RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578709.5

ERBB2-209, Transcript of erb-b2 receptor tyrosine kinase 2, human

TSL 4

Gene ERBB2, Length 559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ERBB2-209	ENST00000578709		G3V3G9	751 aa		29.45	■■■□□ 2.31
ERBB2-209	ENST00000578709	FGFR2	P21802	821 aa		29.45	■■■□□ 2.31
ERBB2-209	ENST00000578709	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	29.45	■■■□□ 2.31
ERBB2-209	ENST00000578709	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		29.45	■■■□□ 2.31
ERBB2-209	ENST00000578709	PODN	Q7Z5L7	613 aa		29.45	■■■□□ 2.31
ERBB2-209	ENST00000578709	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		29.45	■■■□□ 2.31
ERBB2-209	ENST00000578709	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	29.45	■■■□□ 2.31
ERBB2-209	ENST00000578709	TNIP1	Q15025	636 aa		29.44	■■■□□ 2.3
ERBB2-209	ENST00000578709	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		29.44	■■■□□ 2.3
ERBB2-209	ENST00000578709	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		29.44	■■■□□ 2.3
ERBB2-209	ENST00000578709	RAD17	O75943	681 aa		29.43	■■■□□ 2.3
ERBB2-209	ENST00000578709	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	29.43	■■■□□ 2.3
ERBB2-209	ENST00000578709	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	29.42	■■■□□ 2.3
ERBB2-209	ENST00000578709	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		29.42	■■■□□ 2.3
ERBB2-209	ENST00000578709	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		29.42	■■■□□ 2.3
ERBB2-209	ENST00000578709	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		29.42	■■■□□ 2.3
ERBB2-209	ENST00000578709	PSME4	Q14997	1843 aa		29.42	■■■□□ 2.3
ERBB2-209	ENST00000578709	POTEC	B2RU33	542 aa		29.41	■■■□□ 2.3
ERBB2-209	ENST00000578709	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		29.41	■■■□□ 2.3
ERBB2-209	ENST00000578709	CRBN	Q96SW2	442 aa		29.41	■■■□□ 2.3
ERBB2-209	ENST00000578709	PSMD14	O00487	310 aa		29.4	■■■□□ 2.3
ERBB2-209	ENST00000578709	LPIN2	Q92539	896 aa		29.4	■■■□□ 2.3
ERBB2-209	ENST00000578709	RRAGC	Q9HB90	399 aa		29.4	■■■□□ 2.3
ERBB2-209	ENST00000578709	CD209	Q9NNX6	404 aa		29.4	■■■□□ 2.3
ERBB2-209	ENST00000578709	SCN4A	P35499	1836 aa		29.39	■■■□□ 2.3
ERBB2-209	ENST00000578709	HMMR	O75330	724 aa		29.39	■■■□□ 2.3
ERBB2-209	ENST00000578709	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	29.39	■■■□□ 2.3
ERBB2-209	ENST00000578709	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	29.39	■■■□□ 2.3
ERBB2-209	ENST00000578709	KIF3C	O14782	793 aa		29.38	■■■□□ 2.29
ERBB2-209	ENST00000578709	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	29.38	■■■□□ 2.29
ERBB2-209	ENST00000578709	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	29.38	■■■□□ 2.29
ERBB2-209	ENST00000578709	SLC5A1	P13866	664 aa		29.38	■■■□□ 2.29
ERBB2-209	ENST00000578709	IL1R1	P14778	569 aa		29.38	■■■□□ 2.29
ERBB2-209	ENST00000578709	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	29.38	■■■□□ 2.29
ERBB2-209	ENST00000578709	TFCP2	Q12800	502 aa		29.38	■■■□□ 2.29
ERBB2-209	ENST00000578709	ATP2B3	Q16720	1220 aa		29.38	■■■□□ 2.29
ERBB2-209	ENST00000578709	SASH1	O94885	1247 aa		29.37	■■■□□ 2.29
ERBB2-209	ENST00000578709	GYG1	P46976	350 aa		29.37	■■■□□ 2.29
ERBB2-209	ENST00000578709	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		29.37	■■■□□ 2.29
ERBB2-209	ENST00000578709	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		29.36	■■■□□ 2.29
ERBB2-209	ENST00000578709	USP17L3	A6NCW0	530 aa		29.36	■■■□□ 2.29
ERBB2-209	ENST00000578709	USP17L4	A6NCW7	530 aa		29.36	■■■□□ 2.29
ERBB2-209	ENST00000578709	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	29.36	■■■□□ 2.29
ERBB2-209	ENST00000578709	SCNN1D	P51172	638 aa		29.36	■■■□□ 2.29
ERBB2-209	ENST00000578709	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		29.36	■■■□□ 2.29
ERBB2-209	ENST00000578709	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	29.36	■■■□□ 2.29
ERBB2-209	ENST00000578709	ZNF609	O15014	1411 aa		29.36	■■■□□ 2.29
ERBB2-209	ENST00000578709	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	29.35	■■■□□ 2.29
ERBB2-209	ENST00000578709	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		29.35	■■■□□ 2.29
ERBB2-209	ENST00000578709	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	29.35	■■■□□ 2.29
