RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541134.5

HIVEP1-208, Transcript of human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 1, human

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene HIVEP1, Length 9,023 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HIVEP1-208	ENST00000541134	MRE11	P49959	708 aa		13.64	□□□□□ -0.23
HIVEP1-208	ENST00000541134	CTDSPL2	Q05D32	466 aa		13.64	□□□□□ -0.23
HIVEP1-208	ENST00000541134	CCDC174	Q6PII3	467 aa		13.64	□□□□□ -0.23
HIVEP1-208	ENST00000541134	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		13.64	□□□□□ -0.23
HIVEP1-208	ENST00000541134	CCDC97	Q96F63	343 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
HIVEP1-208	ENST00000541134	BACH1	O14867	736 aa		13.63	□□□□□ -0.23
HIVEP1-208	ENST00000541134	EIF4A1	P60842	406 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
HIVEP1-208	ENST00000541134	RRP36	Q96EU6	259 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
HIVEP1-208	ENST00000541134	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		13.63	□□□□□ -0.23
HIVEP1-208	ENST00000541134	PLCG2	P16885	1265 aa		13.63	□□□□□ -0.23
HIVEP1-208	ENST00000541134	GYG1	P46976	350 aa		13.63	□□□□□ -0.23
HIVEP1-208	ENST00000541134	TTC6	Q86TZ1	520 aa		13.63	□□□□□ -0.23
HIVEP1-208	ENST00000541134	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		13.63	□□□□□ -0.23
HIVEP1-208	ENST00000541134	MYCL	P12524	364 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
HIVEP1-208	ENST00000541134	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
HIVEP1-208	ENST00000541134	TNNT3	P45378	269 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
HIVEP1-208	ENST00000541134	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		13.63	□□□□□ -0.23
HIVEP1-208	ENST00000541134	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		13.63	□□□□□ -0.23
HIVEP1-208	ENST00000541134	DDX39A	O00148	427 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
HIVEP1-208	ENST00000541134	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
HIVEP1-208	ENST00000541134	TDRD12	Q587J7	1177 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
HIVEP1-208	ENST00000541134	PLEKHG3	A1L390	1219 aa		13.63	□□□□□ -0.23
HIVEP1-208	ENST00000541134	ALDH1B1	P30837	517 aa		13.63	□□□□□ -0.23
HIVEP1-208	ENST00000541134	CCDC150	Q8NCX0	1101 aa		13.63	□□□□□ -0.23
HIVEP1-208	ENST00000541134	CHMP2A	O43633	222 aa		13.62	□□□□□ -0.23
HIVEP1-208	ENST00000541134	PDE6B	P35913	854 aa		13.62	□□□□□ -0.23
HIVEP1-208	ENST00000541134	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		13.62	□□□□□ -0.23
HIVEP1-208	ENST00000541134	CNNM2	Q9H8M5	875 aa		13.62	□□□□□ -0.23
HIVEP1-208	ENST00000541134	TNNI3K	Q59H18	835 aa		13.62	□□□□□ -0.23
HIVEP1-208	ENST00000541134	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		13.62	□□□□□ -0.23
HIVEP1-208	ENST00000541134	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
HIVEP1-208	ENST00000541134	CBFA2T2	O43439	604 aa		13.62	□□□□□ -0.23
HIVEP1-208	ENST00000541134	POTEJ	P0CG39	1038 aa		13.62	□□□□□ -0.23
HIVEP1-208	ENST00000541134	TTF2	Q9UNY4	1162 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
HIVEP1-208	ENST00000541134	POLR3A	O14802	1390 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
HIVEP1-208	ENST00000541134	PZP	P20742	1482 aa		13.62	□□□□□ -0.23
HIVEP1-208	ENST00000541134	TBCA	O75347	108 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
HIVEP1-208	ENST00000541134	DES	P17661	470 aa		13.62	□□□□□ -0.23
HIVEP1-208	ENST00000541134	ZAP70	P43403	619 aa		13.62	□□□□□ -0.23
HIVEP1-208	ENST00000541134	USH1G	Q495M9	461 aa		13.62	□□□□□ -0.23
HIVEP1-208	ENST00000541134	AFF2	P51816	1311 aa		13.62	□□□□□ -0.23
HIVEP1-208	ENST00000541134	FKBP15	Q5T1M5	1219 aa		13.62	□□□□□ -0.23
HIVEP1-208	ENST00000541134	PSMD1	Q99460	953 aa		13.62	□□□□□ -0.23
HIVEP1-208	ENST00000541134	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
HIVEP1-208	ENST00000541134	USP40	Q9NVE5	1235 aa		13.62	□□□□□ -0.23
HIVEP1-208	ENST00000541134	SRP68	Q9UHB9	627 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
HIVEP1-208	ENST00000541134	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		13.62	□□□□□ -0.23
HIVEP1-208	ENST00000541134	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
