RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514305.5

USP53-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 53, humanhuman

TSL 2

Gene USP53, Length 504 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53-208ENST00000514305 POLLQ9UGP5 575 aa25.18■■□□□ 1.62
USP53-208ENST00000514305 COG6Q9Y2V7 657 aa25.18■■□□□ 1.62
USP53-208ENST00000514305 H7C1D1 291 aa25.17■■□□□ 1.62
USP53-208ENST00000514305 SEC31BQ9NQW1 1179 aa25.17■■□□□ 1.62
USP53-208ENST00000514305 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
USP53-208ENST00000514305 TRAF5O00463 557 aa25.16■■□□□ 1.62
USP53-208ENST00000514305 GNAI2P04899 355 aa25.16■■□□□ 1.62
USP53-208ENST00000514305 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
USP53-208ENST00000514305 CASP7P55210 303 aa25.16■■□□□ 1.62
USP53-208ENST00000514305 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa25.16■■□□□ 1.62
USP53-208ENST00000514305 CTSWP56202 376 aa25.15■■□□□ 1.62
USP53-208ENST00000514305 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP25.15■■□□□ 1.62
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USP53-208ENST00000514305 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
USP53-208ENST00000514305 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
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USP53-208ENST00000514305 ECE2O60344 883 aa25.14■■□□□ 1.62
USP53-208ENST00000514305 DCAF8Q5TAQ9 597 aa25.14■■□□□ 1.62
USP53-208ENST00000514305 MICALL2Q8IY33 904 aa25.14■■□□□ 1.62
USP53-208ENST00000514305 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
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USP53-208ENST00000514305 DPF2Q92785 391 aa25.13■■□□□ 1.61
USP53-208ENST00000514305 SPEF2Q9C093 1822 aa25.12■■□□□ 1.61
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USP53-208ENST00000514305 C20orf194Q5TEA3 1177 aa25.12■■□□□ 1.61
USP53-208ENST00000514305 TRPM4Q8TD43 1214 aa25.12■■□□□ 1.61
USP53-208ENST00000514305 SUCLG2Q96I99 432 aa25.12■■□□□ 1.61
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USP53-208ENST00000514305 GGA1Q9UJY5 639 aa25.12■■□□□ 1.61
USP53-208ENST00000514305 RPS12P25398 132 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
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USP53-208ENST00000514305 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
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USP53-208ENST00000514305 CHMP3Q9Y3E7 222 aa25.11■■□□□ 1.61
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USP53-208ENST00000514305 MTX1Q13505 466 aa25.02■■□□□ 1.6
USP53-208ENST00000514305 USP48Q86UV5 1035 aa25.02■■□□□ 1.6
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