RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562866.1

VPS9D1-AS1-202, VPS9D1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS9D1-AS1, Length 1,753 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 APPBP2Q92624 585 aa25.33■■□□□ 1.65
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 M0R2C6 588 aa25.32■■□□□ 1.64
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa25.32■■□□□ 1.64
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZNF652Q9Y2D9 606 aa25.32■■□□□ 1.64
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FGD1P98174 961 aa25.31■■□□□ 1.64
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 WASHC4Q2M389 1173 aa25.31■■□□□ 1.64
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TMEM63CQ9P1W3 806 aa25.31■■□□□ 1.64
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SCARF1Q14162 830 aa25.31■■□□□ 1.64
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GTF3C6Q969F1 213 aa25.31■■□□□ 1.64
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CHMP4CQ96CF2 233 aa25.3■■□□□ 1.64
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CNPY2Q9Y2B0 182 aa25.3■■□□□ 1.64
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 RTL9Q8NET4 1388 aa25.3■■□□□ 1.64
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 VPS72Q15906 364 aa25.29■■□□□ 1.64
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CCDC152Q4G0S7 254 aa25.29■■□□□ 1.64
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 E7EWF7 191 aa25.28■■□□□ 1.64
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SLC5A1P13866 664 aa25.28■■□□□ 1.64
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 UBE2HP62256 183 aa25.28■■□□□ 1.64
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 LRSAM1Q6UWE0 723 aa25.28■■□□□ 1.64
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GDPD2Q9HCC8 539 aa25.28■■□□□ 1.64
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FAM43AQ8N2R8 423 aa25.27■■□□□ 1.64
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 MPHOSPH8Q99549 860 aa25.27■■□□□ 1.64
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP25.27■■□□□ 1.64
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ARAP2Q8WZ64 1704 aa25.27■■□□□ 1.64
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FGFR2P21802 821 aa25.26■■□□□ 1.63
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 STK3Q13188 491 aa25.26■■□□□ 1.63
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 BRF1Q92994 677 aa25.26■■□□□ 1.63
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 AGXT2Q9BYV1 514 aa25.26■■□□□ 1.63
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FBXL16Q8N461 479 aa25.24■■□□□ 1.63
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 KCNQ2O43526 872 aa25.23■■□□□ 1.63
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PI16Q6UXB8 463 aa25.23■■□□□ 1.63
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 KLHL34Q8N239 644 aa25.23■■□□□ 1.63
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 BCORQ6W2J9 1755 aa25.23■■□□□ 1.63
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 AKAP11Q9UKA4 1901 aa25.23■■□□□ 1.63
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FAM177BA6PVY3 158 aa25.23■■□□□ 1.63
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CCDC173Q0VFZ6 552 aa25.23■■□□□ 1.63
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 KIF3AQ9Y496 699 aa25.23■■□□□ 1.63
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 GPAA1O43292 621 aa25.22■■□□□ 1.63
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FIBPO43427 364 aa25.22■■□□□ 1.63
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
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VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 KRT85P78386 507 aa25.22■■□□□ 1.63
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 C8orf37Q96NL8 207 aa25.22■■□□□ 1.63
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa25.21■■□□□ 1.63
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CCDC183Q5T5S1 534 aa25.21■■□□□ 1.63
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 TTLL5Q6EMB2 1281 aa25.21■■□□□ 1.63
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CDC37L1Q7L3B6 337 aa25.21■■□□□ 1.63
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 LRRC2Q9BYS8 371 aa25.21■■□□□ 1.63
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa25.2■■□□□ 1.62
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FGAP02671 866 aa25.2■■□□□ 1.62
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa25.2■■□□□ 1.62
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FOXP2O15409 715 aa25.19■■□□□ 1.62
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 SCRN1Q12765 414 aa25.19■■□□□ 1.62
VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 FAM184AQ8NB25 1140 aa25.19■■□□□ 1.62
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