RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543473.1

SUDS3-204, Transcript of SDS3 homolog, SIN3A corepressor complex component, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SUDS3, Length 4,897 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUDS3-204ENST00000543473 IQCA1Q86XH1 822 aa22.15■■□□□ 1.14
SUDS3-204ENST00000543473 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
SUDS3-204ENST00000543473 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa22.14■■□□□ 1.14
SUDS3-204ENST00000543473 MAATS1Q7Z4T9 603 aa22.14■■□□□ 1.14
SUDS3-204ENST00000543473 INCENPQ9NQS7 918 aa22.14■■□□□ 1.14
SUDS3-204ENST00000543473 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
SUDS3-204ENST00000543473 ATP2B2Q01814 1243 aa22.14■■□□□ 1.13
SUDS3-204ENST00000543473 MICALL1Q8N3F8 863 aa22.14■■□□□ 1.13
SUDS3-204ENST00000543473 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
SUDS3-204ENST00000543473 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
SUDS3-204ENST00000543473 AFMP43652 599 aa22.14■■□□□ 1.13
SUDS3-204ENST00000543473 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
SUDS3-204ENST00000543473 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
SUDS3-204ENST00000543473 NLRP5P59047 1200 aa22.13■■□□□ 1.13
SUDS3-204ENST00000543473 IP6K1Q92551 441 aa22.13■■□□□ 1.13
SUDS3-204ENST00000543473 GRM8O00222 908 aa22.13■■□□□ 1.13
SUDS3-204ENST00000543473 HSF2BPO75031 334 aa22.13■■□□□ 1.13
SUDS3-204ENST00000543473 KRBA2Q6ZNG9 492 aa22.13■■□□□ 1.13
SUDS3-204ENST00000543473 PTPRTO14522 1441 aa22.13■■□□□ 1.13
SUDS3-204ENST00000543473 SPAG1Q07617 926 aa22.13■■□□□ 1.13
SUDS3-204ENST00000543473 A0A1B0GVL5 298 aa22.13■■□□□ 1.13
SUDS3-204ENST00000543473 SGSM2O43147 1006 aa22.12■■□□□ 1.13
SUDS3-204ENST00000543473 APOBRQ0VD83 1088 aa22.12■■□□□ 1.13
SUDS3-204ENST00000543473 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
SUDS3-204ENST00000543473 TSG101Q99816 390 aa22.12■■□□□ 1.13
SUDS3-204ENST00000543473 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SUDS3-204ENST00000543473 EBAG9O00559 213 aa22.12■■□□□ 1.13
SUDS3-204ENST00000543473 RHOXF2BP0C7M4 288 aa22.12■■□□□ 1.13
SUDS3-204ENST00000543473 NBPF11Q86T75 865 aa22.12■■□□□ 1.13
SUDS3-204ENST00000543473 RHOXF2Q9BQY4 288 aa22.12■■□□□ 1.13
SUDS3-204ENST00000543473 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa22.12■■□□□ 1.13
SUDS3-204ENST00000543473 AKR1B10O60218 316 aa22.12■■□□□ 1.13
SUDS3-204ENST00000543473 PPP2R3AQ06190 1150 aa22.12■■□□□ 1.13
SUDS3-204ENST00000543473 ATL3Q6DD88 541 aa22.12■■□□□ 1.13
SUDS3-204ENST00000543473 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SUDS3-204ENST00000543473 ZBTB43O43298 467 aa22.11■■□□□ 1.13
SUDS3-204ENST00000543473 G2E3Q7L622 706 aa22.11■■□□□ 1.13
SUDS3-204ENST00000543473 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SUDS3-204ENST00000543473 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SUDS3-204ENST00000543473 COPS6Q7L5N1 327 aa22.11■■□□□ 1.13
SUDS3-204ENST00000543473 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SUDS3-204ENST00000543473 VPS36Q86VN1 386 aa22.11■■□□□ 1.13
SUDS3-204ENST00000543473 XAGE3Q8WTP9 111 aa22.11■■□□□ 1.13
SUDS3-204ENST00000543473 RAD50Q92878 1312 aa22.11■■□□□ 1.13
SUDS3-204ENST00000543473 TUBBP07437 444 aa22.11■■□□□ 1.13
SUDS3-204ENST00000543473 MYL5Q02045 173 aa22.11■■□□□ 1.13
SUDS3-204ENST00000543473 ZNF569Q5MCW4 686 aa22.11■■□□□ 1.13
SUDS3-204ENST00000543473 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