HIVEP1-208	ENST00000541134	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		13.61	□□□□□ -0.23
HIVEP1-208	ENST00000541134	CENPH	Q9H3R5	247 aa		13.61	□□□□□ -0.23
HIVEP1-208	ENST00000541134	CLRN2	A0PK11	232 aa		13.61	□□□□□ -0.23
HIVEP1-208	ENST00000541134	SMTNL1	A8MU46	457 aa		13.61	□□□□□ -0.23
HIVEP1-208	ENST00000541134	HARS	P12081	509 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
HIVEP1-208	ENST00000541134	ZBTB7A	O95365	584 aa		13.61	□□□□□ -0.23
HIVEP1-208	ENST00000541134	MCM7	P33993	719 aa		13.61	□□□□□ -0.23
HIVEP1-208	ENST00000541134	FERMT2	Q96AC1	680 aa		13.61	□□□□□ -0.23
HIVEP1-208	ENST00000541134	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
HIVEP1-208	ENST00000541134	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
HIVEP1-208	ENST00000541134	STX6	O43752	255 aa		13.61	□□□□□ -0.23
HIVEP1-208	ENST00000541134	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		13.61	□□□□□ -0.23
HIVEP1-208	ENST00000541134	NOD1	Q9Y239	953 aa		13.61	□□□□□ -0.23
HIVEP1-208	ENST00000541134	FAM47A	Q5JRC9	791 aa		13.61	□□□□□ -0.23
HIVEP1-208	ENST00000541134	CTNNBL1	Q8WYA6	563 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
HIVEP1-208	ENST00000541134	FAM193A	P78312	1265 aa		13.6	□□□□□ -0.23
HIVEP1-208	ENST00000541134	MAEA	Q7L5Y9	396 aa		13.6	□□□□□ -0.23
HIVEP1-208	ENST00000541134	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		13.6	□□□□□ -0.23
HIVEP1-208	ENST00000541134	ZBTB1	Q9Y2K1	713 aa		13.6	□□□□□ -0.23
HIVEP1-208	ENST00000541134	LUC7L	Q9NQ29	371 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
HIVEP1-208	ENST00000541134	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
HIVEP1-208	ENST00000541134	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		13.6	□□□□□ -0.23
HIVEP1-208	ENST00000541134	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		13.6	□□□□□ -0.23
HIVEP1-208	ENST00000541134	RBM27	Q9P2N5	1060 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
HIVEP1-208	ENST00000541134	TCIRG1	Q13488	830 aa		13.6	□□□□□ -0.23
HIVEP1-208	ENST00000541134	TBC1D2	Q9BYX2	928 aa		13.6	□□□□□ -0.23
HIVEP1-208	ENST00000541134	MAPKBP1	O60336	1514 aa		13.6	□□□□□ -0.23
HIVEP1-208	ENST00000541134	MCM4	P33991	863 aa		13.6	□□□□□ -0.23
HIVEP1-208	ENST00000541134	SMIM5	Q71RC9	77 aa		13.6	□□□□□ -0.23
HIVEP1-208	ENST00000541134	MYL10	Q9BUA6	226 aa		13.6	□□□□□ -0.23
HIVEP1-208	ENST00000541134	GCKR	Q14397	625 aa		13.6	□□□□□ -0.23
HIVEP1-208	ENST00000541134	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		13.6	□□□□□ -0.23
HIVEP1-208	ENST00000541134	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		13.6	□□□□□ -0.23
HIVEP1-208	ENST00000541134	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		13.6	□□□□□ -0.23
HIVEP1-208	ENST00000541134	PHACTR2	O75167	634 aa		13.59	□□□□□ -0.23
HIVEP1-208	ENST00000541134	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
HIVEP1-208	ENST00000541134	C6orf50	Q9HD87	102 aa		13.59	□□□□□ -0.23
HIVEP1-208	ENST00000541134	IVNS1ABP	Q9Y6Y0	642 aa		13.59	□□□□□ -0.23
HIVEP1-208	ENST00000541134	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		13.59	□□□□□ -0.23
HIVEP1-208	ENST00000541134	DHX37	Q8IY37	1157 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
HIVEP1-208	ENST00000541134	ZNF397	Q8NF99	534 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
HIVEP1-208	ENST00000541134	TMX3	Q96JJ7	454 aa		13.59	□□□□□ -0.23
HIVEP1-208	ENST00000541134	BRINP3	Q76B58	766 aa		13.59	□□□□□ -0.23
HIVEP1-208	ENST00000541134	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		13.59	□□□□□ -0.23
HIVEP1-208	ENST00000541134	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
HIVEP1-208	ENST00000541134	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		13.59	□□□□□ -0.23
HIVEP1-208	ENST00000541134	NEO1	Q92859	1461 aa		13.59	□□□□□ -0.23
HIVEP1-208	ENST00000541134	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
HIVEP1-208	ENST00000541134	ZNF354C	Q86Y25	554 aa		13.59	□□□□□ -0.23
HIVEP1-208	ENST00000541134	TAF3	Q5VWG9	929 aa		13.59	□□□□□ -0.23
HIVEP1-208	ENST00000541134	NSMF	Q6X4W1	530 aa		13.59	□□□□□ -0.23
HIVEP1-208	ENST00000541134	ZFYVE9	O95405	1425 aa		13.59	□□□□□ -0.23

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