RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515712.1

ACTBP2-201, Transcript of actin, beta pseudogene 2, humanhuman

BASIC

Gene ACTBP2, Length 1,123 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP2-201ENST00000515712 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa13.98□□□□□ -0.17
ACTBP2-201ENST00000515712 ARHGAP45Q92619 1136 aa13.98□□□□□ -0.17
ACTBP2-201ENST00000515712 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP13.98□□□□□ -0.17
ACTBP2-201ENST00000515712 HDAC9Q9UKV0 1011 aa13.98□□□□□ -0.17
ACTBP2-201ENST00000515712 TAF5LO75529 589 aa13.97□□□□□ -0.17
ACTBP2-201ENST00000515712 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP13.97□□□□□ -0.17
ACTBP2-201ENST00000515712 VPS37DQ86XT2 251 aa13.97□□□□□ -0.17
ACTBP2-201ENST00000515712 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP13.97□□□□□ -0.17
ACTBP2-201ENST00000515712 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP13.97□□□□□ -0.17
ACTBP2-201ENST00000515712 KCNQ5Q9NR82 932 aa13.97□□□□□ -0.17
ACTBP2-201ENST00000515712 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa13.96□□□□□ -0.17
ACTBP2-201ENST00000515712 ZBED9Q6R2W3 1325 aa13.96□□□□□ -0.17
ACTBP2-201ENST00000515712 GNAI3P08754 354 aa13.96□□□□□ -0.17
ACTBP2-201ENST00000515712 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP13.96□□□□□ -0.17
ACTBP2-201ENST00000515712 METTL24Q5JXM2 366 aa13.96□□□□□ -0.17
ACTBP2-201ENST00000515712 TTLL5Q6EMB2 1281 aa13.96□□□□□ -0.17
ACTBP2-201ENST00000515712 SAMD7Q7Z3H4 446 aa13.96□□□□□ -0.17
ACTBP2-201ENST00000515712 SULF1Q8IWU6 871 aa13.96□□□□□ -0.17
ACTBP2-201ENST00000515712 TRPM4Q8TD43 1214 aa13.96□□□□□ -0.17
ACTBP2-201ENST00000515712 USP44Q9H0E7 712 aa13.96□□□□□ -0.17
ACTBP2-201ENST00000515712 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP13.96□□□□□ -0.17
ACTBP2-201ENST00000515712 UBE4AQ14139 1066 aa13.95□□□□□ -0.18
ACTBP2-201ENST00000515712 CAVIN4Q5BKX8 364 aa13.95□□□□□ -0.18
ACTBP2-201ENST00000515712 KRT26Q7Z3Y9 468 aa13.95□□□□□ -0.18
ACTBP2-201ENST00000515712 ZNF408Q9H9D4 720 aa13.95□□□□□ -0.18
ACTBP2-201ENST00000515712 ZNF609O15014 1411 aa13.95□□□□□ -0.18
ACTBP2-201ENST00000515712 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP13.94□□□□□ -0.18
ACTBP2-201ENST00000515712 CELF2O95319 508 aaKnown RBP13.94□□□□□ -0.18
ACTBP2-201ENST00000515712 ECE1P42892 770 aa13.94□□□□□ -0.18
ACTBP2-201ENST00000515712 GTF2IP78347 998 aa13.94□□□□□ -0.18
ACTBP2-201ENST00000515712 DEFB115Q30KQ5 88 aa13.94□□□□□ -0.18
ACTBP2-201ENST00000515712 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP13.94□□□□□ -0.18
ACTBP2-201ENST00000515712 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP13.94□□□□□ -0.18
ACTBP2-201ENST00000515712 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP13.94□□□□□ -0.18
ACTBP2-201ENST00000515712 CD209Q9NNX6 404 aa13.94□□□□□ -0.18
ACTBP2-201ENST00000515712 MYOZ2Q9NPC6 264 aa13.94□□□□□ -0.18
ACTBP2-201ENST00000515712 PGAP2Q9UHJ9 254 aa13.94□□□□□ -0.18
ACTBP2-201ENST00000515712 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP13.93□□□□□ -0.18
ACTBP2-201ENST00000515712 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa13.93□□□□□ -0.18
ACTBP2-201ENST00000515712 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa13.93□□□□□ -0.18
ACTBP2-201ENST00000515712 JMYQ8N9B5 988 aa13.93□□□□□ -0.18
ACTBP2-201ENST00000515712 AIDAQ96BJ3 306 aa13.93□□□□□ -0.18
ACTBP2-201ENST00000515712 GGA3Q9NZ52 723 aa13.93□□□□□ -0.18
ACTBP2-201ENST00000515712 CNTNAP1P78357 1384 aa13.93□□□□□ -0.18
ACTBP2-201ENST00000515712 SHTN1A0MZ66 631 aa13.92□□□□□ -0.18
ACTBP2-201ENST00000515712 TRAF5O00463 557 aa13.92□□□□□ -0.18
ACTBP2-201ENST00000515712 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP13.92□□□□□ -0.18
ACTBP2-201ENST00000515712 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP13.92□□□□□ -0.18
