RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519070.5

FAM49B-211, Transcript of family with sequence similarity 49 member B, humanhuman

TSL 3

Gene FAM49B, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM49B-211ENST00000519070 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
FAM49B-211ENST00000519070 UBE4AQ14139 1066 aa20.14■□□□□ 0.81
FAM49B-211ENST00000519070 PODNQ7Z5L7 613 aa20.14■□□□□ 0.81
FAM49B-211ENST00000519070 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
FAM49B-211ENST00000519070 GMLQ99445 158 aa20.14■□□□□ 0.81
FAM49B-211ENST00000519070 COA1Q9GZY4 146 aa20.14■□□□□ 0.81
FAM49B-211ENST00000519070 C1orf115Q9H7X2 142 aa20.14■□□□□ 0.81
FAM49B-211ENST00000519070 GPRC5DQ9NZD1 345 aa20.14■□□□□ 0.81
FAM49B-211ENST00000519070 HACL1Q9UJ83 578 aa20.14■□□□□ 0.81
FAM49B-211ENST00000519070 FBXO3Q9UK99 471 aa20.14■□□□□ 0.81
FAM49B-211ENST00000519070 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
FAM49B-211ENST00000519070 CIAO1O76071 339 aa20.13■□□□□ 0.81
FAM49B-211ENST00000519070 PDE8BO95263 885 aa20.13■□□□□ 0.81
FAM49B-211ENST00000519070 POLA2Q14181 598 aa20.13■□□□□ 0.81
FAM49B-211ENST00000519070 MVPQ14764 893 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
FAM49B-211ENST00000519070 TNIP1Q15025 636 aa20.13■□□□□ 0.81
FAM49B-211ENST00000519070 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
FAM49B-211ENST00000519070 IQCA1LA6NCM1 817 aa20.12■□□□□ 0.81
FAM49B-211ENST00000519070 SRGAP3O43295 1099 aa20.12■□□□□ 0.81
FAM49B-211ENST00000519070 EPHX2P34913 555 aa20.12■□□□□ 0.81
FAM49B-211ENST00000519070 PDE3AQ14432 1141 aa20.12■□□□□ 0.81
FAM49B-211ENST00000519070 CD209Q9NNX6 404 aa20.12■□□□□ 0.81
FAM49B-211ENST00000519070 COG6Q9Y2V7 657 aa20.12■□□□□ 0.81
FAM49B-211ENST00000519070 IL1R1P14778 569 aa20.11■□□□□ 0.81
FAM49B-211ENST00000519070 ATP8B2P98198 1209 aa20.11■□□□□ 0.81
FAM49B-211ENST00000519070 DACT2Q5SW24 774 aa20.11■□□□□ 0.81
FAM49B-211ENST00000519070 SSH3Q8TE77 659 aa20.11■□□□□ 0.81
FAM49B-211ENST00000519070 DPF2Q92785 391 aa20.11■□□□□ 0.81
FAM49B-211ENST00000519070 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
FAM49B-211ENST00000519070 SIL1Q9H173 461 aa20.11■□□□□ 0.81
FAM49B-211ENST00000519070 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa20.11■□□□□ 0.81
FAM49B-211ENST00000519070 MS4A1P11836 297 aa20.1■□□□□ 0.81
FAM49B-211ENST00000519070 METTL24Q5JXM2 366 aa20.1■□□□□ 0.81
FAM49B-211ENST00000519070 KCNJ4P48050 445 aa20.09■□□□□ 0.81
FAM49B-211ENST00000519070 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
FAM49B-211ENST00000519070 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
FAM49B-211ENST00000519070 FBXO33Q7Z6M2 555 aa20.09■□□□□ 0.81
FAM49B-211ENST00000519070 MXD3Q9BW11 206 aa20.09■□□□□ 0.81
FAM49B-211ENST00000519070 USP17L3A6NCW0 530 aa20.08■□□□□ 0.81
FAM49B-211ENST00000519070 USP17L4A6NCW7 530 aa20.08■□□□□ 0.81
FAM49B-211ENST00000519070 EGFRP00533 1210 aa20.08■□□□□ 0.81
FAM49B-211ENST00000519070 GYG1P46976 350 aa20.08■□□□□ 0.81
FAM49B-211ENST00000519070 CEP85Q6P2H3 762 aa20.08■□□□□ 0.81
FAM49B-211ENST00000519070 USP17L1Q7RTZ2 530 aa20.08■□□□□ 0.81
FAM49B-211ENST00000519070 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
FAM49B-211ENST00000519070 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
FAM49B-211ENST00000519070 RPS12P25398 132 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
FAM49B-211ENST00000519070 IL15P40933 162 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
