RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496314.1

TSC22D1-209, Transcript of TSC22 domain family member 1, human

TSL 2

Gene TSC22D1, Length 608 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TSC22D1-209	ENST00000496314	TFCP2	Q12800	502 aa		32.73	■■■□□ 2.83
TSC22D1-209	ENST00000496314	FBXW7	Q969H0	707 aa		32.73	■■■□□ 2.83
TSC22D1-209	ENST00000496314	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		32.73	■■■□□ 2.83
TSC22D1-209	ENST00000496314	GLTPD2	A6NH11	291 aa		32.72	■■■□□ 2.83
TSC22D1-209	ENST00000496314	YDJC	A8MPS7	323 aa		32.72	■■■□□ 2.83
TSC22D1-209	ENST00000496314	ATP2B3	Q16720	1220 aa		32.72	■■■□□ 2.83
TSC22D1-209	ENST00000496314	SIRT2	Q8IXJ6	389 aa		32.72	■■■□□ 2.83
TSC22D1-209	ENST00000496314	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		32.72	■■■□□ 2.83
TSC22D1-209	ENST00000496314	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		32.72	■■■□□ 2.83
TSC22D1-209	ENST00000496314	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	32.71	■■■□□ 2.83
TSC22D1-209	ENST00000496314	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	32.71	■■■□□ 2.83
TSC22D1-209	ENST00000496314	SLC5A1	P13866	664 aa		32.71	■■■□□ 2.83
TSC22D1-209	ENST00000496314	ZNF804A	Q7Z570	1209 aa		32.71	■■■□□ 2.83
TSC22D1-209	ENST00000496314	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	32.71	■■■□□ 2.83
TSC22D1-209	ENST00000496314	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	32.71	■■■□□ 2.83
TSC22D1-209	ENST00000496314	APBB1	O00213	710 aa		32.7	■■■□□ 2.83
TSC22D1-209	ENST00000496314	GYG1	P46976	350 aa		32.7	■■■□□ 2.83
TSC22D1-209	ENST00000496314	CXCL9	Q07325	125 aa		32.7	■■■□□ 2.83
TSC22D1-209	ENST00000496314	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		32.7	■■■□□ 2.83
TSC22D1-209	ENST00000496314	COA1	Q9GZY4	146 aa		32.7	■■■□□ 2.83
TSC22D1-209	ENST00000496314	VPS37D	Q86XT2	251 aa		32.69	■■■□□ 2.82
TSC22D1-209	ENST00000496314	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		32.69	■■■□□ 2.82
TSC22D1-209	ENST00000496314	LPIN2	Q92539	896 aa		32.68	■■■□□ 2.82
TSC22D1-209	ENST00000496314	BCL11A	Q9H165	835 aa		32.68	■■■□□ 2.82
TSC22D1-209	ENST00000496314	TNIP1	Q15025	636 aa		32.67	■■■□□ 2.82
TSC22D1-209	ENST00000496314	CAVIN4	Q5BKX8	364 aa		32.67	■■■□□ 2.82
TSC22D1-209	ENST00000496314	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	32.67	■■■□□ 2.82
TSC22D1-209	ENST00000496314	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		32.67	■■■□□ 2.82
TSC22D1-209	ENST00000496314	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		32.67	■■■□□ 2.82
TSC22D1-209	ENST00000496314	SASH1	O94885	1247 aa		32.66	■■■□□ 2.82
TSC22D1-209	ENST00000496314	FGFR2	P21802	821 aa		32.66	■■■□□ 2.82
TSC22D1-209	ENST00000496314	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	32.66	■■■□□ 2.82
TSC22D1-209	ENST00000496314	PODN	Q7Z5L7	613 aa		32.66	■■■□□ 2.82
TSC22D1-209	ENST00000496314	GPC2	Q8N158	579 aa		32.66	■■■□□ 2.82
TSC22D1-209	ENST00000496314	CD209	Q9NNX6	404 aa		32.66	■■■□□ 2.82
TSC22D1-209	ENST00000496314	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		32.66	■■■□□ 2.82
TSC22D1-209	ENST00000496314	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	32.66	■■■□□ 2.82
TSC22D1-209	ENST00000496314	PSMD14	O00487	310 aa		32.65	■■■□□ 2.82
TSC22D1-209	ENST00000496314	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		32.65	■■■□□ 2.82
TSC22D1-209	ENST00000496314	RRAGC	Q9HB90	399 aa		32.65	■■■□□ 2.82
TSC22D1-209	ENST00000496314	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		32.65	■■■□□ 2.82
TSC22D1-209	ENST00000496314	TNFRSF11A	Q9Y6Q6	616 aa	Predicted RBP	32.65	■■■□□ 2.82
TSC22D1-209	ENST00000496314	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		32.64	■■■□□ 2.82
TSC22D1-209	ENST00000496314	TIMM10	P62072	90 aa		32.63	■■■□□ 2.81
TSC22D1-209	ENST00000496314	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	32.63	■■■□□ 2.81
TSC22D1-209	ENST00000496314	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	32.63	■■■□□ 2.81
TSC22D1-209	ENST00000496314		A0A1B0GUL7	405 aa		32.62	■■■□□ 2.81
TSC22D1-209	ENST00000496314	FRAT2	O75474	233 aa	Predicted RBP	32.62	■■■□□ 2.81
