RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550208.1

BRF1-216, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 3

Gene BRF1, Length 1,040 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-216	ENST00000550208	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	28.01	■■■□□ 2.07
BRF1-216	ENST00000550208		A0A1B0GUL6	1792 aa		28.01	■■■□□ 2.07
BRF1-216	ENST00000550208	POTEC	B2RU33	542 aa		28	■■■□□ 2.07
BRF1-216	ENST00000550208	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		28	■■■□□ 2.07
BRF1-216	ENST00000550208	GPC2	Q8N158	579 aa		28	■■■□□ 2.07
BRF1-216	ENST00000550208	CEP126	Q9P2H0	1117 aa		27.99	■■■□□ 2.07
BRF1-216	ENST00000550208	COA1	Q9GZY4	146 aa		27.98	■■■□□ 2.07
BRF1-216	ENST00000550208	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	27.97	■■■□□ 2.07
BRF1-216	ENST00000550208	TNIP1	Q15025	636 aa		27.97	■■■□□ 2.07
BRF1-216	ENST00000550208	PODN	Q7Z5L7	613 aa		27.97	■■■□□ 2.07
BRF1-216	ENST00000550208	CRBN	Q96SW2	442 aa		27.97	■■■□□ 2.07
BRF1-216	ENST00000550208	PSMD14	O00487	310 aa		27.96	■■■□□ 2.07
BRF1-216	ENST00000550208	FGFR2	P21802	821 aa		27.96	■■■□□ 2.07
BRF1-216	ENST00000550208	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	27.96	■■■□□ 2.07
BRF1-216	ENST00000550208	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	27.96	■■■□□ 2.07
BRF1-216	ENST00000550208	CD209	Q9NNX6	404 aa		27.96	■■■□□ 2.07
BRF1-216	ENST00000550208	KIF3C	O14782	793 aa		27.95	■■■□□ 2.06
BRF1-216	ENST00000550208	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	27.95	■■■□□ 2.06
BRF1-216	ENST00000550208	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	27.95	■■■□□ 2.06
BRF1-216	ENST00000550208	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		27.95	■■■□□ 2.06
BRF1-216	ENST00000550208	GYG1	P46976	350 aa		27.94	■■■□□ 2.06
BRF1-216	ENST00000550208	TFCP2	Q12800	502 aa		27.94	■■■□□ 2.06
BRF1-216	ENST00000550208	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	27.94	■■■□□ 2.06
BRF1-216	ENST00000550208	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	27.94	■■■□□ 2.06
BRF1-216	ENST00000550208	WDR90	Q96KV7	1748 aa		27.93	■■■□□ 2.06
BRF1-216	ENST00000550208	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	27.93	■■■□□ 2.06
BRF1-216	ENST00000550208	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	27.93	■■■□□ 2.06
BRF1-216	ENST00000550208	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	27.93	■■■□□ 2.06
BRF1-216	ENST00000550208	SCN9A	Q15858	1988 aa		27.93	■■■□□ 2.06
BRF1-216	ENST00000550208	SASH1	O94885	1247 aa		27.92	■■■□□ 2.06
BRF1-216	ENST00000550208	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	27.92	■■■□□ 2.06
BRF1-216	ENST00000550208	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	27.92	■■■□□ 2.06
BRF1-216	ENST00000550208	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	27.92	■■■□□ 2.06
BRF1-216	ENST00000550208	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		27.92	■■■□□ 2.06
BRF1-216	ENST00000550208	LPIN2	Q92539	896 aa		27.92	■■■□□ 2.06
BRF1-216	ENST00000550208	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	27.91	■■■□□ 2.06
BRF1-216	ENST00000550208	ATP2B3	Q16720	1220 aa		27.91	■■■□□ 2.06
BRF1-216	ENST00000550208	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		27.91	■■■□□ 2.06
BRF1-216	ENST00000550208	USP17L3	A6NCW0	530 aa		27.9	■■■□□ 2.06
BRF1-216	ENST00000550208	USP17L4	A6NCW7	530 aa		27.9	■■■□□ 2.06
BRF1-216	ENST00000550208	SLC5A1	P13866	664 aa		27.9	■■■□□ 2.06
BRF1-216	ENST00000550208	IL1R1	P14778	569 aa		27.9	■■■□□ 2.06
BRF1-216	ENST00000550208	SCNN1D	P51172	638 aa		27.9	■■■□□ 2.06
BRF1-216	ENST00000550208	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		27.9	■■■□□ 2.06
BRF1-216	ENST00000550208	EPS15	P42566	896 aa		27.89	■■■□□ 2.06
BRF1-216	ENST00000550208	BCAM	P50895	628 aa		27.89	■■■□□ 2.06
BRF1-216	ENST00000550208	TIMM10	P62072	90 aa		27.89	■■■□□ 2.06
BRF1-216	ENST00000550208	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	27.89	■■■□□ 2.06
BRF1-216	ENST00000550208	FBXW7	Q969H0	707 aa		27.89	■■■□□ 2.06
BRF1-216	ENST00000550208	HACL1	Q9UJ83	578 aa		27.89	■■■□□ 2.06