ACTBP2-201ENST00000515712 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP13.92□□□□□ -0.18
ACTBP2-201ENST00000515712 DACT2Q5SW24 774 aa13.92□□□□□ -0.18
ACTBP2-201ENST00000515712 USP48Q86UV5 1035 aa13.92□□□□□ -0.18
ACTBP2-201ENST00000515712 TXNRD3Q86VQ6 643 aa13.92□□□□□ -0.18
ACTBP2-201ENST00000515712 ANKRD44Q8N8A2 993 aa13.92□□□□□ -0.18
ACTBP2-201ENST00000515712 KAZALD1Q96I82 304 aa13.92□□□□□ -0.18
ACTBP2-201ENST00000515712 FBXO3Q9UK99 471 aa13.92□□□□□ -0.18
ACTBP2-201ENST00000515712 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP13.91□□□□□ -0.18
ACTBP2-201ENST00000515712 RASSF10A6NK89 507 aa13.91□□□□□ -0.18
ACTBP2-201ENST00000515712 MYO1BO43795 1136 aa13.91□□□□□ -0.18
ACTBP2-201ENST00000515712 KLRK1P26718 216 aa13.91□□□□□ -0.18
ACTBP2-201ENST00000515712 SCARF1Q14162 830 aa13.91□□□□□ -0.18
ACTBP2-201ENST00000515712 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP13.91□□□□□ -0.18
ACTBP2-201ENST00000515712 KIAA0825Q8IV33 1275 aa13.91□□□□□ -0.18
ACTBP2-201ENST00000515712 C2orf69Q8N8R5 385 aa13.91□□□□□ -0.18
ACTBP2-201ENST00000515712 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP13.91□□□□□ -0.18
ACTBP2-201ENST00000515712 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa13.91□□□□□ -0.18
ACTBP2-201ENST00000515712 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP13.91□□□□□ -0.18
ACTBP2-201ENST00000515712 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa13.9□□□□□ -0.18
ACTBP2-201ENST00000515712 EYA2O00167 538 aa13.9□□□□□ -0.18
ACTBP2-201ENST00000515712 BCAR3O75815 825 aa13.9□□□□□ -0.18
ACTBP2-201ENST00000515712 PDE8BO95263 885 aa13.9□□□□□ -0.18
ACTBP2-201ENST00000515712 MS4A1P11836 297 aa13.9□□□□□ -0.18
ACTBP2-201ENST00000515712 SLC5A1P13866 664 aa13.9□□□□□ -0.18
ACTBP2-201ENST00000515712 IL1R1P14778 569 aa13.9□□□□□ -0.18
ACTBP2-201ENST00000515712 NF2P35240 595 aa13.9□□□□□ -0.18
ACTBP2-201ENST00000515712 GRM1Q13255 1194 aa13.9□□□□□ -0.18
ACTBP2-201ENST00000515712 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP13.9□□□□□ -0.18
ACTBP2-201ENST00000515712 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP13.9□□□□□ -0.18
ACTBP2-201ENST00000515712 GMLQ99445 158 aa13.9□□□□□ -0.18
ACTBP2-201ENST00000515712 BEGAINQ9BUH8 593 aa13.9□□□□□ -0.18
ACTBP2-201ENST00000515712 SCN9AQ15858 1988 aa13.9□□□□□ -0.18
ACTBP2-201ENST00000515712 PSME4Q14997 1843 aa13.9□□□□□ -0.18
ACTBP2-201ENST00000515712 SNAP23O00161 211 aa13.89□□□□□ -0.19
ACTBP2-201ENST00000515712 SASH1O94885 1247 aa13.89□□□□□ -0.19
ACTBP2-201ENST00000515712 GNAI2P04899 355 aa13.89□□□□□ -0.19
ACTBP2-201ENST00000515712 TRIM27P14373 513 aa13.89□□□□□ -0.19
ACTBP2-201ENST00000515712 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP13.89□□□□□ -0.19
ACTBP2-201ENST00000515712 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP13.89□□□□□ -0.19
ACTBP2-201ENST00000515712 DLGAP5Q15398 846 aa13.89□□□□□ -0.19
ACTBP2-201ENST00000515712 LRRC24Q50LG9 513 aa13.89□□□□□ -0.19
ACTBP2-201ENST00000515712 CLUAP1Q96AJ1 413 aa13.89□□□□□ -0.19
ACTBP2-201ENST00000515712 CEP126Q9P2H0 1117 aa13.89□□□□□ -0.19
ACTBP2-201ENST00000515712 TLL2Q9Y6L7 1015 aa13.89□□□□□ -0.19
ACTBP2-201ENST00000515712 IL15P40933 162 aaPredicted RBP13.88□□□□□ -0.19
ACTBP2-201ENST00000515712 GYG1P46976 350 aa13.88□□□□□ -0.19
ACTBP2-201ENST00000515712 VEGFBP49765 207 aa13.88□□□□□ -0.19
ACTBP2-201ENST00000515712 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP13.88□□□□□ -0.19
ACTBP2-201ENST00000515712 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP13.88□□□□□ -0.19
ACTBP2-201ENST00000515712 KLHDC4Q8TBB5 520 aa13.88□□□□□ -0.19
ACTBP2-201ENST00000515712 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa13.88□□□□□ -0.19
ACTBP2-201ENST00000515712 LPIN2Q92539 896 aa13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms