RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533430.5

BBS1-221, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 3

Gene BBS1, Length 844 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-221	ENST00000533430	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		13.8	□□□□□ -0.2
BBS1-221	ENST00000533430	RGMB	Q6NW40	437 aa		13.8	□□□□□ -0.2
BBS1-221	ENST00000533430	RTL9	Q8NET4	1388 aa		13.8	□□□□□ -0.2
BBS1-221	ENST00000533430	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
BBS1-221	ENST00000533430	SULF1	Q8IWU6	871 aa		13.79	□□□□□ -0.2
BBS1-221	ENST00000533430	DZIP1L	Q8IYY4	767 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
BBS1-221	ENST00000533430	GOLGA6L2	Q8N9W4	650 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
BBS1-221	ENST00000533430	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
BBS1-221	ENST00000533430	GGA1	Q9UJY5	639 aa		13.79	□□□□□ -0.2
BBS1-221	ENST00000533430	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
BBS1-221	ENST00000533430	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
BBS1-221	ENST00000533430	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
BBS1-221	ENST00000533430	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
BBS1-221	ENST00000533430	PDE3A	Q14432	1141 aa		13.78	□□□□□ -0.2
BBS1-221	ENST00000533430	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		13.78	□□□□□ -0.2
BBS1-221	ENST00000533430	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		13.78	□□□□□ -0.2
BBS1-221	ENST00000533430	GGA3	Q9NZ52	723 aa		13.78	□□□□□ -0.2
BBS1-221	ENST00000533430	PTPRC	P08575	1304 aa		13.78	□□□□□ -0.2
BBS1-221	ENST00000533430	PDE8A	O60658	829 aa		13.77	□□□□□ -0.21
BBS1-221	ENST00000533430	TRPA1	O75762	1119 aa		13.77	□□□□□ -0.21
BBS1-221	ENST00000533430	NEFL	P07196	543 aa		13.77	□□□□□ -0.21
BBS1-221	ENST00000533430	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
BBS1-221	ENST00000533430	MYH3	P11055	1940 aa		13.77	□□□□□ -0.21
BBS1-221	ENST00000533430	SCARF1	Q14162	830 aa		13.77	□□□□□ -0.21
BBS1-221	ENST00000533430	FBXW7	Q969H0	707 aa		13.77	□□□□□ -0.21
BBS1-221	ENST00000533430	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
BBS1-221	ENST00000533430	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
BBS1-221	ENST00000533430	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
BBS1-221	ENST00000533430	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-221	ENST00000533430	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-221	ENST00000533430	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-221	ENST00000533430	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-221	ENST00000533430	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-221	ENST00000533430	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-221	ENST00000533430	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-221	ENST00000533430	CCDC102A	Q96A19	550 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-221	ENST00000533430	CDCA5	Q96FF9	252 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-221	ENST00000533430	PSME4	Q14997	1843 aa		13.76	□□□□□ -0.21
BBS1-221	ENST00000533430	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-221	ENST00000533430	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-221	ENST00000533430	MVP	Q14764	893 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-221	ENST00000533430	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-221	ENST00000533430	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-221	ENST00000533430	RNF186	Q9NXI6	227 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-221	ENST00000533430	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-221	ENST00000533430	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		13.75	□□□□□ -0.21
BBS1-221	ENST00000533430	INTS3	Q68E01	1043 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-221	ENST00000533430	KSR2	Q6VAB6	950 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-221	ENST00000533430	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-221	ENST00000533430	FTSJ3	Q8IY81	847 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-221	ENST00000533430	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-221	ENST00000533430	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
BBS1-221	ENST00000533430	XDH	P47989	1333 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-221	ENST00000533430	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-221	ENST00000533430	USP17L8	P0C7I0	530 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-221	ENST00000533430	ATP2B4	P23634	1241 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-221	ENST00000533430	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-221	ENST00000533430	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-221	ENST00000533430	AGBL3	Q8NEM8	1001 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-221	ENST00000533430	CSRNP1	Q96S65	589 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-221	ENST00000533430	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-221	ENST00000533430	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
BBS1-221	ENST00000533430	USP17L3	A6NCW0	530 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-221	ENST00000533430	USP17L4	A6NCW7	530 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-221	ENST00000533430	IGKV5-2	P06315	115 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-221	ENST00000533430	RGS19	P49795	217 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-221	ENST00000533430	BEND3	Q5T5X7	828 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-221	ENST00000533430	MOB2	Q70IA6	237 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-221	ENST00000533430	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-221	ENST00000533430	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-221	ENST00000533430	MXD3	Q9BW11	206 aa		13.72	□□□□□ -0.21
BBS1-221	ENST00000533430	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BBS1-221	ENST00000533430	SLC10A3	P09131	477 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BBS1-221	ENST00000533430	SOX10	P56693	466 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BBS1-221	ENST00000533430	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
BBS1-221	ENST00000533430	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BBS1-221	ENST00000533430	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
BBS1-221	ENST00000533430	MEIS3	Q99687	375 aa		13.71	□□□□□ -0.21
BBS1-221	ENST00000533430	ZBTB7B	O15156	539 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
BBS1-221	ENST00000533430	CTSW	P56202	376 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BBS1-221	ENST00000533430	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BBS1-221	ENST00000533430	PODN	Q7Z5L7	613 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BBS1-221	ENST00000533430	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BBS1-221	ENST00000533430	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BBS1-221	ENST00000533430	GREM2	Q9H772	168 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BBS1-221	ENST00000533430	C1orf115	Q9H7X2	142 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BBS1-221	ENST00000533430	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BBS1-221	ENST00000533430	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		13.7	□□□□□ -0.22
BBS1-221	ENST00000533430	MS4A1	P11836	297 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BBS1-221	ENST00000533430	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
BBS1-221	ENST00000533430	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
BBS1-221	ENST00000533430	PRKG1	Q13976	671 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BBS1-221	ENST00000533430	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BBS1-221	ENST00000533430	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BBS1-221	ENST00000533430	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		13.69	□□□□□ -0.22
BBS1-221	ENST00000533430	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
BBS1-221	ENST00000533430	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		13.68	□□□□□ -0.22
BBS1-221	ENST00000533430	OGFOD1	Q8N543	542 aa		13.68	□□□□□ -0.22
BBS1-221	ENST00000533430	GML	Q99445	158 aa		13.68	□□□□□ -0.22
BBS1-221	ENST00000533430	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		13.68	□□□□□ -0.22

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45 ms