RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555766.1

PAX8-AS1-211, PAX8 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene PAX8-AS1, Length 1,499 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8-AS1-211ENST00000555766 GJA3Q9Y6H8 435 aa11.17□□□□□ -0.62
PAX8-AS1-211ENST00000555766 SNED1Q8TER0 1413 aa11.16□□□□□ -0.62
PAX8-AS1-211ENST00000555766 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
PAX8-AS1-211ENST00000555766 ATP2B4P23634 1241 aa11.16□□□□□ -0.62
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PAX8-AS1-211ENST00000555766 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP11.16□□□□□ -0.62
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PAX8-AS1-211ENST00000555766 RHPN1Q8TCX5 695 aa11.16□□□□□ -0.62
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PAX8-AS1-211ENST00000555766 ZNF541Q9H0D2 1346 aa11.15□□□□□ -0.62
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PAX8-AS1-211ENST00000555766 FBXO3Q9UK99 471 aa11.14□□□□□ -0.63
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PAX8-AS1-211ENST00000555766 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
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PAX8-AS1-211ENST00000555766 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
PAX8-AS1-211ENST00000555766 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
PAX8-AS1-211ENST00000555766 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
PAX8-AS1-211ENST00000555766 CAVIN4Q5BKX8 364 aa11.08□□□□□ -0.64
PAX8-AS1-211ENST00000555766 BMP2KLQ5H9B9 411 aa11.08□□□□□ -0.64
PAX8-AS1-211ENST00000555766 TTC22Q5TAA0 569 aa11.08□□□□□ -0.64
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PAX8-AS1-211ENST00000555766 VGLL2Q8N8G2 317 aa11.08□□□□□ -0.64
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PAX8-AS1-211ENST00000555766 COA1Q9GZY4 146 aa11.08□□□□□ -0.64
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