TSC22D1-209	ENST00000496314	BCAM	P50895	628 aa		32.62	■■■□□ 2.81
TSC22D1-209	ENST00000496314	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		32.62	■■■□□ 2.81
TSC22D1-209	ENST00000496314	JAG2	Q9Y219	1238 aa		32.62	■■■□□ 2.81
TSC22D1-209	ENST00000496314	USP17L3	A6NCW0	530 aa		32.61	■■■□□ 2.81
TSC22D1-209	ENST00000496314	USP17L4	A6NCW7	530 aa		32.61	■■■□□ 2.81
TSC22D1-209	ENST00000496314	ADORA1	P30542	326 aa		32.61	■■■□□ 2.81
TSC22D1-209	ENST00000496314	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		32.61	■■■□□ 2.81
TSC22D1-209	ENST00000496314	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	32.61	■■■□□ 2.81
TSC22D1-209	ENST00000496314	SCN9A	Q15858	1988 aa		32.6	■■■□□ 2.81
TSC22D1-209	ENST00000496314	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	32.6	■■■□□ 2.81
TSC22D1-209	ENST00000496314	GTF2I	P78347	998 aa		32.6	■■■□□ 2.81
TSC22D1-209	ENST00000496314	ZNF609	O15014	1411 aa		32.6	■■■□□ 2.81
TSC22D1-209	ENST00000496314	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	32.59	■■■□□ 2.81
TSC22D1-209	ENST00000496314	GORAB	Q5T7V8	394 aa		32.59	■■■□□ 2.81
TSC22D1-209	ENST00000496314	FBXO33	Q7Z6M2	555 aa		32.58	■■■□□ 2.81
TSC22D1-209	ENST00000496314	IL1R1	P14778	569 aa		32.57	■■■□□ 2.8
TSC22D1-209	ENST00000496314	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	32.57	■■■□□ 2.8
TSC22D1-209	ENST00000496314	AAMP	Q13685	434 aa		32.57	■■■□□ 2.8
TSC22D1-209	ENST00000496314	TNNI3K	Q59H18	835 aa		32.57	■■■□□ 2.8
TSC22D1-209	ENST00000496314	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		32.57	■■■□□ 2.8
TSC22D1-209	ENST00000496314	XAGE2	Q96GT9	111 aa		32.57	■■■□□ 2.8
TSC22D1-209	ENST00000496314	MXD3	Q9BW11	206 aa		32.57	■■■□□ 2.8
TSC22D1-209	ENST00000496314	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		32.57	■■■□□ 2.8
TSC22D1-209	ENST00000496314	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		32.57	■■■□□ 2.8
TSC22D1-209	ENST00000496314	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		32.56	■■■□□ 2.8
TSC22D1-209	ENST00000496314	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	32.56	■■■□□ 2.8
TSC22D1-209	ENST00000496314	WDR90	Q96KV7	1748 aa		32.56	■■■□□ 2.8
TSC22D1-209	ENST00000496314	RAB11FIP3	O75154	756 aa		32.55	■■■□□ 2.8
TSC22D1-209	ENST00000496314	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	32.55	■■■□□ 2.8
TSC22D1-209	ENST00000496314	RSBN1L	Q6PCB5	846 aa	Predicted RBP	32.55	■■■□□ 2.8
TSC22D1-209	ENST00000496314	KIF1BP	Q96EK5	621 aa		32.55	■■■□□ 2.8
TSC22D1-209	ENST00000496314	HACL1	Q9UJ83	578 aa		32.55	■■■□□ 2.8
TSC22D1-209	ENST00000496314	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		32.54	■■■□□ 2.8
TSC22D1-209	ENST00000496314	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	32.54	■■■□□ 2.8
TSC22D1-209	ENST00000496314	PHKA1	P46020	1223 aa		32.54	■■■□□ 2.8
TSC22D1-209	ENST00000496314	SCNN1D	P51172	638 aa		32.54	■■■□□ 2.8
TSC22D1-209	ENST00000496314	STRIP1	Q5VSL9	837 aa		32.54	■■■□□ 2.8
TSC22D1-209	ENST00000496314	TDRD7	Q8NHU6	1098 aa	Known RBP	32.54	■■■□□ 2.8
TSC22D1-209	ENST00000496314	GNL3L	Q9NVN8	582 aa	Known RBP	32.54	■■■□□ 2.8
TSC22D1-209	ENST00000496314	ARAP2	Q8WZ64	1704 aa		32.54	■■■□□ 2.8
TSC22D1-209	ENST00000496314	C16orf71	Q8IYS4	520 aa	Predicted RBP	32.53	■■■□□ 2.8
TSC22D1-209	ENST00000496314	CCDC8	Q9H0W5	538 aa	Predicted RBP	32.53	■■■□□ 2.8
TSC22D1-209	ENST00000496314	GPR108	Q9NPR9	543 aa		32.53	■■■□□ 2.8
TSC22D1-209	ENST00000496314	DACT2	Q5SW24	774 aa		32.52	■■■□□ 2.8
TSC22D1-209	ENST00000496314	CCDC102B	Q68D86	513 aa		32.52	■■■□□ 2.8
TSC22D1-209	ENST00000496314	AACS	Q86V21	672 aa		32.52	■■■□□ 2.8
TSC22D1-209	ENST00000496314	POTEC	B2RU33	542 aa		32.51	■■■□□ 2.79
TSC22D1-209	ENST00000496314	EPS15	P42566	896 aa		32.51	■■■□□ 2.79
TSC22D1-209	ENST00000496314	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		32.51	■■■□□ 2.79
TSC22D1-209	ENST00000496314	PSME4	Q14997	1843 aa		32.5	■■■□□ 2.79
TSC22D1-209	ENST00000496314	SHTN1	A0MZ66	631 aa		32.5	■■■□□ 2.79
TSC22D1-209	ENST00000496314	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	32.5	■■■□□ 2.79

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