RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532226.1

TRAF3IP2-AS1-209, TRAF3IP2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAF3IP2-AS1, Length 2,191 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 DDX19BQ9UMR2 479 aa10.18□□□□□ -0.78
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 JAG2Q9Y219 1238 aa10.18□□□□□ -0.78
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 LEMD3Q9Y2U8 911 aa10.18□□□□□ -0.78
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 EYA2O00167 538 aa10.18□□□□□ -0.78
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 LRRC37AA6NMS7 1700 aa10.17□□□□□ -0.78
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 GYG1P46976 350 aa10.17□□□□□ -0.78
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 PDE3AQ14432 1141 aa10.17□□□□□ -0.78
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 ATG9AQ7Z3C6 839 aa10.17□□□□□ -0.78
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 TIAM2Q8IVF5 1701 aa10.17□□□□□ -0.78
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 POTECB2RU33 542 aa10.16□□□□□ -0.78
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 PSMD14O00487 310 aa10.16□□□□□ -0.78
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 PDE8BO95263 885 aa10.16□□□□□ -0.78
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 CIAPIN1Q6FI81 312 aa10.16□□□□□ -0.78
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 MROH5Q6ZUA9 1318 aa10.16□□□□□ -0.78
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 GPC2Q8N158 579 aa10.16□□□□□ -0.78
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 MXD3Q9BW11 206 aa10.16□□□□□ -0.78
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 VPS33BQ9H267 617 aa10.16□□□□□ -0.78
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 SHTN1A0MZ66 631 aa10.16□□□□□ -0.78
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 APBB1O00213 710 aa10.16□□□□□ -0.78
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 KIF3CO14782 793 aa10.16□□□□□ -0.78
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 BRD2P25440 801 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 ATP8B2P98198 1209 aa10.16□□□□□ -0.78
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 CEP85Q6P2H3 762 aa10.16□□□□□ -0.78
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa10.16□□□□□ -0.78
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 SURF6O75683 361 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 POTEIP0CG38 1075 aa10.15□□□□□ -0.78
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 POTEJP0CG39 1038 aa10.15□□□□□ -0.78
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 EPS15P42566 896 aa10.15□□□□□ -0.78
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 MTX1Q13505 466 aa10.15□□□□□ -0.78
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 VPS37DQ86XT2 251 aa10.15□□□□□ -0.78
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 COPRSQ9NQ92 184 aa10.15□□□□□ -0.78
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 CEP126Q9P2H0 1117 aa10.15□□□□□ -0.78
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 MED23Q9ULK4 1368 aa10.15□□□□□ -0.78
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 BCAMP50895 628 aa10.15□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 SCNN1DP51172 638 aa10.15□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 TIMM10P62072 90 aa10.15□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 GTF2IP78347 998 aa10.15□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 TFCP2Q12800 502 aa10.15□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP10.15□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 VGLL2Q8N8G2 317 aa10.15□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 CD209Q9NNX6 404 aa10.15□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 LTBP1Q14766 1721 aa10.14□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 IL15P40933 162 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 PDE4CQ08493 712 aa10.14□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 UBE4AQ14139 1066 aa10.14□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 NBR1Q14596 966 aa10.14□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 TNIP1Q15025 636 aa10.14□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 TTLL5Q6EMB2 1281 aa10.14□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 PODNQ7Z5L7 613 aa10.14□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 NEUROD6Q96NK8 337 aa10.14□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 CRBNQ96SW2 442 aa10.14□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 COA1Q9GZY4 146 aa10.14□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa10.14□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 HACL1Q9UJ83 578 aa10.14□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 CLEC11AQ9Y240 323 aa10.14□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 USP17L3A6NCW0 530 aa10.13□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 USP17L4A6NCW7 530 aa10.13□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 F8W031 263 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 CIAO1O76071 339 aa10.13□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 EPHX2P34913 555 aa10.13□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 POLA2Q14181 598 aa10.13□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 CAVIN4Q5BKX8 364 aa10.13□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 USP17L1Q7RTZ2 530 aa10.13□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 ZNF804AQ7Z570 1209 aa10.13□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 SIRT2Q8IXJ6 389 aa10.13□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 SSH3Q8TE77 659 aa10.13□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 SCN9AQ15858 1988 aa10.13□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 IQCA1LA6NCM1 817 aa10.12□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 ATP2B3Q16720 1220 aa10.12□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 SAMD7Q7Z3H4 446 aa10.12□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 MICALL2Q8IY33 904 aa10.12□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 LPIN2Q92539 896 aa10.12□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 IRS2Q9Y4H2 1338 aa10.12□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 NPM3O75607 178 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 SASH1O94885 1247 aa10.12□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 EGFRP00533 1210 aa10.12□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 SLC5A1P13866 664 aa10.12□□□□□ -0.79
TRAF3IP2-AS1-209ENST00000532226 ADORA1P30542 326 aa10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.4 ms