RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567771.5

SPNS1-209, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 3

Gene SPNS1, Length 829 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-209ENST00000567771 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP32.39■■■□□ 2.78
SPNS1-209ENST00000567771 PSME4Q14997 1843 aa32.38■■■□□ 2.77
SPNS1-209ENST00000567771 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP32.38■■■□□ 2.77
SPNS1-209ENST00000567771 TXNRD3Q86VQ6 643 aa32.38■■■□□ 2.77
SPNS1-209ENST00000567771 GGA3Q9NZ52 723 aa32.38■■■□□ 2.77
SPNS1-209ENST00000567771 ZNF521Q96K83 1311 aa32.37■■■□□ 2.77
SPNS1-209ENST00000567771 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP32.37■■■□□ 2.77
SPNS1-209ENST00000567771 FOXO4P98177 505 aa32.36■■■□□ 2.77
SPNS1-209ENST00000567771 ANKRD2Q9GZV1 360 aa32.36■■■□□ 2.77
SPNS1-209ENST00000567771 ZNF804BA4D1E1 1349 aa32.35■■■□□ 2.77
SPNS1-209ENST00000567771 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa32.35■■■□□ 2.77
SPNS1-209ENST00000567771 USP17L8P0C7I0 530 aa32.35■■■□□ 2.77
SPNS1-209ENST00000567771 MAP2K2P36507 400 aa32.35■■■□□ 2.77
SPNS1-209ENST00000567771 COA1Q9GZY4 146 aa32.35■■■□□ 2.77
SPNS1-209ENST00000567771 KLRK1P26718 216 aa32.34■■■□□ 2.77
SPNS1-209ENST00000567771 SCARF1Q14162 830 aa32.34■■■□□ 2.77
SPNS1-209ENST00000567771 HUNKP57058 714 aa32.33■■■□□ 2.77
SPNS1-209ENST00000567771 CHRNDQ07001 517 aa32.33■■■□□ 2.77
SPNS1-209ENST00000567771 SULF1Q8IWU6 871 aa32.33■■■□□ 2.77
SPNS1-209ENST00000567771 MXD3Q9BW11 206 aa32.33■■■□□ 2.77
SPNS1-209ENST00000567771 MYOZ2Q9NPC6 264 aa32.33■■■□□ 2.77
SPNS1-209ENST00000567771 DACT2Q5SW24 774 aa32.32■■■□□ 2.76
SPNS1-209ENST00000567771 BEGAINQ9BUH8 593 aa32.32■■■□□ 2.76
SPNS1-209ENST00000567771 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP32.32■■■□□ 2.76
SPNS1-209ENST00000567771 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP32.31■■■□□ 2.76
SPNS1-209ENST00000567771 EPHA10Q5JZY3 1008 aa32.31■■■□□ 2.76
SPNS1-209ENST00000567771 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP32.31■■■□□ 2.76
SPNS1-209ENST00000567771 FBXW7Q969H0 707 aa32.31■■■□□ 2.76
SPNS1-209ENST00000567771 CHMP3Q9Y3E7 222 aa32.31■■■□□ 2.76
SPNS1-209ENST00000567771 GRM8O00222 908 aa32.3■■■□□ 2.76
SPNS1-209ENST00000567771 SLC4A10Q6U841 1118 aa32.3■■■□□ 2.76
SPNS1-209ENST00000567771 STRIP1Q5VSL9 837 aa32.29■■■□□ 2.76
SPNS1-209ENST00000567771 LMBR1LQ6UX01 489 aa32.29■■■□□ 2.76
SPNS1-209ENST00000567771 C2orf69Q8N8R5 385 aa32.29■■■□□ 2.76
SPNS1-209ENST00000567771 SNAP23O00161 211 aa32.28■■■□□ 2.76
SPNS1-209ENST00000567771 KCNJ4P48050 445 aa32.28■■■□□ 2.76
SPNS1-209ENST00000567771 TAF5LO75529 589 aa32.27■■■□□ 2.76
SPNS1-209ENST00000567771 ALDH1L1O75891 902 aa32.27■■■□□ 2.76
SPNS1-209ENST00000567771 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP32.27■■■□□ 2.76
SPNS1-209ENST00000567771 CDCA5Q96FF9 252 aa32.27■■■□□ 2.76
SPNS1-209ENST00000567771 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP32.27■■■□□ 2.76
SPNS1-209ENST00000567771 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP32.26■■■□□ 2.76
SPNS1-209ENST00000567771 ZIC5Q96T25 663 aa32.26■■■□□ 2.75
SPNS1-209ENST00000567771 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa32.26■■■□□ 2.75
SPNS1-209ENST00000567771 MYO3BQ8WXR4 1341 aa32.26■■■□□ 2.75
SPNS1-209ENST00000567771 TTLL5Q6EMB2 1281 aa32.25■■■□□ 2.75
SPNS1-209ENST00000567771 RGMBQ6NW40 437 aa32.25■■■□□ 2.75
SPNS1-209ENST00000567771 TSKSQ9UJT2 592 aa32.25■■■□□ 2.75
SPNS1-209ENST00000567771 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP32.24■■■□□ 2.75
SPNS1-209ENST00000567771 NBPF9Q3BBW0 867 aa32.24■■■□□ 2.75
