RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528462.5

PACSIN3-205, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 2

Gene PACSIN3, Length 1,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-205ENST00000528462 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
PACSIN3-205ENST00000528462 SUPT20HQ8NEM7 779 aa27.01■■□□□ 1.91
PACSIN3-205ENST00000528462 NEUROD6Q96NK8 337 aa27.01■■□□□ 1.91
PACSIN3-205ENST00000528462 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
PACSIN3-205ENST00000528462 MED23Q9ULK4 1368 aa27■■□□□ 1.91
PACSIN3-205ENST00000528462 DBNDD2Q9BQY9 259 aa27■■□□□ 1.91
PACSIN3-205ENST00000528462 WWC3Q9ULE0 1092 aa27■■□□□ 1.91
PACSIN3-205ENST00000528462 ARAP2Q8WZ64 1704 aa26.99■■□□□ 1.91
PACSIN3-205ENST00000528462 C6orf229H3BNL8 230 aa26.99■■□□□ 1.91
PACSIN3-205ENST00000528462 ZBTB22O15209 634 aa26.99■■□□□ 1.91
PACSIN3-205ENST00000528462 PDE4AP27815 886 aa26.99■■□□□ 1.91
PACSIN3-205ENST00000528462 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
PACSIN3-205ENST00000528462 STAP2Q9UGK3 403 aa26.99■■□□□ 1.91
PACSIN3-205ENST00000528462 LTBP3Q9NS15 1303 aa26.98■■□□□ 1.91
PACSIN3-205ENST00000528462 EYA3Q99504 573 aa26.98■■□□□ 1.91
PACSIN3-205ENST00000528462 VPS33BQ9H267 617 aa26.98■■□□□ 1.91
PACSIN3-205ENST00000528462 MX1P20591 662 aa26.97■■□□□ 1.91
PACSIN3-205ENST00000528462 ADORA1P30542 326 aa26.97■■□□□ 1.91
PACSIN3-205ENST00000528462 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP26.97■■□□□ 1.918e-10■□□□□ 10.2
PACSIN3-205ENST00000528462 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
PACSIN3-205ENST00000528462 OSBPL3Q9H4L5 887 aa26.97■■□□□ 1.91
PACSIN3-205ENST00000528462 TTC41PQ6P2S7 1318 aa26.97■■□□□ 1.91
PACSIN3-205ENST00000528462 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa26.97■■□□□ 1.91
PACSIN3-205ENST00000528462 CAVIN4Q5BKX8 364 aa26.97■■□□□ 1.91
PACSIN3-205ENST00000528462 FBXO33Q7Z6M2 555 aa26.97■■□□□ 1.91
PACSIN3-205ENST00000528462 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa26.97■■□□□ 1.91
PACSIN3-205ENST00000528462 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
PACSIN3-205ENST00000528462 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
PACSIN3-205ENST00000528462 UTRNP46939 3433 aa26.96■■□□□ 1.91
PACSIN3-205ENST00000528462 KLRK1P26718 216 aa26.96■■□□□ 1.91
PACSIN3-205ENST00000528462 WASHC4Q2M389 1173 aa26.96■■□□□ 1.91
PACSIN3-205ENST00000528462 GPATCH3Q96I76 525 aa26.96■■□□□ 1.91
PACSIN3-205ENST00000528462 NFKBIEO00221 500 aa26.95■■□□□ 1.9
PACSIN3-205ENST00000528462 PDE1AP54750 535 aa26.95■■□□□ 1.9
PACSIN3-205ENST00000528462 CCDC102BQ68D86 513 aa26.95■■□□□ 1.9
PACSIN3-205ENST00000528462 TXNRD3Q86VQ6 643 aa26.95■■□□□ 1.9
PACSIN3-205ENST00000528462 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
PACSIN3-205ENST00000528462 BCL11AQ9H165 835 aa26.95■■□□□ 1.9
PACSIN3-205ENST00000528462 ECHDC1Q9NTX5 307 aa26.95■■□□□ 1.9
PACSIN3-205ENST00000528462 AOX1Q06278 1338 aa26.94■■□□□ 1.9
PACSIN3-205ENST00000528462 CCDC158Q5M9N0 1113 aa26.94■■□□□ 1.9
PACSIN3-205ENST00000528462 GORABQ5T7V8 394 aa26.94■■□□□ 1.9
PACSIN3-205ENST00000528462 TAOK3Q9H2K8 898 aa26.94■■□□□ 1.9
PACSIN3-205ENST00000528462 KIAA2012Q0VF49 1180 aa26.93■■□□□ 1.9
PACSIN3-205ENST00000528462 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP26.92■■□□□ 1.9
PACSIN3-205ENST00000528462 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
PACSIN3-205ENST00000528462 BCAMP50895 628 aa26.92■■□□□ 1.9
PACSIN3-205ENST00000528462 ATP5JP18859 108 aa26.92■■□□□ 1.9
