RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550718.1

GNPTAB-208, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

TSL 3

Gene GNPTAB, Length 598 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-208ENST00000550718 LINC01387J3KSC0 135 aa9.95□□□□□ -0.82
GNPTAB-208ENST00000550718 CD68P34810 354 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
GNPTAB-208ENST00000550718 ARTNQ5T4W7 220 aa9.95□□□□□ -0.82
GNPTAB-208ENST00000550718 C1orf127Q8N9H9 656 aa9.95□□□□□ -0.82
GNPTAB-208ENST00000550718 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
GNPTAB-208ENST00000550718 LACRTQ9GZZ8 138 aa9.95□□□□□ -0.82
GNPTAB-208ENST00000550718 USTQ9Y2C2 406 aa9.95□□□□□ -0.82
GNPTAB-208ENST00000550718 FSCN2O14926 492 aa9.94□□□□□ -0.82
GNPTAB-208ENST00000550718 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP9.94□□□□□ -0.82
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GNPTAB-208ENST00000550718 C8orf34Q49A92 452 aa9.93□□□□□ -0.82
GNPTAB-208ENST00000550718 C14orf37Q86TY3 774 aa9.93□□□□□ -0.82
GNPTAB-208ENST00000550718 CHRDQ9H2X0 955 aa9.93□□□□□ -0.82
GNPTAB-208ENST00000550718 DZANK1Q9NVP4 752 aa9.93□□□□□ -0.82
GNPTAB-208ENST00000550718 KANSL3Q9P2N6 904 aa9.93□□□□□ -0.82
GNPTAB-208ENST00000550718 ALX3O95076 343 aa9.92□□□□□ -0.82
GNPTAB-208ENST00000550718 EPHA1P21709 976 aa9.92□□□□□ -0.82
GNPTAB-208ENST00000550718 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa9.92□□□□□ -0.82
GNPTAB-208ENST00000550718 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa9.92□□□□□ -0.82
GNPTAB-208ENST00000550718 ZFP64Q9NPA5 681 aa9.92□□□□□ -0.82
GNPTAB-208ENST00000550718 OSGEPQ9NPF4 335 aa9.92□□□□□ -0.82
GNPTAB-208ENST00000550718 POLIQ9UNA4 740 aa9.92□□□□□ -0.82
GNPTAB-208ENST00000550718 SCO2A0A1W2PP80 73 aa9.91□□□□□ -0.82
GNPTAB-208ENST00000550718 H3BRJ5 948 aa9.91□□□□□ -0.82
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GNPTAB-208ENST00000550718 PIP4K2BP78356 416 aa9.91□□□□□ -0.82
GNPTAB-208ENST00000550718 LRP8Q14114 963 aa9.91□□□□□ -0.82
GNPTAB-208ENST00000550718 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
GNPTAB-208ENST00000550718 SNX29Q8TEQ0 813 aa9.91□□□□□ -0.82
GNPTAB-208ENST00000550718 CEP41Q9BYV8 373 aa9.91□□□□□ -0.82
GNPTAB-208ENST00000550718 SEC31BQ9NQW1 1179 aa9.91□□□□□ -0.82
GNPTAB-208ENST00000550718 EGFL7Q9UHF1 273 aa9.91□□□□□ -0.82
GNPTAB-208ENST00000550718 TNFRSF21O75509 655 aa9.9□□□□□ -0.82
GNPTAB-208ENST00000550718 MTMR3Q13615 1198 aa9.9□□□□□ -0.82
GNPTAB-208ENST00000550718 UVSSAQ2YD98 709 aa9.9□□□□□ -0.82
GNPTAB-208ENST00000550718 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
GNPTAB-208ENST00000550718 RNF112Q9ULX5 631 aa9.9□□□□□ -0.82
GNPTAB-208ENST00000550718 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
GNPTAB-208ENST00000550718 EDN3P14138 238 aa9.89□□□□□ -0.83
GNPTAB-208ENST00000550718 TXNDC11Q6PKC3 985 aa9.89□□□□□ -0.83
GNPTAB-208ENST00000550718 A6NHS1 94 aa9.88□□□□□ -0.83
GNPTAB-208ENST00000550718 FZD6O60353 706 aa9.88□□□□□ -0.83
GNPTAB-208ENST00000550718 GLB1P16278 677 aa9.88□□□□□ -0.83
GNPTAB-208ENST00000550718 ERICH6Q7L0X2 663 aa9.88□□□□□ -0.83
GNPTAB-208ENST00000550718 GJD3Q8N144 294 aa9.88□□□□□ -0.83
GNPTAB-208ENST00000550718 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP9.88□□□□□ -0.83
GNPTAB-208ENST00000550718 KCNK4Q9NYG8 393 aa9.88□□□□□ -0.83
GNPTAB-208ENST00000550718 SOX13Q9UN79 622 aa9.88□□□□□ -0.83
GNPTAB-208ENST00000550718 GSC2O15499 205 aa9.87□□□□□ -0.83
GNPTAB-208ENST00000550718 PHACTR2O75167 634 aa9.87□□□□□ -0.83
GNPTAB-208ENST00000550718 WISP1O95388 367 aa9.87□□□□□ -0.83