SPNS1-209ENST00000567771 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP32.24■■■□□ 2.75
SPNS1-209ENST00000567771 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP32.24■■■□□ 2.75
SPNS1-209ENST00000567771 IRS2Q9Y4H2 1338 aa32.24■■■□□ 2.75
SPNS1-209ENST00000567771 NOGQ13253 232 aa32.23■■■□□ 2.75
SPNS1-209ENST00000567771 CCDC57Q2TAC2 916 aa32.23■■■□□ 2.75
SPNS1-209ENST00000567771 OGFOD1Q8N543 542 aa32.23■■■□□ 2.75
SPNS1-209ENST00000567771 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP32.23■■■□□ 2.75
SPNS1-209ENST00000567771 CD209Q9NNX6 404 aa32.23■■■□□ 2.75
SPNS1-209ENST00000567771 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa32.23■■■□□ 2.75
SPNS1-209ENST00000567771 GTF2IP78347 998 aa32.22■■■□□ 2.75
SPNS1-209ENST00000567771 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP32.21■■■□□ 2.75
SPNS1-209ENST00000567771 E9PSI1 815 aa32.2■■■□□ 2.75
SPNS1-209ENST00000567771 WNT10BO00744 389 aa32.2■■■□□ 2.75
SPNS1-209ENST00000567771 TAF7LQ5H9L4 462 aa32.2■■■□□ 2.75
SPNS1-209ENST00000567771 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa32.2■■■□□ 2.75
SPNS1-209ENST00000567771 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP32.2■■■□□ 2.75
SPNS1-209ENST00000567771 SUCLG2Q96I99 432 aa32.2■■■□□ 2.75
SPNS1-209ENST00000567771 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP32.19■■■□□ 2.74
SPNS1-209ENST00000567771 KIAA0825Q8IV33 1275 aa32.19■■■□□ 2.74
SPNS1-209ENST00000567771 KAZALD1Q96I82 304 aa32.19■■■□□ 2.74
SPNS1-209ENST00000567771 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP32.18■■■□□ 2.74
SPNS1-209ENST00000567771 CCDC102AQ96A19 550 aa32.18■■■□□ 2.74
SPNS1-209ENST00000567771 A0A1B0GUL6 1792 aa32.17■■■□□ 2.74
SPNS1-209ENST00000567771 CA12O43570 354 aa32.17■■■□□ 2.74
SPNS1-209ENST00000567771 PLIN1O60240 522 aa32.17■■■□□ 2.74
SPNS1-209ENST00000567771 SLFN5Q08AF3 891 aa32.17■■■□□ 2.74
SPNS1-209ENST00000567771 CNNM1Q9NRU3 951 aa32.17■■■□□ 2.74
SPNS1-209ENST00000567771 SASH1O94885 1247 aa32.16■■■□□ 2.74
SPNS1-209ENST00000567771 MMP14P50281 582 aa32.16■■■□□ 2.74
SPNS1-209ENST00000567771 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa32.16■■■□□ 2.74
SPNS1-209ENST00000567771 SSH1Q8WYL5 1049 aa32.15■■■□□ 2.74
SPNS1-209ENST00000567771 HDAC9Q9UKV0 1011 aa32.15■■■□□ 2.74
SPNS1-209ENST00000567771 UTYO14607 1347 aa32.15■■■□□ 2.74
SPNS1-209ENST00000567771 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP32.14■■■□□ 2.74
SPNS1-209ENST00000567771 ZNF804AQ7Z570 1209 aa32.14■■■□□ 2.74
SPNS1-209ENST00000567771 PTPRCP08575 1304 aa32.13■■■□□ 2.73
SPNS1-209ENST00000567771 SLC10A3P09131 477 aa32.13■■■□□ 2.73
SPNS1-209ENST00000567771 IL1R1P14778 569 aa32.13■■■□□ 2.73
SPNS1-209ENST00000567771 FKBP1BP68106 108 aa32.13■■■□□ 2.73
SPNS1-209ENST00000567771 CERS5Q8N5B7 392 aa32.13■■■□□ 2.73
SPNS1-209ENST00000567771 CDCA7LQ96GN5 454 aa32.13■■■□□ 2.73
SPNS1-209ENST00000567771 MOB2Q70IA6 237 aa32.12■■■□□ 2.73
SPNS1-209ENST00000567771 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP32.12■■■□□ 2.73
SPNS1-209ENST00000567771 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP32.12■■■□□ 2.73
SPNS1-209ENST00000567771 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP32.1■■■□□ 2.73
SPNS1-209ENST00000567771 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa32.09■■■□□ 2.73
SPNS1-209ENST00000567771 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP32.08■■■□□ 2.73
SPNS1-209ENST00000567771 RASAL3Q86YV0 1011 aa32.08■■■□□ 2.73
SPNS1-209ENST00000567771 ABHD8Q96I13 439 aa32.08■■■□□ 2.73
SPNS1-209ENST00000567771 JAG2Q9Y219 1238 aa32.08■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.6 ms