ERBB2-209	ENST00000578709	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	29.34	■■■□□ 2.29
ERBB2-209	ENST00000578709	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		29.34	■■■□□ 2.29
ERBB2-209	ENST00000578709	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		29.34	■■■□□ 2.29
ERBB2-209	ENST00000578709	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	29.34	■■■□□ 2.29
ERBB2-209	ENST00000578709	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	29.33	■■■□□ 2.29
ERBB2-209	ENST00000578709	DPF2	Q92785	391 aa		29.33	■■■□□ 2.29
ERBB2-209	ENST00000578709	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		29.33	■■■□□ 2.29
ERBB2-209	ENST00000578709	HACL1	Q9UJ83	578 aa		29.33	■■■□□ 2.29
ERBB2-209	ENST00000578709	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		29.33	■■■□□ 2.29
ERBB2-209	ENST00000578709	AAMP	Q13685	434 aa		29.32	■■■□□ 2.28
ERBB2-209	ENST00000578709	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		29.32	■■■□□ 2.28
ERBB2-209	ENST00000578709	DACT2	Q5SW24	774 aa		29.32	■■■□□ 2.28
ERBB2-209	ENST00000578709	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	29.32	■■■□□ 2.28
ERBB2-209	ENST00000578709	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	29.32	■■■□□ 2.28
ERBB2-209	ENST00000578709	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	29.31	■■■□□ 2.28
ERBB2-209	ENST00000578709	BCAM	P50895	628 aa		29.31	■■■□□ 2.28
ERBB2-209	ENST00000578709	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		29.31	■■■□□ 2.28
ERBB2-209	ENST00000578709	VPS37D	Q86XT2	251 aa		29.31	■■■□□ 2.28
ERBB2-209	ENST00000578709	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	29.31	■■■□□ 2.28
ERBB2-209	ENST00000578709	GPR108	Q9NPR9	543 aa		29.31	■■■□□ 2.28
ERBB2-209	ENST00000578709	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		29.31	■■■□□ 2.28
ERBB2-209	ENST00000578709	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		29.31	■■■□□ 2.28
ERBB2-209	ENST00000578709		A0A1B0GUL7	405 aa		29.3	■■■□□ 2.28
ERBB2-209	ENST00000578709	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		29.3	■■■□□ 2.28
ERBB2-209	ENST00000578709	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		29.3	■■■□□ 2.28
ERBB2-209	ENST00000578709	GML	Q99445	158 aa		29.3	■■■□□ 2.28
ERBB2-209	ENST00000578709	EPS15	P42566	896 aa		29.29	■■■□□ 2.28
ERBB2-209	ENST00000578709	TIMM10	P62072	90 aa		29.29	■■■□□ 2.28
ERBB2-209	ENST00000578709	GTF2I	P78347	998 aa		29.29	■■■□□ 2.28
ERBB2-209	ENST00000578709	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		29.28	■■■□□ 2.28
ERBB2-209	ENST00000578709	ADORA1	P30542	326 aa		29.28	■■■□□ 2.28
ERBB2-209	ENST00000578709	EPHX2	P34913	555 aa		29.28	■■■□□ 2.28
ERBB2-209	ENST00000578709	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		29.27	■■■□□ 2.28
ERBB2-209	ENST00000578709	ZBTB22	O15209	634 aa		29.27	■■■□□ 2.28
ERBB2-209	ENST00000578709	FBXW7	Q969H0	707 aa		29.27	■■■□□ 2.28
ERBB2-209	ENST00000578709	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	29.27	■■■□□ 2.28
ERBB2-209	ENST00000578709	FKBP1A	P62942	108 aa	Known RBP	29.26	■■■□□ 2.27
ERBB2-209	ENST00000578709	TNNI3K	Q59H18	835 aa		29.26	■■■□□ 2.27
ERBB2-209	ENST00000578709	XAGE2	Q96GT9	111 aa		29.26	■■■□□ 2.27
ERBB2-209	ENST00000578709	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		29.26	■■■□□ 2.27
ERBB2-209	ENST00000578709	RAB11FIP3	O75154	756 aa		29.25	■■■□□ 2.27
ERBB2-209	ENST00000578709	MICALL2	Q8IY33	904 aa		29.25	■■■□□ 2.27
ERBB2-209	ENST00000578709	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	29.25	■■■□□ 2.27
ERBB2-209	ENST00000578709	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		29.25	■■■□□ 2.27
ERBB2-209	ENST00000578709	MXD3	Q9BW11	206 aa		29.25	■■■□□ 2.27
ERBB2-209	ENST00000578709	TOMM70	O94826	608 aa		29.24	■■■□□ 2.27
ERBB2-209	ENST00000578709	PHKA1	P46020	1223 aa		29.24	■■■□□ 2.27
ERBB2-209	ENST00000578709	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	29.24	■■■□□ 2.27
ERBB2-209	ENST00000578709	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		29.24	■■■□□ 2.27
ERBB2-209	ENST00000578709	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	29.24	■■■□□ 2.27

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