GNPTAB-208ENST00000550718 AAMPQ13685 434 aa9.87□□□□□ -0.83
GNPTAB-208ENST00000550718 DUOXA2Q1HG44 320 aa9.87□□□□□ -0.83
GNPTAB-208ENST00000550718 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa9.87□□□□□ -0.83
GNPTAB-208ENST00000550718 ACAD11Q709F0 780 aa9.87□□□□□ -0.83
GNPTAB-208ENST00000550718 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
GNPTAB-208ENST00000550718 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
GNPTAB-208ENST00000550718 NXPE3Q969Y0 559 aa9.86□□□□□ -0.83
GNPTAB-208ENST00000550718 KLHDC7BQ96G42 594 aa9.86□□□□□ -0.83
GNPTAB-208ENST00000550718 CARD10Q9BWT7 1032 aa9.86□□□□□ -0.83
GNPTAB-208ENST00000550718 EREGO14944 169 aa9.85□□□□□ -0.83
GNPTAB-208ENST00000550718 ADAM11O75078 769 aa9.85□□□□□ -0.83
GNPTAB-208ENST00000550718 ACPPP15309 386 aa9.85□□□□□ -0.83
GNPTAB-208ENST00000550718 FSTP19883 344 aa9.85□□□□□ -0.83
GNPTAB-208ENST00000550718 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
GNPTAB-208ENST00000550718 BSNDQ8WZ55 320 aa9.85□□□□□ -0.83
GNPTAB-208ENST00000550718 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
GNPTAB-208ENST00000550718 OSMRQ99650 979 aa9.85□□□□□ -0.83
GNPTAB-208ENST00000550718 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP9.85□□□□□ -0.83
GNPTAB-208ENST00000550718 RAXQ9Y2V3 346 aa9.85□□□□□ -0.83
GNPTAB-208ENST00000550718 DHX15O43143 795 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
GNPTAB-208ENST00000550718 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
GNPTAB-208ENST00000550718 CDC25BP30305 580 aa9.84□□□□□ -0.83
GNPTAB-208ENST00000550718 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa9.84□□□□□ -0.83
GNPTAB-208ENST00000550718 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
GNPTAB-208ENST00000550718 ICMTO60725 284 aa9.83□□□□□ -0.84
GNPTAB-208ENST00000550718 ABL1P00519 1130 aa9.83□□□□□ -0.84
GNPTAB-208ENST00000550718 ARL4DP49703 201 aa9.83□□□□□ -0.84
GNPTAB-208ENST00000550718 ANKRD34AQ69YU3 496 aa9.83□□□□□ -0.84
GNPTAB-208ENST00000550718 ARMC10Q8N2F6 343 aa9.83□□□□□ -0.84
GNPTAB-208ENST00000550718 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
GNPTAB-208ENST00000550718 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa9.83□□□□□ -0.84
GNPTAB-208ENST00000550718 CARNS1A5YM72 827 aa9.82□□□□□ -0.84
GNPTAB-208ENST00000550718 C19orf57Q0VDD7 668 aa9.82□□□□□ -0.84
GNPTAB-208ENST00000550718 HHIPQ96QV1 700 aa9.82□□□□□ -0.84
GNPTAB-208ENST00000550718 RNF208Q9H0X6 261 aa9.82□□□□□ -0.84
GNPTAB-208ENST00000550718 STOML1Q9UBI4 398 aa9.82□□□□□ -0.84
GNPTAB-208ENST00000550718 MEGF11A6BM72 1044 aa9.81□□□□□ -0.84
GNPTAB-208ENST00000550718 VN1R5Q7Z5H4 357 aa9.81□□□□□ -0.84
GNPTAB-208ENST00000550718 MYRFLQ96LU7 910 aa9.81□□□□□ -0.84
GNPTAB-208ENST00000550718 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa9.81□□□□□ -0.84
GNPTAB-208ENST00000550718 CCDC87Q9NVE4 849 aa9.81□□□□□ -0.84
GNPTAB-208ENST00000550718 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
GNPTAB-208ENST00000550718 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
GNPTAB-208ENST00000550718 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
GNPTAB-208ENST00000550718 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
GNPTAB-208ENST00000550718 NBPF11Q86T75 865 aa9.8□□□□□ -0.84
GNPTAB-208ENST00000550718 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
GNPTAB-208ENST00000550718 TRPA1O75762 1119 aa9.79□□□□□ -0.84
GNPTAB-208ENST00000550718 IGLV1-40P01703 118 aa9.79□□□□□ -0.84
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