SUDS3-204ENST00000543473 RRAGBQ5VZM2 374 aa22.11■■□□□ 1.13
SUDS3-204ENST00000543473 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa22.11■■□□□ 1.13
SUDS3-204ENST00000543473 TICAM2Q86XR7 235 aa22.1■■□□□ 1.13
SUDS3-204ENST00000543473 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
SUDS3-204ENST00000543473 CHAMP1Q96JM3 812 aa22.1■■□□□ 1.13
SUDS3-204ENST00000543473 CFAP74Q9C0B2 1584 aa22.1■■□□□ 1.13
SUDS3-204ENST00000543473 DTNBO60941 627 aa22.1■■□□□ 1.13
SUDS3-204ENST00000543473 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
SUDS3-204ENST00000543473 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP22.1■■□□□ 1.13
SUDS3-204ENST00000543473 UBA7P41226 1012 aa22.1■■□□□ 1.13
SUDS3-204ENST00000543473 HDXQ7Z353 690 aa22.1■■□□□ 1.13
SUDS3-204ENST00000543473 CATIPQ7Z7H3 387 aa22.1■■□□□ 1.13
SUDS3-204ENST00000543473 TRIM47Q96LD4 638 aa22.1■■□□□ 1.13
SUDS3-204ENST00000543473 CARD6Q9BX69 1037 aa22.1■■□□□ 1.13
SUDS3-204ENST00000543473 IL13P35225 146 aa22.09■■□□□ 1.13
SUDS3-204ENST00000543473 KSR2Q6VAB6 950 aa22.09■■□□□ 1.13
SUDS3-204ENST00000543473 GOPCQ9HD26 462 aa22.09■■□□□ 1.13
SUDS3-204ENST00000543473 ZNF521Q96K83 1311 aa22.09■■□□□ 1.13
SUDS3-204ENST00000543473 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
SUDS3-204ENST00000543473 CHST3Q7LGC8 479 aa22.09■■□□□ 1.13
SUDS3-204ENST00000543473 MLH3Q9UHC1 1453 aa22.09■■□□□ 1.13
SUDS3-204ENST00000543473 ANKRD62A6NC57 917 aa22.09■■□□□ 1.13
SUDS3-204ENST00000543473 PREX2Q70Z35 1606 aa22.08■■□□□ 1.13
SUDS3-204ENST00000543473 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
SUDS3-204ENST00000543473 HSPA4P34932 840 aa22.08■■□□□ 1.13
SUDS3-204ENST00000543473 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
SUDS3-204ENST00000543473 IL2RBP14784 551 aa22.08■■□□□ 1.12
SUDS3-204ENST00000543473 BRAPQ7Z569 592 aa22.08■■□□□ 1.12
SUDS3-204ENST00000543473 FAM114A1Q8IWE2 563 aa22.08■■□□□ 1.12
SUDS3-204ENST00000543473 MAP3K5Q99683 1374 aa22.08■■□□□ 1.12
SUDS3-204ENST00000543473 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa22.07■■□□□ 1.12
SUDS3-204ENST00000543473 PRC1O43663 620 aa22.07■■□□□ 1.12
SUDS3-204ENST00000543473 OPA1O60313 960 aa22.07■■□□□ 1.12
SUDS3-204ENST00000543473 RPS6KB1P23443 525 aa22.07■■□□□ 1.12
SUDS3-204ENST00000543473 MFSD6Q6ZSS7 791 aa22.07■■□□□ 1.12
SUDS3-204ENST00000543473 TMCO5BA8MYB1 307 aa22.07■■□□□ 1.12
SUDS3-204ENST00000543473 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
SUDS3-204ENST00000543473 PLCD3Q8N3E9 789 aa22.07■■□□□ 1.12
SUDS3-204ENST00000543473 KAT6BQ8WYB5 2073 aa22.07■■□□□ 1.12
SUDS3-204ENST00000543473 CCDC96Q2M329 555 aa22.07■■□□□ 1.12
SUDS3-204ENST00000543473 ATRIPQ8WXE1 791 aa22.07■■□□□ 1.12
SUDS3-204ENST00000543473 USP5P45974 858 aa22.06■■□□□ 1.12
SUDS3-204ENST00000543473 RMND1Q9NWS8 449 aa22.06■■□□□ 1.12
SUDS3-204ENST00000543473 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
SUDS3-204ENST00000543473 LINS1Q8NG48 757 aa22.06■■□□□ 1.12
SUDS3-204ENST00000543473 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa22.06■■□□□ 1.12
SUDS3-204ENST00000543473 DRC1Q96MC2 740 aa22.06■■□□□ 1.12
SUDS3-204ENST00000543473 AOX1Q06278 1338 aa22.06■■□□□ 1.12
SUDS3-204ENST00000543473 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
SUDS3-204ENST00000543473 ACSBG1Q96GR2 724 aa22.06■■□□□ 1.12
SUDS3-204ENST00000543473 GUCA1BQ9UMX6 200 aa22.06■■□□□ 1.12
SUDS3-204ENST00000543473 IDEP14735 1019 aa22.05■■□□□ 1.12
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