RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525459.1

PTPRK-218, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRK, Length 1,722 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-218ENST00000525459 ATP2B3Q16720 1220 aa23.08■■□□□ 1.29
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PTPRK-218ENST00000525459 TTC39AQ5SRH9 613 aa22.91■■□□□ 1.26
PTPRK-218ENST00000525459 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
PTPRK-218ENST00000525459 ZNF541Q9H0D2 1346 aa22.91■■□□□ 1.26
PTPRK-218ENST00000525459 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
PTPRK-218ENST00000525459 NUCB1Q02818 461 aa22.91■■□□□ 1.26
PTPRK-218ENST00000525459 KDM2BQ8NHM5 1336 aa22.9■■□□□ 1.26
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