RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538020.1

LMO3-218, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 4

Gene LMO3, Length 622 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-218ENST00000538020 MPNDQ8N594 471 aa14.63□□□□□ -0.07
LMO3-218ENST00000538020 ATP5JP18859 108 aa14.62□□□□□ -0.07
LMO3-218ENST00000538020 ADORA1P30542 326 aa14.62□□□□□ -0.07
LMO3-218ENST00000538020 CCDC93Q567U6 631 aa14.62□□□□□ -0.07
LMO3-218ENST00000538020 CAVIN4Q5BKX8 364 aa14.62□□□□□ -0.07
LMO3-218ENST00000538020 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
LMO3-218ENST00000538020 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
LMO3-218ENST00000538020 PI4K2BQ8TCG2 481 aa14.62□□□□□ -0.07
LMO3-218ENST00000538020 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP14.62□□□□□ -0.07
LMO3-218ENST00000538020 C7orf43Q8WVR3 580 aa14.62□□□□□ -0.07
LMO3-218ENST00000538020 SNAP23O00161 211 aa14.61□□□□□ -0.07
LMO3-218ENST00000538020 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa14.61□□□□□ -0.07
LMO3-218ENST00000538020 BMP2KLQ5H9B9 411 aa14.61□□□□□ -0.07
LMO3-218ENST00000538020 TSHZ3Q63HK5 1081 aa14.61□□□□□ -0.07
LMO3-218ENST00000538020 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
LMO3-218ENST00000538020 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
LMO3-218ENST00000538020 EYA3Q99504 573 aa14.61□□□□□ -0.07
LMO3-218ENST00000538020 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
LMO3-218ENST00000538020 MED23Q9ULK4 1368 aa14.6□□□□□ -0.07
LMO3-218ENST00000538020 C6orf229H3BNL8 230 aa14.6□□□□□ -0.07
LMO3-218ENST00000538020 CCDC102BQ68D86 513 aa14.6□□□□□ -0.07
LMO3-218ENST00000538020 VPS37DQ86XT2 251 aa14.6□□□□□ -0.07
LMO3-218ENST00000538020 RTKN2Q8IZC4 609 aa14.6□□□□□ -0.07
LMO3-218ENST00000538020 SUPT20HQ8NEM7 779 aa14.6□□□□□ -0.07
LMO3-218ENST00000538020 TBC1D16Q8TBP0 767 aa14.6□□□□□ -0.07
LMO3-218ENST00000538020 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
LMO3-218ENST00000538020 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
LMO3-218ENST00000538020 DUOX1Q9NRD9 1551 aa14.6□□□□□ -0.07
LMO3-218ENST00000538020 C21orf2O43822 256 aa14.59□□□□□ -0.07
LMO3-218ENST00000538020 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
LMO3-218ENST00000538020 ZNF804AQ7Z570 1209 aa14.59□□□□□ -0.07
LMO3-218ENST00000538020 SLC51AQ86UW1 340 aa14.59□□□□□ -0.07
LMO3-218ENST00000538020 NLGN2Q8NFZ4 835 aa14.59□□□□□ -0.07
LMO3-218ENST00000538020 POLLQ9UGP5 575 aa14.59□□□□□ -0.07
LMO3-218ENST00000538020 SNED1Q8TER0 1413 aa14.58□□□□□ -0.07
LMO3-218ENST00000538020 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa14.58□□□□□ -0.08
LMO3-218ENST00000538020 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
LMO3-218ENST00000538020 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
LMO3-218ENST00000538020 PHKA1P46020 1223 aa14.58□□□□□ -0.08
LMO3-218ENST00000538020 OLFM4Q6UX06 510 aa14.58□□□□□ -0.08
LMO3-218ENST00000538020 FBXO33Q7Z6M2 555 aa14.58□□□□□ -0.08
LMO3-218ENST00000538020 CNTROBQ8N137 903 aa14.58□□□□□ -0.08
LMO3-218ENST00000538020 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
LMO3-218ENST00000538020 HAUS7Q99871 368 aa14.58□□□□□ -0.08
LMO3-218ENST00000538020 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
LMO3-218ENST00000538020 BOLA2Q9H3K6 86 aa14.58□□□□□ -0.08
LMO3-218ENST00000538020 IRS2Q9Y4H2 1338 aa14.58□□□□□ -0.08
LMO3-218ENST00000538020 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa14.57□□□□□ -0.08
