RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530978.1

RBM25-208, Transcript of RNA binding motif protein 25, human

TSL 2

Gene RBM25, Length 441 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM25-208	ENST00000530978	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
RBM25-208	ENST00000530978	SCN9A	Q15858	1988 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RBM25-208	ENST00000530978	YDJC	A8MPS7	323 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RBM25-208	ENST00000530978		G3V3G9	751 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RBM25-208	ENST00000530978	ECE2	O60344	883 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RBM25-208	ENST00000530978	FGFR2	P21802	821 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RBM25-208	ENST00000530978	ADORA1	P30542	326 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RBM25-208	ENST00000530978	UBE4A	Q14139	1066 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RBM25-208	ENST00000530978	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RBM25-208	ENST00000530978	JDP2	Q8WYK2	163 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RBM25-208	ENST00000530978	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RBM25-208	ENST00000530978	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RBM25-208	ENST00000530978	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
RBM25-208	ENST00000530978	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
RBM25-208	ENST00000530978	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
RBM25-208	ENST00000530978	IGHD	P01880	384 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RBM25-208	ENST00000530978	NEFL	P07196	543 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RBM25-208	ENST00000530978	SLC5A1	P13866	664 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RBM25-208	ENST00000530978	TIMM10	P62072	90 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RBM25-208	ENST00000530978	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RBM25-208	ENST00000530978	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
RBM25-208	ENST00000530978	FBXW7	Q969H0	707 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RBM25-208	ENST00000530978	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RBM25-208	ENST00000530978	JAG2	Q9Y219	1238 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RBM25-208	ENST00000530978		A0A1B0GUL7	405 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RBM25-208	ENST00000530978	RAD17	O75943	681 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RBM25-208	ENST00000530978	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
RBM25-208	ENST00000530978	BCAM	P50895	628 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RBM25-208	ENST00000530978	TNNI3K	Q59H18	835 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RBM25-208	ENST00000530978	LPIN2	Q92539	896 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RBM25-208	ENST00000530978	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
RBM25-208	ENST00000530978	VPS33B	Q9H267	617 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RBM25-208	ENST00000530978	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
RBM25-208	ENST00000530978	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RBM25-208	ENST00000530978	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RBM25-208	ENST00000530978	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RBM25-208	ENST00000530978	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		11.21	□□□□□ -0.62
RBM25-208	ENST00000530978	PSME4	Q14997	1843 aa		11.21	□□□□□ -0.62
RBM25-208	ENST00000530978	FZD9	O00144	591 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM25-208	ENST00000530978	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
RBM25-208	ENST00000530978	YY1	P25490	414 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM25-208	ENST00000530978	PHKA1	P46020	1223 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM25-208	ENST00000530978	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
RBM25-208	ENST00000530978	CXCL9	Q07325	125 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM25-208	ENST00000530978	AAMP	Q13685	434 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM25-208	ENST00000530978	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM25-208	ENST00000530978	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
RBM25-208	ENST00000530978	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM25-208	ENST00000530978	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM25-208	ENST00000530978	XAGE2	Q96GT9	111 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM25-208	ENST00000530978	MXD3	Q9BW11	206 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM25-208	ENST00000530978	COA1	Q9GZY4	146 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM25-208	ENST00000530978	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
RBM25-208	ENST00000530978	DCTPP1	Q9H773	170 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM25-208	ENST00000530978	CD209	Q9NNX6	404 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM25-208	ENST00000530978	COL1A1	P02452	1464 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
RBM25-208	ENST00000530978	PSMD14	O00487	310 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM25-208	ENST00000530978	RAB11FIP3	O75154	756 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM25-208	ENST00000530978	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
RBM25-208	ENST00000530978	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
RBM25-208	ENST00000530978	AACS	Q86V21	672 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM25-208	ENST00000530978	VPS37D	Q86XT2	251 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM25-208	ENST00000530978	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
RBM25-208	ENST00000530978	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM25-208	ENST00000530978	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM25-208	ENST00000530978	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM25-208	ENST00000530978	GTF2I	P78347	998 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM25-208	ENST00000530978	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
RBM25-208	ENST00000530978	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM25-208	ENST00000530978	GORAB	Q5T7V8	394 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM25-208	ENST00000530978	CCDC102B	Q68D86	513 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM25-208	ENST00000530978	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM25-208	ENST00000530978	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM25-208	ENST00000530978	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM25-208	ENST00000530978	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM25-208	ENST00000530978	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
RBM25-208	ENST00000530978	GPR108	Q9NPR9	543 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM25-208	ENST00000530978	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
RBM25-208	ENST00000530978	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	11.18	□□□□□ -0.62
RBM25-208	ENST00000530978	ZC3H4	Q9UPT8	1303 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
RBM25-208	ENST00000530978	SHTN1	A0MZ66	631 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM25-208	ENST00000530978	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
RBM25-208	ENST00000530978	IL1R1	P14778	569 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM25-208	ENST00000530978	PODN	Q7Z5L7	613 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM25-208	ENST00000530978	CLASRP	Q8N2M8	674 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
RBM25-208	ENST00000530978	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
RBM25-208	ENST00000530978	UTRN	P46939	3433 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM25-208	ENST00000530978	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM25-208	ENST00000530978	WDR90	Q96KV7	1748 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM25-208	ENST00000530978	USP17L3	A6NCW0	530 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM25-208	ENST00000530978	USP17L4	A6NCW7	530 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM25-208	ENST00000530978	GLTPD2	A6NH11	291 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM25-208	ENST00000530978	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RBM25-208	ENST00000530978	SCARF1	Q14162	830 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM25-208	ENST00000530978	ANKRD45	Q5TZF3	282 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM25-208	ENST00000530978	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM25-208	ENST00000530978	PI16	Q6UXB8	463 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM25-208	ENST00000530978	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM25-208	ENST00000530978	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RBM25-208	ENST00000530978	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		11.16	□□□□□ -0.62

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.8 ms