RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495360.5

APTX-232, Transcript of aprataxin, humanhuman

TSL 5

Gene APTX, Length 1,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTX-232ENST00000495360 PTPRCP08575 1304 aa21.88■■□□□ 1.09
APTX-232ENST00000495360 KLRK1P26718 216 aa21.87■■□□□ 1.09
APTX-232ENST00000495360 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
APTX-232ENST00000495360 CCDC57Q2TAC2 916 aa21.87■■□□□ 1.09
APTX-232ENST00000495360 TAF7LQ5H9L4 462 aa21.87■■□□□ 1.09
APTX-232ENST00000495360 KRT26Q7Z3Y9 468 aa21.87■■□□□ 1.09
APTX-232ENST00000495360 SSH1Q8WYL5 1049 aa21.87■■□□□ 1.09
APTX-232ENST00000495360 FBXW7Q969H0 707 aa21.87■■□□□ 1.09
APTX-232ENST00000495360 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
APTX-232ENST00000495360 GMLQ99445 158 aa21.87■■□□□ 1.09
APTX-232ENST00000495360 USP17L8P0C7I0 530 aa21.86■■□□□ 1.09
APTX-232ENST00000495360 ECE1P42892 770 aa21.86■■□□□ 1.09
APTX-232ENST00000495360 GRM1Q13255 1194 aa21.86■■□□□ 1.09
APTX-232ENST00000495360 CAPNS2Q96L46 248 aa21.86■■□□□ 1.09
APTX-232ENST00000495360 CYP4F22Q6NT55 531 aa21.85■■□□□ 1.09
APTX-232ENST00000495360 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
APTX-232ENST00000495360 AIDAQ96BJ3 306 aa21.85■■□□□ 1.09
APTX-232ENST00000495360 SUCLG2Q96I99 432 aa21.85■■□□□ 1.09
APTX-232ENST00000495360 GGA3Q9NZ52 723 aa21.85■■□□□ 1.09
APTX-232ENST00000495360 ADM5C9JUS6 153 aa21.84■■□□□ 1.09
APTX-232ENST00000495360 FOXN1O15353 648 aa21.84■■□□□ 1.09
APTX-232ENST00000495360 TAF5LO75529 589 aa21.84■■□□□ 1.09
APTX-232ENST00000495360 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
APTX-232ENST00000495360 DACT2Q5SW24 774 aa21.84■■□□□ 1.09
APTX-232ENST00000495360 DLK2Q6UY11 383 aa21.84■■□□□ 1.09
APTX-232ENST00000495360 SAPCD2Q86UD0 394 aa21.84■■□□□ 1.09
APTX-232ENST00000495360 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
APTX-232ENST00000495360 MYOZ2Q9NPC6 264 aa21.84■■□□□ 1.09
APTX-232ENST00000495360 THSD7BQ9C0I4 1608 aa21.84■■□□□ 1.09
APTX-232ENST00000495360 A0A1B0GUL6 1792 aa21.84■■□□□ 1.09
APTX-232ENST00000495360 UTYO14607 1347 aa21.83■■□□□ 1.09
APTX-232ENST00000495360 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
APTX-232ENST00000495360 MYO3BQ8WXR4 1341 aa21.83■■□□□ 1.09
APTX-232ENST00000495360 STRIP1Q5VSL9 837 aa21.83■■□□□ 1.09
APTX-232ENST00000495360 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa21.83■■□□□ 1.09
APTX-232ENST00000495360 MXD3Q9BW11 206 aa21.83■■□□□ 1.09
APTX-232ENST00000495360 SNAP23O00161 211 aa21.82■■□□□ 1.08
APTX-232ENST00000495360 SCARF1Q14162 830 aa21.82■■□□□ 1.08
APTX-232ENST00000495360 ALDH1L2Q3SY69 923 aa21.82■■□□□ 1.08
APTX-232ENST00000495360 SULF1Q8IWU6 871 aa21.82■■□□□ 1.08
APTX-232ENST00000495360 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
APTX-232ENST00000495360 CNNM1Q9NRU3 951 aa21.82■■□□□ 1.08
APTX-232ENST00000495360 SMC4Q9NTJ3 1288 aa21.82■■□□□ 1.08
APTX-232ENST00000495360 WBP1LQ9NX94 342 aa21.82■■□□□ 1.08
APTX-232ENST00000495360 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
APTX-232ENST00000495360 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
APTX-232ENST00000495360 KAZALD1Q96I82 304 aa21.81■■□□□ 1.08
APTX-232ENST00000495360 HHIPL1Q96JK4 782 aa21.81■■□□□ 1.08
APTX-232ENST00000495360 IRS2Q9Y4H2 1338 aa21.81■■□□□ 1.08
APTX-232ENST00000495360 PLIN1O60240 522 aa21.8■■□□□ 1.08