LMO3-218ENST00000538020 SEMA3EO15041 775 aa14.57□□□□□ -0.08
LMO3-218ENST00000538020 ZBTB22O15209 634 aa14.57□□□□□ -0.08
LMO3-218ENST00000538020 GYG1P46976 350 aa14.57□□□□□ -0.08
LMO3-218ENST00000538020 BCAMP50895 628 aa14.57□□□□□ -0.08
LMO3-218ENST00000538020 PSMD1Q99460 953 aa14.57□□□□□ -0.08
LMO3-218ENST00000538020 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
LMO3-218ENST00000538020 BCS1LQ9Y276 419 aa14.57□□□□□ -0.08
LMO3-218ENST00000538020 AK9Q5TCS8 1911 aa14.56□□□□□ -0.08
LMO3-218ENST00000538020 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
LMO3-218ENST00000538020 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
LMO3-218ENST00000538020 SDSP20132 328 aa14.56□□□□□ -0.08
LMO3-218ENST00000538020 KLRK1P26718 216 aa14.56□□□□□ -0.08
LMO3-218ENST00000538020 WASHC4Q2M389 1173 aa14.56□□□□□ -0.08
LMO3-218ENST00000538020 EVI5LQ96CN4 794 aa14.56□□□□□ -0.08
LMO3-218ENST00000538020 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
LMO3-218ENST00000538020 SYT17Q9BSW7 474 aa14.56□□□□□ -0.08
LMO3-218ENST00000538020 DENND2AQ9ULE3 1009 aa14.56□□□□□ -0.08
LMO3-218ENST00000538020 MYH13Q9UKX3 1938 aa14.56□□□□□ -0.08
LMO3-218ENST00000538020 G3V3G9 751 aa14.55□□□□□ -0.08
LMO3-218ENST00000538020 MCAMP43121 646 aa14.55□□□□□ -0.08
LMO3-218ENST00000538020 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP14.55□□□□□ -0.08
LMO3-218ENST00000538020 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
LMO3-218ENST00000538020 DCAF8Q5TAQ9 597 aa14.55□□□□□ -0.08
LMO3-218ENST00000538020 RILPL2Q969X0 211 aa14.55□□□□□ -0.08
LMO3-218ENST00000538020 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
LMO3-218ENST00000538020 COA1Q9GZY4 146 aa14.55□□□□□ -0.08
LMO3-218ENST00000538020 VPS33BQ9H267 617 aa14.55□□□□□ -0.08
LMO3-218ENST00000538020 PAG1Q9NWQ8 432 aa14.55□□□□□ -0.08
LMO3-218ENST00000538020 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
LMO3-218ENST00000538020 RASGRF1Q13972 1273 aa14.54□□□□□ -0.08
LMO3-218ENST00000538020 CASC1Q6TDU7 716 aa14.54□□□□□ -0.08
LMO3-218ENST00000538020 TXNRD3Q86VQ6 643 aa14.54□□□□□ -0.08
LMO3-218ENST00000538020 SPATA5Q8NB90 893 aa14.54□□□□□ -0.08
LMO3-218ENST00000538020 WWC3Q9ULE0 1092 aa14.54□□□□□ -0.08
LMO3-218ENST00000538020 RFX7Q2KHR2 1363 aa14.54□□□□□ -0.08
LMO3-218ENST00000538020 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa14.54□□□□□ -0.08
LMO3-218ENST00000538020 AKAP11Q9UKA4 1901 aa14.54□□□□□ -0.08
LMO3-218ENST00000538020 GOLIM4O00461 696 aa14.53□□□□□ -0.08
LMO3-218ENST00000538020 RIMBP2O15034 1052 aa14.53□□□□□ -0.08
LMO3-218ENST00000538020 CDC45O75419 566 aa14.53□□□□□ -0.08
LMO3-218ENST00000538020 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
LMO3-218ENST00000538020 IL1R1P14778 569 aa14.53□□□□□ -0.08
LMO3-218ENST00000538020 ZAP70P43403 619 aa14.53□□□□□ -0.08
LMO3-218ENST00000538020 KIAA2012Q0VF49 1180 aa14.53□□□□□ -0.08
LMO3-218ENST00000538020 SCARF1Q14162 830 aa14.53□□□□□ -0.08
LMO3-218ENST00000538020 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
LMO3-218ENST00000538020 TICAM2Q86XR7 235 aa14.53□□□□□ -0.08
LMO3-218ENST00000538020 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
LMO3-218ENST00000538020 TAOK3Q9H2K8 898 aa14.53□□□□□ -0.08
LMO3-218ENST00000538020 CD209Q9NNX6 404 aa14.53□□□□□ -0.08
LMO3-218ENST00000538020 HMG20BQ9P0W2 317 aa14.53□□□□□ -0.08
LMO3-218ENST00000538020 LTBP3Q9NS15 1303 aa14.52□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.1 ms