RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495293.5

RBM39-240, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 2

Gene RBM39, Length 759 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-240ENST00000495293 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
RBM39-240ENST00000495293 BRD2P25440 801 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
RBM39-240ENST00000495293 NLRP13Q86W25 1043 aa7.41□□□□□ -1.22
RBM39-240ENST00000495293 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP7.41□□□□□ -1.22
RBM39-240ENST00000495293 COL26A1Q96A83 441 aa7.41□□□□□ -1.22
RBM39-240ENST00000495293 F8W735 103 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
RBM39-240ENST00000495293 ATG7O95352 703 aa7.4□□□□□ -1.22
RBM39-240ENST00000495293 WISP1O95388 367 aa7.4□□□□□ -1.22
RBM39-240ENST00000495293 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
RBM39-240ENST00000495293 SCNN1AP37088 669 aa7.4□□□□□ -1.22
RBM39-240ENST00000495293 LRP8Q14114 963 aa7.4□□□□□ -1.22
RBM39-240ENST00000495293 TXNDC11Q6PKC3 985 aa7.4□□□□□ -1.22
RBM39-240ENST00000495293 OR13H1Q8NG92 308 aa7.4□□□□□ -1.22
RBM39-240ENST00000495293 C1orf115Q9H7X2 142 aa7.4□□□□□ -1.22
RBM39-240ENST00000495293 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa7.4□□□□□ -1.22
RBM39-240ENST00000495293 FHAD1B1AJZ9 1412 aa7.4□□□□□ -1.22
RBM39-240ENST00000495293 UBAP1LF5GYI3 381 aa7.39□□□□□ -1.23
RBM39-240ENST00000495293 GHRHP01286 108 aa7.39□□□□□ -1.23
RBM39-240ENST00000495293 ZAP70P43403 619 aa7.39□□□□□ -1.23
RBM39-240ENST00000495293 PRR23CQ6ZRP0 262 aa7.39□□□□□ -1.23
RBM39-240ENST00000495293 C14orf37Q86TY3 774 aa7.39□□□□□ -1.23
RBM39-240ENST00000495293 AKTIPQ9H8T0 292 aa7.39□□□□□ -1.23
RBM39-240ENST00000495293 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP7.39□□□□□ -1.23
RBM39-240ENST00000495293 SEPT3Q9UH03 358 aa7.39□□□□□ -1.23
RBM39-240ENST00000495293 Q6ZS46 218 aa7.38□□□□□ -1.23
RBM39-240ENST00000495293 GPR152Q8TDT2 470 aa7.38□□□□□ -1.23
RBM39-240ENST00000495293 KCNK4Q9NYG8 393 aa7.38□□□□□ -1.23
RBM39-240ENST00000495293 ADAMTS12P58397 1594 aa7.37□□□□□ -1.23
RBM39-240ENST00000495293 GRIN2AQ12879 1464 aa7.37□□□□□ -1.23
RBM39-240ENST00000495293 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
RBM39-240ENST00000495293 ATCAYQ86WG3 371 aa7.37□□□□□ -1.23
RBM39-240ENST00000495293 TMEM130Q8N3G9 435 aa7.37□□□□□ -1.23
RBM39-240ENST00000495293 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
RBM39-240ENST00000495293 RASSF4Q9H2L5 321 aa7.37□□□□□ -1.23
RBM39-240ENST00000495293 LINC01387J3KSC0 135 aa7.36□□□□□ -1.23
RBM39-240ENST00000495293 KIF4AO95239 1232 aa7.36□□□□□ -1.23
RBM39-240ENST00000495293 ACPPP15309 386 aa7.36□□□□□ -1.23
RBM39-240ENST00000495293 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
RBM39-240ENST00000495293 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
RBM39-240ENST00000495293 LACRTQ9GZZ8 138 aa7.36□□□□□ -1.23
RBM39-240ENST00000495293 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
RBM39-240ENST00000495293 TMEM63CQ9P1W3 806 aa7.36□□□□□ -1.23
RBM39-240ENST00000495293 CUL7Q14999 1698 aa7.35□□□□□ -1.23
RBM39-240ENST00000495293 NBPF11Q86T75 865 aa7.35□□□□□ -1.23
RBM39-240ENST00000495293 STIM2Q9P246 746 aa7.35□□□□□ -1.23
RBM39-240ENST00000495293 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa7.34□□□□□ -1.23
RBM39-240ENST00000495293 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa7.34□□□□□ -1.23
RBM39-240ENST00000495293 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa7.34□□□□□ -1.23
