RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514625.1

FAAP20-215, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 3

Gene FAAP20, Length 703 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-215ENST00000514625 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
FAAP20-215ENST00000514625 COPRSQ9NQ92 184 aa22.28■■□□□ 1.16
FAAP20-215ENST00000514625 KCNQ5Q9NR82 932 aa22.28■■□□□ 1.16
FAAP20-215ENST00000514625 SCN4AP35499 1836 aa22.28■■□□□ 1.16
FAAP20-215ENST00000514625 CIAO1O76071 339 aa22.27■■□□□ 1.16
FAAP20-215ENST00000514625 PDE8BO95263 885 aa22.27■■□□□ 1.16
FAAP20-215ENST00000514625 KLRK1P26718 216 aa22.27■■□□□ 1.16
FAAP20-215ENST00000514625 PDE3AQ14432 1141 aa22.27■■□□□ 1.16
FAAP20-215ENST00000514625 MVPQ14764 893 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
FAAP20-215ENST00000514625 GPRC5DQ9NZD1 345 aa22.27■■□□□ 1.16
FAAP20-215ENST00000514625 DDX19BQ9UMR2 479 aa22.27■■□□□ 1.16
FAAP20-215ENST00000514625 USP17L3A6NCW0 530 aa22.26■■□□□ 1.15
FAAP20-215ENST00000514625 USP17L4A6NCW7 530 aa22.26■■□□□ 1.15
FAAP20-215ENST00000514625 RPS12P25398 132 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
FAAP20-215ENST00000514625 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
FAAP20-215ENST00000514625 USP17L1Q7RTZ2 530 aa22.26■■□□□ 1.15
FAAP20-215ENST00000514625 SMC1BQ8NDV3 1235 aa22.26■■□□□ 1.15
FAAP20-215ENST00000514625 COG6Q9Y2V7 657 aa22.26■■□□□ 1.15
FAAP20-215ENST00000514625 VIL1P09327 827 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
FAAP20-215ENST00000514625 IL15P40933 162 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
FAAP20-215ENST00000514625 EPS15P42566 896 aa22.25■■□□□ 1.15
FAAP20-215ENST00000514625 FSTL1Q12841 308 aa22.25■■□□□ 1.15
FAAP20-215ENST00000514625 DPF2Q92785 391 aa22.25■■□□□ 1.15
FAAP20-215ENST00000514625 FBXW7Q969H0 707 aa22.25■■□□□ 1.15
FAAP20-215ENST00000514625 C1orf115Q9H7X2 142 aa22.25■■□□□ 1.15
FAAP20-215ENST00000514625 CEP126Q9P2H0 1117 aa22.25■■□□□ 1.15
FAAP20-215ENST00000514625 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
FAAP20-215ENST00000514625 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
FAAP20-215ENST00000514625 H7C1D1 291 aa22.24■■□□□ 1.15
FAAP20-215ENST00000514625 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
FAAP20-215ENST00000514625 ATG9AQ7Z3C6 839 aa22.24■■□□□ 1.15
FAAP20-215ENST00000514625 VGLL2Q8N8G2 317 aa22.24■■□□□ 1.15
FAAP20-215ENST00000514625 CD209Q9NNX6 404 aa22.24■■□□□ 1.15
FAAP20-215ENST00000514625 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
FAAP20-215ENST00000514625 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
FAAP20-215ENST00000514625 CLEC11AQ9Y240 323 aa22.24■■□□□ 1.15
FAAP20-215ENST00000514625 IRS2Q9Y4H2 1338 aa22.24■■□□□ 1.15
FAAP20-215ENST00000514625 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
FAAP20-215ENST00000514625 ATP8B2P98198 1209 aa22.23■■□□□ 1.15
FAAP20-215ENST00000514625 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
FAAP20-215ENST00000514625 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
FAAP20-215ENST00000514625 LDHDQ86WU2 507 aa22.23■■□□□ 1.15
FAAP20-215ENST00000514625 VPS37DQ86XT2 251 aa22.23■■□□□ 1.15
FAAP20-215ENST00000514625 A0A1B0GUL6 1792 aa22.22■■□□□ 1.15
FAAP20-215ENST00000514625 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa22.22■■□□□ 1.15
FAAP20-215ENST00000514625 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
FAAP20-215ENST00000514625 CAVIN4Q5BKX8 364 aa22.22■■□□□ 1.15
FAAP20-215ENST00000514625 STRIP1Q5VSL9 837 aa22.22■■□□□ 1.15