PACSIN3-205ENST00000528462 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
PACSIN3-205ENST00000528462 PHKA1P46020 1223 aa26.92■■□□□ 1.9
PACSIN3-205ENST00000528462 GYG1P46976 350 aa26.92■■□□□ 1.9
PACSIN3-205ENST00000528462 ZNF804AQ7Z570 1209 aa26.92■■□□□ 1.9
PACSIN3-205ENST00000528462 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP26.92■■□□□ 1.9
PACSIN3-205ENST00000528462 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
PACSIN3-205ENST00000528462 ERC2O15083 957 aa26.91■■□□□ 1.9
PACSIN3-205ENST00000528462 VPS37DQ86XT2 251 aa26.91■■□□□ 1.9
PACSIN3-205ENST00000528462 COA1Q9GZY4 146 aa26.91■■□□□ 1.9
PACSIN3-205ENST00000528462 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
PACSIN3-205ENST00000528462 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa26.9■■□□□ 1.9
PACSIN3-205ENST00000528462 PI4K2BQ8TCG2 481 aa26.9■■□□□ 1.9
PACSIN3-205ENST00000528462 SEMA3EO15041 775 aa26.89■■□□□ 1.9
PACSIN3-205ENST00000528462 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
PACSIN3-205ENST00000528462 IL1R1P14778 569 aa26.88■■□□□ 1.89
PACSIN3-205ENST00000528462 TTC39AQ5SRH9 613 aa26.88■■□□□ 1.89
PACSIN3-205ENST00000528462 SKAP1Q86WV1 359 aa26.88■■□□□ 1.89
PACSIN3-205ENST00000528462 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
PACSIN3-205ENST00000528462 CD209Q9NNX6 404 aa26.88■■□□□ 1.89
PACSIN3-205ENST00000528462 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
PACSIN3-205ENST00000528462 RIMBP2O15034 1052 aa26.87■■□□□ 1.89
PACSIN3-205ENST00000528462 PPIP5K2O43314 1243 aa26.87■■□□□ 1.89
PACSIN3-205ENST00000528462 IARSP41252 1262 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
PACSIN3-205ENST00000528462 AOC3Q16853 763 aa26.87■■□□□ 1.89
PACSIN3-205ENST00000528462 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
PACSIN3-205ENST00000528462 GRIN3BO60391 1043 aa26.86■■□□□ 1.89
PACSIN3-205ENST00000528462 TSHZ3Q63HK5 1081 aa26.86■■□□□ 1.89
PACSIN3-205ENST00000528462 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa26.86■■□□□ 1.89
PACSIN3-205ENST00000528462 PODNQ7Z5L7 613 aa26.86■■□□□ 1.89
PACSIN3-205ENST00000528462 RGS3P49796 1198 aa26.85■■□□□ 1.89
PACSIN3-205ENST00000528462 RASGRF1Q13972 1273 aa26.85■■□□□ 1.89
PACSIN3-205ENST00000528462 GPR162Q16538 588 aa26.85■■□□□ 1.89
PACSIN3-205ENST00000528462 MCAMP43121 646 aa26.84■■□□□ 1.89
PACSIN3-205ENST00000528462 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
PACSIN3-205ENST00000528462 LARGE2Q8N3Y3 721 aa26.84■■□□□ 1.89
PACSIN3-205ENST00000528462 HAUS7Q99871 368 aa26.84■■□□□ 1.89
PACSIN3-205ENST00000528462 DENND2AQ9ULE3 1009 aa26.84■■□□□ 1.89
PACSIN3-205ENST00000528462 RASSF7Q02833 373 aa26.83■■□□□ 1.89
PACSIN3-205ENST00000528462 SCARF1Q14162 830 aa26.83■■□□□ 1.89
PACSIN3-205ENST00000528462 HMG20BQ9P0W2 317 aa26.83■■□□□ 1.89
PACSIN3-205ENST00000528462 LMNB1P20700 586 aa26.82■■□□□ 1.88
PACSIN3-205ENST00000528462 TTC22Q5TAA0 569 aa26.82■■□□□ 1.88
PACSIN3-205ENST00000528462 SPATA5Q8NB90 893 aa26.82■■□□□ 1.88
PACSIN3-205ENST00000528462 BOLA2Q9H3K6 86 aa26.82■■□□□ 1.88
PACSIN3-205ENST00000528462 AKAP11Q9UKA4 1901 aa26.81■■□□□ 1.88
PACSIN3-205ENST00000528462 G3V3G9 751 aa26.81■■□□□ 1.88
PACSIN3-205ENST00000528462 PRELPP51888 382 aa26.81■■□□□ 1.88
PACSIN3-205ENST00000528462 DOK7Q18PE1 504 aa26.81■■□□□ 1.88
PACSIN3-205ENST00000528462 DCAF8Q5TAQ9 597 aa26.81■■□□□ 1.88
PACSIN3-205ENST00000528462 FAM205AQ6ZU69 1335 aa26.8■■□□□ 1.88
PACSIN3-205ENST00000528462 ECE2O60344 883 aa26.8■■□□□ 1.88
PACSIN3-205ENST00000528462 DBNDD1Q9H9R9 158 aa26.8■■□□□ 1.88
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