RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553786.1

PRRX1-208, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

TSL 4

Gene PRRX1, Length 529 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-208ENST00000553786 NBPF9Q3BBW0 867 aa21.59■■□□□ 1.05
PRRX1-208ENST00000553786 GREM2Q9H772 168 aa21.59■■□□□ 1.05
PRRX1-208ENST00000553786 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
PRRX1-208ENST00000553786 IGKV5-2P06315 115 aa21.58■■□□□ 1.05
PRRX1-208ENST00000553786 NEXNQ0ZGT2 675 aa21.58■■□□□ 1.05
PRRX1-208ENST00000553786 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa21.58■■□□□ 1.05
PRRX1-208ENST00000553786 TTLL11Q8NHH1 800 aa21.58■■□□□ 1.05
PRRX1-208ENST00000553786 MXD3Q9BW11 206 aa21.58■■□□□ 1.05
PRRX1-208ENST00000553786 MINPP1Q9UNW1 487 aa21.58■■□□□ 1.05
PRRX1-208ENST00000553786 MYO3BQ8WXR4 1341 aa21.57■■□□□ 1.04
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PRRX1-208ENST00000553786 KSR2Q6VAB6 950 aa21.57■■□□□ 1.04
PRRX1-208ENST00000553786 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa21.57■■□□□ 1.04
PRRX1-208ENST00000553786 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
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PRRX1-208ENST00000553786 PRKG1Q13976 671 aa21.5■■□□□ 1.03
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PRRX1-208ENST00000553786 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
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PRRX1-208ENST00000553786 SLC10A4Q96EP9 437 aa21.4■■□□□ 1.02
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PRRX1-208ENST00000553786 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.01
PRRX1-208ENST00000553786 TAF5LO75529 589 aa21.39■■□□□ 1.01
PRRX1-208ENST00000553786 ZNF804AQ7Z570 1209 aa21.39■■□□□ 1.01
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