RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575185.1

SPNS3-203, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

TSL 5

Gene SPNS3, Length 496 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-203ENST00000575185 DACT2Q5SW24 774 aa26.78■■□□□ 1.88
SPNS3-203ENST00000575185 C8orf58Q8NAV2 365 aa26.78■■□□□ 1.88
SPNS3-203ENST00000575185 FBXW7Q969H0 707 aa26.78■■□□□ 1.88
SPNS3-203ENST00000575185 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
SPNS3-203ENST00000575185 IFT57Q9NWB7 429 aa26.77■■□□□ 1.88
SPNS3-203ENST00000575185 HDAC9Q9UKV0 1011 aa26.77■■□□□ 1.88
SPNS3-203ENST00000575185 HTTP42858 3142 aa26.76■■□□□ 1.88
SPNS3-203ENST00000575185 GREM2Q9H772 168 aa26.76■■□□□ 1.87
SPNS3-203ENST00000575185 MINPP1Q9UNW1 487 aa26.76■■□□□ 1.87
SPNS3-203ENST00000575185 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa26.76■■□□□ 1.87
SPNS3-203ENST00000575185 WNT10BO00744 389 aa26.75■■□□□ 1.87
SPNS3-203ENST00000575185 SASH1O94885 1247 aa26.75■■□□□ 1.87
SPNS3-203ENST00000575185 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP26.75■■□□□ 1.87
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SPNS3-203ENST00000575185 IGKV5-2P06315 115 aa26.74■■□□□ 1.87
SPNS3-203ENST00000575185 TXNRD3Q86VQ6 643 aa26.74■■□□□ 1.87
SPNS3-203ENST00000575185 TTLL11Q8NHH1 800 aa26.74■■□□□ 1.87
SPNS3-203ENST00000575185 APAF1O14727 1248 aa26.73■■□□□ 1.87
SPNS3-203ENST00000575185 CCT4P50991 539 aaKnown RBP26.73■■□□□ 1.87
SPNS3-203ENST00000575185 GNAI1P63096 354 aa26.73■■□□□ 1.87
SPNS3-203ENST00000575185 DDX58O95786 925 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
SPNS3-203ENST00000575185 TM4SF4P48230 202 aa26.72■■□□□ 1.87
SPNS3-203ENST00000575185 PRKG1Q13976 671 aa26.72■■□□□ 1.87
SPNS3-203ENST00000575185 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
SPNS3-203ENST00000575185 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP26.72■■□□□ 1.87
SPNS3-203ENST00000575185 CENPFP49454 3210 aa26.72■■□□□ 1.87
SPNS3-203ENST00000575185 GPR25O00155 361 aa26.71■■□□□ 1.87
SPNS3-203ENST00000575185 KLRK1P26718 216 aa26.71■■□□□ 1.87
SPNS3-203ENST00000575185 OGFOD1Q8N543 542 aa26.71■■□□□ 1.87
SPNS3-203ENST00000575185 TSPYL6Q8N831 410 aa26.71■■□□□ 1.87
SPNS3-203ENST00000575185 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa26.71■■□□□ 1.87
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SPNS3-203ENST00000575185 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
SPNS3-203ENST00000575185 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
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SPNS3-203ENST00000575185 A0A1B0GUL6 1792 aa26.69■■□□□ 1.86
SPNS3-203ENST00000575185 PI4KAP2A4QPH2 592 aa26.69■■□□□ 1.86
SPNS3-203ENST00000575185 NF2P35240 595 aa26.69■■□□□ 1.86
SPNS3-203ENST00000575185 STRIP1Q5VSL9 837 aa26.69■■□□□ 1.86
SPNS3-203ENST00000575185 CCDC30Q5VVM6 783 aa26.69■■□□□ 1.86
SPNS3-203ENST00000575185 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa26.69■■□□□ 1.86
SPNS3-203ENST00000575185 ECM29Q5VYK3 1845 aa26.69■■□□□ 1.86
SPNS3-203ENST00000575185 MYO3BQ8WXR4 1341 aa26.68■■□□□ 1.86
SPNS3-203ENST00000575185 KSR2Q6VAB6 950 aa26.68■■□□□ 1.86
SPNS3-203ENST00000575185 COA1Q9GZY4 146 aa26.68■■□□□ 1.86
SPNS3-203ENST00000575185 LAMB1P07942 1786 aa26.68■■□□□ 1.86
SPNS3-203ENST00000575185 KIAA0825Q8IV33 1275 aa26.67■■□□□ 1.86
SPNS3-203ENST00000575185 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