FAM49B-211ENST00000519070 FSTL1Q12841 308 aa20.07■□□□□ 0.8
FAM49B-211ENST00000519070 STRIP1Q5VSL9 837 aa20.07■□□□□ 0.8
FAM49B-211ENST00000519070 SIRT2Q8IXJ6 389 aa20.07■□□□□ 0.8
FAM49B-211ENST00000519070 TRPM4Q8TD43 1214 aa20.07■□□□□ 0.8
FAM49B-211ENST00000519070 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
FAM49B-211ENST00000519070 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
FAM49B-211ENST00000519070 LDHDQ86WU2 507 aa20.06■□□□□ 0.8
FAM49B-211ENST00000519070 MICALL2Q8IY33 904 aa20.06■□□□□ 0.8
FAM49B-211ENST00000519070 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
FAM49B-211ENST00000519070 CERS5Q8N5B7 392 aa20.06■□□□□ 0.8
FAM49B-211ENST00000519070 PGAP2Q9UHJ9 254 aa20.06■□□□□ 0.8
FAM49B-211ENST00000519070 DDX19BQ9UMR2 479 aa20.06■□□□□ 0.8
FAM49B-211ENST00000519070 CEP350Q5VT06 3117 aa20.06■□□□□ 0.8
FAM49B-211ENST00000519070 ARAP2Q8WZ64 1704 aa20.05■□□□□ 0.8
FAM49B-211ENST00000519070 G3V3G9 751 aa20.05■□□□□ 0.8
FAM49B-211ENST00000519070 SASH1O94885 1247 aa20.05■□□□□ 0.8
FAM49B-211ENST00000519070 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
FAM49B-211ENST00000519070 RRP1P56182 461 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
FAM49B-211ENST00000519070 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
FAM49B-211ENST00000519070 DCAF8Q5TAQ9 597 aa20.05■□□□□ 0.8
FAM49B-211ENST00000519070 CHADLQ6NUI6 762 aa20.05■□□□□ 0.8
FAM49B-211ENST00000519070 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
FAM49B-211ENST00000519070 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
FAM49B-211ENST00000519070 SMC1BQ8NDV3 1235 aa20.05■□□□□ 0.8
FAM49B-211ENST00000519070 AGBL3Q8NEM8 1001 aa20.05■□□□□ 0.8
FAM49B-211ENST00000519070 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
FAM49B-211ENST00000519070 FAM205AQ6ZU69 1335 aa20.04■□□□□ 0.8
FAM49B-211ENST00000519070 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
FAM49B-211ENST00000519070 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
FAM49B-211ENST00000519070 GTF2IP78347 998 aa20.04■□□□□ 0.8
FAM49B-211ENST00000519070 TTLL5Q6EMB2 1281 aa20.04■□□□□ 0.8
FAM49B-211ENST00000519070 ZNF804AQ7Z570 1209 aa20.04■□□□□ 0.8
FAM49B-211ENST00000519070 LPIN2Q92539 896 aa20.04■□□□□ 0.8
FAM49B-211ENST00000519070 BCAMP50895 628 aa20.03■□□□□ 0.8
FAM49B-211ENST00000519070 TFCP2Q12800 502 aa20.03■□□□□ 0.8
FAM49B-211ENST00000519070 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
FAM49B-211ENST00000519070 SAMD7Q7Z3H4 446 aa20.03■□□□□ 0.8
FAM49B-211ENST00000519070 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
FAM49B-211ENST00000519070 CEP126Q9P2H0 1117 aa20.03■□□□□ 0.8
FAM49B-211ENST00000519070 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
FAM49B-211ENST00000519070 PASKQ96RG2 1323 aa20.02■□□□□ 0.79
FAM49B-211ENST00000519070 ZBTB22O15209 634 aa20.01■□□□□ 0.79
FAM49B-211ENST00000519070 HSPA6P17066 643 aa20.01■□□□□ 0.79
FAM49B-211ENST00000519070 ADORA1P30542 326 aa20.01■□□□□ 0.79
FAM49B-211ENST00000519070 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
FAM49B-211ENST00000519070 ATP2B3Q16720 1220 aa20.01■□□□□ 0.79
FAM49B-211ENST00000519070 TIMM10P62072 90 aa20■□□□□ 0.79
FAM49B-211ENST00000519070 GRIK5Q16478 980 aa20■□□□□ 0.79
FAM49B-211ENST00000519070 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
FAM49B-211ENST00000519070 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
FAM49B-211ENST00000519070 JAG2Q9Y219 1238 aa20■□□□□ 0.79
FAM49B-211ENST00000519070 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.7 ms