RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549400.1

PTPRB-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRB, Length 552 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-207ENST00000549400 FAM210AQ96ND0 272 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 CRBNQ96SW2 442 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 PHOX2BQ99453 314 aa4.72□□□□□ -1.65
PTPRB-207ENST00000549400 NUDT12Q9BQG2 462 aa4.72□□□□□ -1.65
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PTPRB-207ENST00000549400 SPACA7Q96KW9 195 aa4.71□□□□□ -1.66
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PTPRB-207ENST00000549400 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRB-207ENST00000549400 GGNBP2Q9H3C7 697 aa4.71□□□□□ -1.66
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PTPRB-207ENST00000549400 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
PTPRB-207ENST00000549400 BCAR3O75815 825 aa4.68□□□□□ -1.66
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