RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585685.5

APOC4-APOC2-201, Transcript of APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 5

Gene APOC4-APOC2, Length 1,829 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 OSBP2Q969R2 916 aa19.53■□□□□ 0.72
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP19.53■□□□□ 0.72
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CHMP4CQ96CF2 233 aa19.47■□□□□ 0.71
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP19.46■□□□□ 0.71
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KIF3AQ9Y496 699 aa19.45■□□□□ 0.7
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TOM1O60784 492 aa19.44■□□□□ 0.7
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP19.44■□□□□ 0.7
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CCDC87Q9NVE4 849 aa19.44■□□□□ 0.7
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP19.44■□□□□ 0.7
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PTPDC1A2A3K4 754 aa19.44■□□□□ 0.7
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GPAA1O43292 621 aa19.44■□□□□ 0.7
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 MSNP26038 577 aaKnown RBP19.44■□□□□ 0.7
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 TPRNQ4KMQ1 711 aa19.44■□□□□ 0.7
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa19.43■□□□□ 0.7
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FGFR2P21802 821 aa19.43■□□□□ 0.7
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 UBE3CQ15386 1083 aa19.43■□□□□ 0.7
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP19.43■□□□□ 0.7
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GIMAP6Q6P9H5 292 aa19.43■□□□□ 0.7
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CCDC39Q9UFE4 941 aa19.43■□□□□ 0.7
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZNF831Q5JPB2 1677 aa19.43■□□□□ 0.7
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