RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534730.5

BBS1-224, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 2

Gene BBS1, Length 627 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-224	ENST00000534730		G3V3G9	751 aa		18.83	■□□□□ 0.6
BBS1-224	ENST00000534730	UFL1	O94874	794 aa		18.83	■□□□□ 0.6
BBS1-224	ENST00000534730	SLC5A1	P13866	664 aa		18.83	■□□□□ 0.6
BBS1-224	ENST00000534730	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		18.83	■□□□□ 0.6
BBS1-224	ENST00000534730	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		18.83	■□□□□ 0.6
BBS1-224	ENST00000534730	DCTPP1	Q9H773	170 aa		18.83	■□□□□ 0.6
BBS1-224	ENST00000534730	TAF1	P21675	1872 aa		18.83	■□□□□ 0.6
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF804B	A4D1E1	1349 aa		18.82	■□□□□ 0.6
BBS1-224	ENST00000534730	GPSM2	P81274	684 aa		18.82	■□□□□ 0.6
BBS1-224	ENST00000534730	LRRC24	Q50LG9	513 aa		18.82	■□□□□ 0.6
BBS1-224	ENST00000534730	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		18.82	■□□□□ 0.6
BBS1-224	ENST00000534730	CHADL	Q6NUI6	762 aa		18.82	■□□□□ 0.6
BBS1-224	ENST00000534730	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		18.82	■□□□□ 0.6
BBS1-224	ENST00000534730	LPIN2	Q92539	896 aa		18.82	■□□□□ 0.6
BBS1-224	ENST00000534730	PA2G4	Q9UQ80	394 aa	Known RBP	18.82	■□□□□ 0.6
BBS1-224	ENST00000534730	WASHC4	Q2M389	1173 aa		18.81	■□□□□ 0.6
BBS1-224	ENST00000534730	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	18.81	■□□□□ 0.6
BBS1-224	ENST00000534730	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		18.81	■□□□□ 0.6
BBS1-224	ENST00000534730	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	18.81	■□□□□ 0.6
BBS1-224	ENST00000534730	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		18.81	■□□□□ 0.6
BBS1-224	ENST00000534730	JDP2	Q8WYK2	163 aa		18.81	■□□□□ 0.6
BBS1-224	ENST00000534730	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	18.81	■□□□□ 0.6
BBS1-224	ENST00000534730	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		18.81	■□□□□ 0.6
BBS1-224	ENST00000534730	CREBZF	Q9NS37	354 aa		18.81	■□□□□ 0.6
BBS1-224	ENST00000534730	SPEF2	Q9C093	1822 aa		18.81	■□□□□ 0.6
BBS1-224	ENST00000534730	PASK	Q96RG2	1323 aa		18.8	■□□□□ 0.6
BBS1-224	ENST00000534730	MED23	Q9ULK4	1368 aa		18.8	■□□□□ 0.6
BBS1-224	ENST00000534730	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	18.79	■□□□□ 0.6
BBS1-224	ENST00000534730	ATP2B3	Q16720	1220 aa		18.79	■□□□□ 0.6
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		18.79	■□□□□ 0.6
BBS1-224	ENST00000534730	VPS37D	Q86XT2	251 aa		18.79	■□□□□ 0.6
BBS1-224	ENST00000534730	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	18.79	■□□□□ 0.6
BBS1-224	ENST00000534730	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	18.79	■□□□□ 0.6
BBS1-224	ENST00000534730	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	18.79	■□□□□ 0.6
BBS1-224	ENST00000534730	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		18.79	■□□□□ 0.6
BBS1-224	ENST00000534730	PPIP5K2	O43314	1243 aa		18.78	■□□□□ 0.6
BBS1-224	ENST00000534730	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		18.78	■□□□□ 0.6
BBS1-224	ENST00000534730	NIM1K	Q8IY84	436 aa		18.78	■□□□□ 0.6
BBS1-224	ENST00000534730	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		18.78	■□□□□ 0.6
BBS1-224	ENST00000534730	VGLL2	Q8N8G2	317 aa		18.78	■□□□□ 0.6
BBS1-224	ENST00000534730	TAF5L	O75529	589 aa		18.77	■□□□□ 0.6
BBS1-224	ENST00000534730	TFCP2	Q12800	502 aa		18.77	■□□□□ 0.6
BBS1-224	ENST00000534730	GORAB	Q5T7V8	394 aa		18.77	■□□□□ 0.6
BBS1-224	ENST00000534730	OLFM4	Q6UX06	510 aa		18.77	■□□□□ 0.6
BBS1-224	ENST00000534730	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		18.77	■□□□□ 0.6
BBS1-224	ENST00000534730	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		18.77	■□□□□ 0.6
BBS1-224	ENST00000534730	COA1	Q9GZY4	146 aa		18.77	■□□□□ 0.6
BBS1-224	ENST00000534730	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	18.77	■□□□□ 0.6
