.06
RDH13-208ENST00000587373 STK31Q9BXU1 1019 aa14.66□□□□□ -0.06
RDH13-208ENST00000587373 MED23Q9ULK4 1368 aa14.65□□□□□ -0.06
RDH13-208ENST00000587373 WNT10BO00744 389 aa14.65□□□□□ -0.06
RDH13-208ENST00000587373 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
RDH13-208ENST00000587373 ARMC9Q7Z3E5 817 aa14.65□□□□□ -0.06
RDH13-208ENST00000587373 CCDC191Q8NCU4 936 aa14.65□□□□□ -0.06
RDH13-208ENST00000587373 CFHR5Q9BXR6 569 aa14.65□□□□□ -0.06
RDH13-208ENST00000587373 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
RDH13-208ENST00000587373 MYO3BQ8WXR4 1341 aa14.65□□□□□ -0.06
RDH13-208ENST00000587373 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
RDH13-208ENST00000587373 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
RDH13-208ENST00000587373 MXD3Q9BW11 206 aa14.64□□□□□ -0.07
RDH13-208ENST00000587373 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
RDH13-208ENST00000587373 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
RDH13-208ENST00000587373 SASH1O94885 1247 aa14.63□□□□□ -0.07
RDH13-208ENST00000587373 ALDH1A1P00352 501 aa14.63□□□□□ -0.07
RDH13-208ENST00000587373 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
RDH13-208ENST00000587373 PRKG1Q13976 671 aa14.63□□□□□ -0.07
RDH13-208ENST00000587373 DACT2Q5SW24 774 aa14.63□□□□□ -0.07
RDH13-208ENST00000587373 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
RDH13-208ENST00000587373 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
RDH13-208ENST00000587373 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa14.63□□□□□ -0.07
RDH13-208ENST00000587373 SPRYD7Q5W111 196 aa14.62□□□□□ -0.07
RDH13-208ENST00000587373 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
RDH13-208ENST00000587373 TRIM17Q9Y577 477 aa14.62□□□□□ -0.07
RDH13-208ENST00000587373 LAMB1P07942 1786 aa14.62□□□□□ -0.07
RDH13-208ENST00000587373 ZBED9Q6R2W3 1325 aa14.62□□□□□ -0.07
RDH13-208ENST00000587373 SLC4A2P04920 1241 aa14.61□□□□□ -0.07
RDH13-208ENST00000587373 CTSWP56202 376 aa14.61□□□□□ -0.07
RDH13-208ENST00000587373 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
RDH13-208ENST00000587373 STRIP1Q5VSL9 837 aa14.61□□□□□ -0.07
RDH13-208ENST00000587373 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
RDH13-208ENST00000587373 ECM29Q5VYK3 1845 aa14.61□□□□□ -0.07
RDH13-208ENST00000587373 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
RDH13-208ENST00000587373 DDX58O95786 925 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
RDH13-208ENST00000587373 MMP14P50281 582 aa14.6□□□□□ -0.07
RDH13-208ENST00000587373 CCT4P50991 539 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
RDH13-208ENST00000587373 LDLRAD1Q5T700 205 aa14.6□□□□□ -0.07
RDH13-208ENST00000587373 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
RDH13-208ENST00000587373 G2E3Q7L622 706 aa14.6□□□□□ -0.07
RDH13-208ENST00000587373 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
RDH13-208ENST00000587373 COA1Q9GZY4 146 aa14.6□□□□□ -0.07
RDH13-208ENST00000587373 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
RDH13-208ENST00000587373 MINPP1Q9UNW1 487 aa14.6□□□□□ -0.07
RDH13-208ENST00000587373 POTEFA5A3E0 1075 aa14.59□□□□□ -0.07
RDH13-208ENST00000587373 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
RDH13-208ENST00000587373 FLIIQ13045 1269 aa14.59□□□□□ -0.07
RDH13-208ENST00000587373 OTOP1Q7RTM1 612 aa14.59□□□□□ -0.07
RDH13-208ENST00000587373 IFNL1Q8IU54 200 aa14.59□□□□□ -0.07
RDH13-208ENST00000587373 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
RDH13-208ENST00000587373 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
RDH13-208ENST00000587373 INHBEP58166 350 aa14.58□□□□□ -0.08
RDH13-208ENST00000587373 TTLL5Q6EMB2 1281 aa14.58□□□□□ -0.08
RDH13-208ENST00000587373 KIAA0825Q8IV33 1275 aa14.58□□□□□ -0.08
RDH13-208ENST00000587373 GREM2Q9H772 168 aa14.58□□□□□ -0.08
RDH13-208ENST00000587373 FZD1Q9UP38 647 aa14.58□□□□□ -0.08
RDH13-208ENST00000587373 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
RDH13-208ENST00000587373 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
RDH13-208ENST00000587373 KSR2Q6VAB6 950 aa14.57□□□□□ -0.08
RDH13-208ENST00000587373 TTLL11Q8NHH1 800 aa14.57□□□□□ -0.08
RDH13-208ENST00000587373 SLC10A4Q96EP9 437 aa14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.6 ms