APTX-232ENST00000495360 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
APTX-232ENST00000495360 TTLL5Q6EMB2 1281 aa21.8■■□□□ 1.08
APTX-232ENST00000495360 OGFOD1Q8N543 542 aa21.8■■□□□ 1.08
APTX-232ENST00000495360 CD209Q9NNX6 404 aa21.8■■□□□ 1.08
APTX-232ENST00000495360 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
APTX-232ENST00000495360 GTF2IP78347 998 aa21.8■■□□□ 1.08
APTX-232ENST00000495360 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
APTX-232ENST00000495360 TNS4Q8IZW8 715 aa21.8■■□□□ 1.08
APTX-232ENST00000495360 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
APTX-232ENST00000495360 ZNF804AQ7Z570 1209 aa21.79■■□□□ 1.08
APTX-232ENST00000495360 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
APTX-232ENST00000495360 AOC2O75106 756 aa21.78■■□□□ 1.08
APTX-232ENST00000495360 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
APTX-232ENST00000495360 HUNKP57058 714 aa21.78■■□□□ 1.08
APTX-232ENST00000495360 CDCA5Q96FF9 252 aa21.78■■□□□ 1.08
APTX-232ENST00000495360 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa21.77■■□□□ 1.08
APTX-232ENST00000495360 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.07
APTX-232ENST00000495360 KIAA0825Q8IV33 1275 aa21.77■■□□□ 1.07
APTX-232ENST00000495360 ANKRD44Q8N8A2 993 aa21.77■■□□□ 1.07
APTX-232ENST00000495360 C2orf69Q8N8R5 385 aa21.77■■□□□ 1.07
APTX-232ENST00000495360 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.07
APTX-232ENST00000495360 MAP2K2P36507 400 aa21.76■■□□□ 1.07
APTX-232ENST00000495360 NBPF9Q3BBW0 867 aa21.76■■□□□ 1.07
APTX-232ENST00000495360 BEGAINQ9BUH8 593 aa21.76■■□□□ 1.07
APTX-232ENST00000495360 USP44Q9H0E7 712 aa21.76■■□□□ 1.07
APTX-232ENST00000495360 HDAC9Q9UKV0 1011 aa21.76■■□□□ 1.07
APTX-232ENST00000495360 IL1R1P14778 569 aa21.75■■□□□ 1.07
APTX-232ENST00000495360 MMP14P50281 582 aa21.75■■□□□ 1.07
APTX-232ENST00000495360 SASH1O94885 1247 aa21.74■■□□□ 1.07
APTX-232ENST00000495360 LBX1P52954 281 aa21.74■■□□□ 1.07
APTX-232ENST00000495360 PRDM10Q9NQV6 1147 aa21.74■■□□□ 1.07
APTX-232ENST00000495360 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
APTX-232ENST00000495360 MROH5Q6ZUA9 1318 aa21.73■■□□□ 1.07
APTX-232ENST00000495360 WNT10BO00744 389 aa21.73■■□□□ 1.07
APTX-232ENST00000495360 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
APTX-232ENST00000495360 UBE4AQ14139 1066 aa21.73■■□□□ 1.07
APTX-232ENST00000495360 RGMBQ6NW40 437 aa21.73■■□□□ 1.07
APTX-232ENST00000495360 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP21.73■■□□□ 1.07
APTX-232ENST00000495360 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa21.73■■□□□ 1.07
APTX-232ENST00000495360 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
APTX-232ENST00000495360 CERS5Q8N5B7 392 aa21.72■■□□□ 1.07
APTX-232ENST00000495360 NOGQ13253 232 aa21.71■■□□□ 1.07
APTX-232ENST00000495360 LRRC24Q50LG9 513 aa21.71■■□□□ 1.07
APTX-232ENST00000495360 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP21.71■■□□□ 1.07
APTX-232ENST00000495360 JAG2Q9Y219 1238 aa21.71■■□□□ 1.07
APTX-232ENST00000495360 GYG1P46976 350 aa21.7■■□□□ 1.06
APTX-232ENST00000495360 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
APTX-232ENST00000495360 METTL24Q5JXM2 366 aa21.7■■□□□ 1.06
APTX-232ENST00000495360 F8W031 263 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
APTX-232ENST00000495360 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.7 ms