BBS1-224	ENST00000534730	POLL	Q9UGP5	575 aa		18.77	■□□□□ 0.6
BBS1-224	ENST00000534730	SNED1	Q8TER0	1413 aa		18.76	■□□□□ 0.59
BBS1-224	ENST00000534730	PODN	Q7Z5L7	613 aa		18.76	■□□□□ 0.59
BBS1-224	ENST00000534730	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	18.76	■□□□□ 0.59
BBS1-224	ENST00000534730	GPATCH3	Q96I76	525 aa		18.76	■□□□□ 0.59
BBS1-224	ENST00000534730	PPP4R2	Q9NY27	417 aa		18.76	■□□□□ 0.59
BBS1-224	ENST00000534730	CNTNAP1	P78357	1384 aa		18.76	■□□□□ 0.59
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		18.75	■□□□□ 0.59
BBS1-224	ENST00000534730	SASH1	O94885	1247 aa		18.75	■□□□□ 0.59
BBS1-224	ENST00000534730	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	18.75	■□□□□ 0.59
BBS1-224	ENST00000534730	IFIT2	P09913	472 aa	Known RBP	18.75	■□□□□ 0.59
BBS1-224	ENST00000534730	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		18.75	■□□□□ 0.59
BBS1-224	ENST00000534730		A0A1B0GUL7	405 aa		18.74	■□□□□ 0.59
BBS1-224	ENST00000534730	ZBTB22	O15209	634 aa		18.74	■□□□□ 0.59
BBS1-224	ENST00000534730	FGFR2	P21802	821 aa		18.74	■□□□□ 0.59
BBS1-224	ENST00000534730	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	18.74	■□□□□ 0.59
BBS1-224	ENST00000534730	TNNI3K	Q59H18	835 aa		18.74	■□□□□ 0.59
BBS1-224	ENST00000534730	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		18.74	■□□□□ 0.59
BBS1-224	ENST00000534730	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	18.74	■□□□□ 0.59
BBS1-224	ENST00000534730	LDHD	Q86WU2	507 aa		18.74	■□□□□ 0.59
BBS1-224	ENST00000534730	SMC5	Q8IY18	1101 aa		18.74	■□□□□ 0.59
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	18.74	■□□□□ 0.59
BBS1-224	ENST00000534730	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		18.74	■□□□□ 0.59
BBS1-224	ENST00000534730	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		18.73	■□□□□ 0.59
BBS1-224	ENST00000534730	SEMA3E	O15041	775 aa		18.73	■□□□□ 0.59
BBS1-224	ENST00000534730	FOXN1	O15353	648 aa		18.73	■□□□□ 0.59
BBS1-224	ENST00000534730	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	18.73	■□□□□ 0.59
BBS1-224	ENST00000534730	LTBP1	Q14766	1721 aa		18.73	■□□□□ 0.59
BBS1-224	ENST00000534730	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		18.72	■□□□□ 0.59
BBS1-224	ENST00000534730	APBB1	O00213	710 aa		18.72	■□□□□ 0.59
BBS1-224	ENST00000534730	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	18.72	■□□□□ 0.59
BBS1-224	ENST00000534730	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		18.72	■□□□□ 0.59
BBS1-224	ENST00000534730	AOC3	Q16853	763 aa		18.72	■□□□□ 0.59
BBS1-224	ENST00000534730	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		18.72	■□□□□ 0.59
BBS1-224	ENST00000534730	AACS	Q86V21	672 aa		18.72	■□□□□ 0.59
BBS1-224	ENST00000534730	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		18.72	■□□□□ 0.59
BBS1-224	ENST00000534730		A0A1B0GUL6	1792 aa		18.71	■□□□□ 0.59
BBS1-224	ENST00000534730	COL4A1	P02462	1669 aa		18.71	■□□□□ 0.59
BBS1-224	ENST00000534730	RIMBP2	O15034	1052 aa		18.71	■□□□□ 0.59
BBS1-224	ENST00000534730	TNIP1	Q15025	636 aa		18.71	■□□□□ 0.59
BBS1-224	ENST00000534730	SCN4A	P35499	1836 aa		18.71	■□□□□ 0.59
BBS1-224	ENST00000534730	FZD9	O00144	591 aa		18.7	■□□□□ 0.58
BBS1-224	ENST00000534730	ZNF609	O15014	1411 aa		18.7	■□□□□ 0.58
BBS1-224	ENST00000534730	IGSF3	O75054	1194 aa		18.7	■□□□□ 0.58
BBS1-224	ENST00000534730	VEGFB	P49765	207 aa		18.7	■□□□□ 0.58
BBS1-224	ENST00000534730	MMP14	P50281	582 aa		18.7	■□□□□ 0.58
BBS1-224	ENST00000534730	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		18.7	■□□□□ 0.58
BBS1-224	ENST00000534730	XAGE2	Q96GT9	111 aa		18.7	■□□□□ 0.58
BBS1-224	ENST00000534730	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		18.69	■□□□□ 0.58
BBS1-224	ENST00000534730	ECE2	O60344	883 aa		18.69	■□□□□ 0.58
BBS1-224	ENST00000534730	TIMM10	P62072	90 aa		18.69	■□□□□ 0.58
BBS1-224	ENST00000534730	TBC1D22A	Q8WUA7	517 aa		18.69	■□□□□ 0.58

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