SPNS3-203ENST00000575185 SREBF2Q12772 1141 aa26.66■■□□□ 1.86
SPNS3-203ENST00000575185 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
SPNS3-203ENST00000575185 BRCA2P51587 3418 aa26.65■■□□□ 1.86
SPNS3-203ENST00000575185 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
SPNS3-203ENST00000575185 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa26.65■■□□□ 1.86
SPNS3-203ENST00000575185 SSC5DA1L4H1 1573 aa26.64■■□□□ 1.86
SPNS3-203ENST00000575185 NEURL1BA8MQ27 555 aa26.64■■□□□ 1.86
SPNS3-203ENST00000575185 FKTNO75072 461 aa26.64■■□□□ 1.86
SPNS3-203ENST00000575185 TTLL5Q6EMB2 1281 aa26.64■■□□□ 1.86
SPNS3-203ENST00000575185 ARMC9Q7Z3E5 817 aa26.64■■□□□ 1.86
SPNS3-203ENST00000575185 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
SPNS3-203ENST00000575185 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
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SPNS3-203ENST00000575185 ZNF804BA4D1E1 1349 aa26.64■■□□□ 1.85
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SPNS3-203ENST00000575185 LDLRAD1Q5T700 205 aa26.63■■□□□ 1.85
SPNS3-203ENST00000575185 SPRYD7Q5W111 196 aa26.63■■□□□ 1.85
SPNS3-203ENST00000575185 G2E3Q7L622 706 aa26.63■■□□□ 1.85
SPNS3-203ENST00000575185 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
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SPNS3-203ENST00000575185 CFHR5Q9BXR6 569 aa26.63■■□□□ 1.85
SPNS3-203ENST00000575185 LEMD3Q9Y2U8 911 aa26.63■■□□□ 1.85
SPNS3-203ENST00000575185 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
SPNS3-203ENST00000575185 NEXNQ0ZGT2 675 aa26.62■■□□□ 1.85
SPNS3-203ENST00000575185 H7C1W4 665 aa26.61■■□□□ 1.85
SPNS3-203ENST00000575185 ITGA6P23229 1130 aa26.61■■□□□ 1.85
SPNS3-203ENST00000575185 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa26.61■■□□□ 1.85
SPNS3-203ENST00000575185 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
SPNS3-203ENST00000575185 SNAP23O00161 211 aa26.59■■□□□ 1.85
SPNS3-203ENST00000575185 CLMNQ96JQ2 1002 aa26.59■■□□□ 1.85
SPNS3-203ENST00000575185 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
SPNS3-203ENST00000575185 OTOFQ9HC10 1997 aa26.58■■□□□ 1.85
SPNS3-203ENST00000575185 CERS5Q8N5B7 392 aa26.58■■□□□ 1.85
SPNS3-203ENST00000575185 STK31Q9BXU1 1019 aa26.58■■□□□ 1.85
SPNS3-203ENST00000575185 DEFB129Q9H1M3 183 aa26.58■■□□□ 1.85
SPNS3-203ENST00000575185 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
SPNS3-203ENST00000575185 CHRNDQ07001 517 aa26.57■■□□□ 1.84
SPNS3-203ENST00000575185 ANKRD2Q9GZV1 360 aa26.57■■□□□ 1.84
SPNS3-203ENST00000575185 KCNJ4P48050 445 aa26.56■■□□□ 1.84
SPNS3-203ENST00000575185 MMP14P50281 582 aa26.56■■□□□ 1.84
SPNS3-203ENST00000575185 CASP7P55210 303 aa26.56■■□□□ 1.84
SPNS3-203ENST00000575185 GCKRQ14397 625 aa26.56■■□□□ 1.84
SPNS3-203ENST00000575185 MPHOSPH8Q99549 860 aa26.56■■□□□ 1.84
SPNS3-203ENST00000575185 CHMP4AQ9BY43 222 aa26.56■■□□□ 1.84
SPNS3-203ENST00000575185 CD209Q9NNX6 404 aa26.56■■□□□ 1.84
SPNS3-203ENST00000575185 IRS2Q9Y4H2 1338 aa26.56■■□□□ 1.84
SPNS3-203ENST00000575185 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP26.55■■□□□ 1.84
SPNS3-203ENST00000575185 DLGAP5Q15398 846 aa26.55■■□□□ 1.84
SPNS3-203ENST00000575185 IFNL1Q8IU54 200 aa26.55■■□□□ 1.84
SPNS3-203ENST00000575185 PLA2G12BQ9BX93 195 aa26.55■■□□□ 1.84
SPNS3-203ENST00000575185 TRIM17Q9Y577 477 aa26.55■■□□□ 1.84
SPNS3-203ENST00000575185 AOX1Q06278 1338 aa26.55■■□□□ 1.84
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