RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492954.1

PTPRU-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRU, Length 625 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-207ENST00000492954 SNAP23O00161 211 aa22.77■■□□□ 1.24
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PTPRU-207ENST00000492954 ALDH1L2Q3SY69 923 aa22.77■■□□□ 1.24
PTPRU-207ENST00000492954 TAF7LQ5H9L4 462 aa22.77■■□□□ 1.24
PTPRU-207ENST00000492954 USP48Q86UV5 1035 aa22.77■■□□□ 1.24
PTPRU-207ENST00000492954 KAZALD1Q96I82 304 aa22.77■■□□□ 1.24
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PTPRU-207ENST00000492954 SMC4Q9NTJ3 1288 aa22.77■■□□□ 1.24
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PTPRU-207ENST00000492954 TLL2Q9Y6L7 1015 aa22.75■■□□□ 1.23
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PTPRU-207ENST00000492954 DACT2Q5SW24 774 aa22.74■■□□□ 1.23
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PTPRU-207ENST00000492954 WBP1LQ9NX94 342 aa22.66■■□□□ 1.22
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PTPRU-207ENST00000492954 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP22.6■■□□□ 1.21
PTPRU-207ENST00000492954 MMP14P50281 582 aa22.6■■□□□ 1.21
PTPRU-207ENST00000492954 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP22.6■■□□□ 1.21
PTPRU-207ENST00000492954 KIF16BQ96L93 1317 aa22.59■■□□□ 1.21
PTPRU-207ENST00000492954 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
PTPRU-207ENST00000492954 VGLL2Q8N8G2 317 aa22.59■■□□□ 1.21
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