BRF1-216	ENST00000550208	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		27.88	■■■□□ 2.05
BRF1-216	ENST00000550208	HMMR	O75330	724 aa		27.88	■■■□□ 2.05
BRF1-216	ENST00000550208	GTF2I	P78347	998 aa		27.88	■■■□□ 2.05
BRF1-216	ENST00000550208	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		27.88	■■■□□ 2.05
BRF1-216	ENST00000550208	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		27.88	■■■□□ 2.05
BRF1-216	ENST00000550208	MXD3	Q9BW11	206 aa		27.88	■■■□□ 2.05
BRF1-216	ENST00000550208	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	27.87	■■■□□ 2.05
BRF1-216	ENST00000550208	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	27.87	■■■□□ 2.05
BRF1-216	ENST00000550208	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		27.87	■■■□□ 2.05
BRF1-216	ENST00000550208	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		27.87	■■■□□ 2.05
BRF1-216	ENST00000550208	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		27.87	■■■□□ 2.05
BRF1-216	ENST00000550208	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	27.86	■■■□□ 2.05
BRF1-216	ENST00000550208	DACT2	Q5SW24	774 aa		27.86	■■■□□ 2.05
BRF1-216	ENST00000550208	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		27.86	■■■□□ 2.05
BRF1-216	ENST00000550208	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	27.86	■■■□□ 2.05
BRF1-216	ENST00000550208	VPS37D	Q86XT2	251 aa		27.86	■■■□□ 2.05
BRF1-216	ENST00000550208	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	27.86	■■■□□ 2.05
BRF1-216	ENST00000550208	SHTN1	A0MZ66	631 aa		27.85	■■■□□ 2.05
BRF1-216	ENST00000550208	ADORA1	P30542	326 aa		27.85	■■■□□ 2.05
BRF1-216	ENST00000550208	EPHX2	P34913	555 aa		27.85	■■■□□ 2.05
BRF1-216	ENST00000550208	DPF2	Q92785	391 aa		27.85	■■■□□ 2.05
BRF1-216	ENST00000550208	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	27.85	■■■□□ 2.05
BRF1-216	ENST00000550208	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		27.85	■■■□□ 2.05
BRF1-216	ENST00000550208		A0A1B0GUL7	405 aa		27.84	■■■□□ 2.05
BRF1-216	ENST00000550208	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	27.84	■■■□□ 2.05
BRF1-216	ENST00000550208	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	27.84	■■■□□ 2.05
BRF1-216	ENST00000550208	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		27.84	■■■□□ 2.05
BRF1-216	ENST00000550208	JAG2	Q9Y219	1238 aa		27.84	■■■□□ 2.05
BRF1-216	ENST00000550208	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		27.83	■■■□□ 2.05
BRF1-216	ENST00000550208	GML	Q99445	158 aa		27.83	■■■□□ 2.05
BRF1-216	ENST00000550208	SCN4A	P35499	1836 aa		27.83	■■■□□ 2.05
BRF1-216	ENST00000550208	MICALL2	Q8IY33	904 aa		27.82	■■■□□ 2.04
BRF1-216	ENST00000550208	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		27.82	■■■□□ 2.04
BRF1-216	ENST00000550208	XAGE2	Q96GT9	111 aa		27.82	■■■□□ 2.04
BRF1-216	ENST00000550208	PSME4	Q14997	1843 aa		27.81	■■■□□ 2.04
BRF1-216	ENST00000550208		H7C1D1	291 aa		27.8	■■■□□ 2.04
BRF1-216	ENST00000550208	TOMM70	O94826	608 aa		27.8	■■■□□ 2.04
BRF1-216	ENST00000550208	POTEI	P0CG38	1075 aa		27.8	■■■□□ 2.04
BRF1-216	ENST00000550208	POTEJ	P0CG39	1038 aa		27.8	■■■□□ 2.04
BRF1-216	ENST00000550208	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	27.8	■■■□□ 2.04
BRF1-216	ENST00000550208	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		27.8	■■■□□ 2.04
BRF1-216	ENST00000550208	GPR108	Q9NPR9	543 aa		27.8	■■■□□ 2.04
BRF1-216	ENST00000550208	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		27.8	■■■□□ 2.04
BRF1-216	ENST00000550208	APBB1	O00213	710 aa		27.79	■■■□□ 2.04
BRF1-216	ENST00000550208	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	27.79	■■■□□ 2.04
BRF1-216	ENST00000550208	PHKA1	P46020	1223 aa		27.79	■■■□□ 2.04
BRF1-216	ENST00000550208	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	27.79	■■■□□ 2.04
BRF1-216	ENST00000550208	TNNI3K	Q59H18	835 aa		27.79	■■■□□ 2.04
BRF1-216	ENST00000550208	CERS5	Q8N5B7	392 aa		27.79	■■■□□ 2.04
BRF1-216	ENST00000550208	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	27.79	■■■□□ 2.04

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