FAAP20-215ENST00000514625 AGBL3Q8NEM8 1001 aa22.22■■□□□ 1.15
FAAP20-215ENST00000514625 SLC5A1P13866 664 aa22.21■■□□□ 1.15
FAAP20-215ENST00000514625 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP22.21■■□□□ 1.15
FAAP20-215ENST00000514625 TTLL5Q6EMB2 1281 aa22.21■■□□□ 1.15
FAAP20-215ENST00000514625 CHADLQ6NUI6 762 aa22.21■■□□□ 1.15
FAAP20-215ENST00000514625 MICALL2Q8IY33 904 aa22.21■■□□□ 1.15
FAAP20-215ENST00000514625 IL1R1P14778 569 aa22.2■■□□□ 1.14
FAAP20-215ENST00000514625 GYG1P46976 350 aa22.2■■□□□ 1.14
FAAP20-215ENST00000514625 GTF2IP78347 998 aa22.2■■□□□ 1.14
FAAP20-215ENST00000514625 C20orf194Q5TEA3 1177 aa22.2■■□□□ 1.14
FAAP20-215ENST00000514625 LPIN2Q92539 896 aa22.2■■□□□ 1.14
FAAP20-215ENST00000514625 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
FAAP20-215ENST00000514625 MYO3BQ8WXR4 1341 aa22.2■■□□□ 1.14
FAAP20-215ENST00000514625 POTEIP0CG38 1075 aa22.19■■□□□ 1.14
FAAP20-215ENST00000514625 POTEJP0CG39 1038 aa22.19■■□□□ 1.14
FAAP20-215ENST00000514625 POLA2Q14181 598 aa22.19■■□□□ 1.14
FAAP20-215ENST00000514625 DACT2Q5SW24 774 aa22.19■■□□□ 1.14
FAAP20-215ENST00000514625 SSH3Q8TE77 659 aa22.19■■□□□ 1.14
FAAP20-215ENST00000514625 SCN9AQ15858 1988 aa22.19■■□□□ 1.14
FAAP20-215ENST00000514625 FGFR2P21802 821 aa22.18■■□□□ 1.14
FAAP20-215ENST00000514625 ATP2B3Q16720 1220 aa22.18■■□□□ 1.14
FAAP20-215ENST00000514625 ZNF609O15014 1411 aa22.17■■□□□ 1.14
FAAP20-215ENST00000514625 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
FAAP20-215ENST00000514625 SASH1O94885 1247 aa22.17■■□□□ 1.14
FAAP20-215ENST00000514625 USP17L8P0C7I0 530 aa22.17■■□□□ 1.14
FAAP20-215ENST00000514625 RRP1P56182 461 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
FAAP20-215ENST00000514625 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
FAAP20-215ENST00000514625 CEP85Q6P2H3 762 aa22.17■■□□□ 1.14
FAAP20-215ENST00000514625 FBXO33Q7Z6M2 555 aa22.17■■□□□ 1.14
FAAP20-215ENST00000514625 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa22.17■■□□□ 1.14
FAAP20-215ENST00000514625 AKAP2Q9Y2D5 859 aa22.17■■□□□ 1.14
FAAP20-215ENST00000514625 SHTN1A0MZ66 631 aa22.16■■□□□ 1.14
FAAP20-215ENST00000514625 OGFOD1Q8N543 542 aa22.16■■□□□ 1.14
FAAP20-215ENST00000514625 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
FAAP20-215ENST00000514625 GMLQ99445 158 aa22.16■■□□□ 1.14
FAAP20-215ENST00000514625 SURF6O75683 361 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
FAAP20-215ENST00000514625 HSPA6P17066 643 aa22.15■■□□□ 1.14
FAAP20-215ENST00000514625 TFCP2Q12800 502 aa22.15■■□□□ 1.14
FAAP20-215ENST00000514625 SAMD7Q7Z3H4 446 aa22.15■■□□□ 1.14
FAAP20-215ENST00000514625 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
FAAP20-215ENST00000514625 MXD3Q9BW11 206 aa22.15■■□□□ 1.14
FAAP20-215ENST00000514625 MMP14P50281 582 aa22.14■■□□□ 1.13
FAAP20-215ENST00000514625 BCAMP50895 628 aa22.14■■□□□ 1.13
FAAP20-215ENST00000514625 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
FAAP20-215ENST00000514625 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
FAAP20-215ENST00000514625 PSME4Q14997 1843 aa22.14■■□□□ 1.13
FAAP20-215ENST00000514625 HMMRO75330 724 aa22.13■■□□□ 1.13
FAAP20-215ENST00000514625 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
FAAP20-215ENST00000514625 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
FAAP20-215ENST00000514625 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa22.13■■□□□ 1.13
FAAP20-215ENST00000514625 CNTROBQ8N137 903 aa22.13■■□□□ 1.13
FAAP20-215ENST00000514625 TRPM4Q8TD43 1214 aa22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.2 ms