RBM39-240ENST00000495293 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa7.34□□□□□ -1.23
RBM39-240ENST00000495293 ARHGEF11O15085 1522 aa7.34□□□□□ -1.23
RBM39-240ENST00000495293 EPHA1P21709 976 aa7.34□□□□□ -1.23
RBM39-240ENST00000495293 CDC25BP30305 580 aa7.34□□□□□ -1.23
RBM39-240ENST00000495293 CYB5RLQ6IPT4 315 aa7.34□□□□□ -1.23
RBM39-240ENST00000495293 CCDC82Q8N4S0 544 aa7.34□□□□□ -1.23
RBM39-240ENST00000495293 PIK3R5Q8WYR1 880 aa7.34□□□□□ -1.23
RBM39-240ENST00000495293 CARD10Q9BWT7 1032 aa7.34□□□□□ -1.23
RBM39-240ENST00000495293 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
RBM39-240ENST00000495293 CNTN3Q9P232 1028 aa7.34□□□□□ -1.23
RBM39-240ENST00000495293 RNF112Q9ULX5 631 aa7.34□□□□□ -1.23
RBM39-240ENST00000495293 PPME1Q9Y570 386 aa7.34□□□□□ -1.23
RBM39-240ENST00000495293 CLASP1Q7Z460 1538 aa7.33□□□□□ -1.24
RBM39-240ENST00000495293 A6NHS1 94 aa7.33□□□□□ -1.24
RBM39-240ENST00000495293 ADAM11O75078 769 aa7.33□□□□□ -1.24
RBM39-240ENST00000495293 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
RBM39-240ENST00000495293 FSTP19883 344 aa7.33□□□□□ -1.24
RBM39-240ENST00000495293 CEP135Q66GS9 1140 aa7.33□□□□□ -1.24
RBM39-240ENST00000495293 CEP120Q8N960 986 aa7.33□□□□□ -1.24
RBM39-240ENST00000495293 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
RBM39-240ENST00000495293 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
RBM39-240ENST00000495293 KANSL3Q9P2N6 904 aa7.33□□□□□ -1.24
RBM39-240ENST00000495293 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
RBM39-240ENST00000495293 HYAL2Q12891 473 aa7.32□□□□□ -1.24
RBM39-240ENST00000495293 ARMC10Q8N2F6 343 aa7.32□□□□□ -1.24
RBM39-240ENST00000495293 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
RBM39-240ENST00000495293 PBXIP1Q96AQ6 731 aa7.32□□□□□ -1.24
RBM39-240ENST00000495293 RBSNQ9H1K0 784 aa7.32□□□□□ -1.24
RBM39-240ENST00000495293 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
RBM39-240ENST00000495293 NUP160Q12769 1436 aa7.32□□□□□ -1.24
RBM39-240ENST00000495293 ATP2B4P23634 1241 aa7.31□□□□□ -1.24
RBM39-240ENST00000495293 CEP170Q5SW79 1584 aa7.31□□□□□ -1.24
RBM39-240ENST00000495293 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa7.31□□□□□ -1.24
RBM39-240ENST00000495293 HHIPQ96QV1 700 aa7.31□□□□□ -1.24
RBM39-240ENST00000495293 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
RBM39-240ENST00000495293 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
RBM39-240ENST00000495293 NFKBIEO00221 500 aa7.3□□□□□ -1.24
RBM39-240ENST00000495293 TRPA1O75762 1119 aa7.3□□□□□ -1.24
RBM39-240ENST00000495293 MED26O95402 600 aa7.3□□□□□ -1.24
RBM39-240ENST00000495293 GLB1P16278 677 aa7.3□□□□□ -1.24
RBM39-240ENST00000495293 MAP4K3Q8IVH8 894 aa7.3□□□□□ -1.24
RBM39-240ENST00000495293 UBASH3BQ8TF42 649 aa7.3□□□□□ -1.24
RBM39-240ENST00000495293 PBX4Q9BYU1 374 aa7.3□□□□□ -1.24
RBM39-240ENST00000495293 GGNBP2Q9H3C7 697 aa7.3□□□□□ -1.24
RBM39-240ENST00000495293 ELP3Q9H9T3 547 aa7.3□□□□□ -1.24
RBM39-240ENST00000495293 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa7.3□□□□□ -1.24
RBM39-240ENST00000495293 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa7.29□□□□□ -1.24
RBM39-240ENST00000495293 CDC27P30260 824 aa7.29□□□□□ -1.24
RBM39-240ENST00000495293 CD68P34810 354 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
RBM39-240ENST00000495293 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
RBM39-240ENST00000495293 HGSNATQ68CP4 663 aa7.29□□□□□ -1.24
RBM39-240ENST00000495293 ACAD11Q709F0 780 aa7.29□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.9 ms