RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490316.6

MTMR1-211, Transcript of myotubularin related protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene MTMR1, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR1-211ENST00000490316 ZNF408Q9H9D4 720 aa36.92■■■■□ 3.5
MTMR1-211ENST00000490316 EPHA10Q5JZY3 1008 aa36.91■■■■□ 3.5
MTMR1-211ENST00000490316 SAPCD2Q86UD0 394 aa36.91■■■■□ 3.5
MTMR1-211ENST00000490316 CAPNS2Q96L46 248 aa36.91■■■■□ 3.5
MTMR1-211ENST00000490316 KRT26Q7Z3Y9 468 aa36.9■■■■□ 3.5
MTMR1-211ENST00000490316 AIDAQ96BJ3 306 aa36.9■■■■□ 3.5
MTMR1-211ENST00000490316 WBP1LQ9NX94 342 aa36.9■■■■□ 3.5
MTMR1-211ENST00000490316 CCER2I3L3R5 266 aa36.89■■■■□ 3.5
MTMR1-211ENST00000490316 FOXN1O15353 648 aa36.89■■■■□ 3.5
MTMR1-211ENST00000490316 USP17L8P0C7I0 530 aa36.89■■■■□ 3.5
MTMR1-211ENST00000490316 CYP4F22Q6NT55 531 aa36.89■■■■□ 3.5
MTMR1-211ENST00000490316 KCNJ4P48050 445 aa36.88■■■■□ 3.49
MTMR1-211ENST00000490316 CCDC57Q2TAC2 916 aa36.88■■■■□ 3.49
MTMR1-211ENST00000490316 DLK2Q6UY11 383 aa36.87■■■■□ 3.49
MTMR1-211ENST00000490316 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP36.87■■■■□ 3.49
MTMR1-211ENST00000490316 KLRK1P26718 216 aa36.86■■■■□ 3.49
MTMR1-211ENST00000490316 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP36.86■■■■□ 3.49
MTMR1-211ENST00000490316 GRM1Q13255 1194 aa36.86■■■■□ 3.49
MTMR1-211ENST00000490316 DACT2Q5SW24 774 aa36.86■■■■□ 3.49
MTMR1-211ENST00000490316 HHIPL1Q96JK4 782 aa36.86■■■■□ 3.49
MTMR1-211ENST00000490316 PTPRCP08575 1304 aa36.85■■■■□ 3.49
MTMR1-211ENST00000490316 STRIP1Q5VSL9 837 aa36.85■■■■□ 3.49
MTMR1-211ENST00000490316 SSH1Q8WYL5 1049 aa36.85■■■■□ 3.49
MTMR1-211ENST00000490316 CDCA7LQ96GN5 454 aa36.85■■■■□ 3.49
MTMR1-211ENST00000490316 MYOZ2Q9NPC6 264 aa36.85■■■■□ 3.49
MTMR1-211ENST00000490316 GGA3Q9NZ52 723 aa36.85■■■■□ 3.49
MTMR1-211ENST00000490316 ADM5C9JUS6 153 aa36.84■■■■□ 3.49
MTMR1-211ENST00000490316 FBXW7Q969H0 707 aa36.84■■■■□ 3.49
MTMR1-211ENST00000490316 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP36.84■■■■□ 3.49
MTMR1-211ENST00000490316 THSD7BQ9C0I4 1608 aa36.84■■■■□ 3.49
MTMR1-211ENST00000490316 TAF5LO75529 589 aa36.83■■■■□ 3.49
MTMR1-211ENST00000490316 SCARF1Q14162 830 aa36.83■■■■□ 3.49
MTMR1-211ENST00000490316 TNS4Q8IZW8 715 aa36.83■■■■□ 3.49
MTMR1-211ENST00000490316 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP36.83■■■■□ 3.49
MTMR1-211ENST00000490316 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP36.83■■■■□ 3.49
MTMR1-211ENST00000490316 MYO3BQ8WXR4 1341 aa36.83■■■■□ 3.49
MTMR1-211ENST00000490316 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP36.82■■■■□ 3.48
MTMR1-211ENST00000490316 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP36.82■■■■□ 3.48
MTMR1-211ENST00000490316 TAF7LQ5H9L4 462 aa36.82■■■■□ 3.48
MTMR1-211ENST00000490316 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa36.82■■■■□ 3.48
MTMR1-211ENST00000490316 SULF1Q8IWU6 871 aa36.82■■■■□ 3.48
MTMR1-211ENST00000490316 SUCLG2Q96I99 432 aa36.82■■■■□ 3.48
MTMR1-211ENST00000490316 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP36.82■■■■□ 3.48
MTMR1-211ENST00000490316 MXD3Q9BW11 206 aa36.82■■■■□ 3.48
MTMR1-211ENST00000490316 UTYO14607 1347 aa36.82■■■■□ 3.48
MTMR1-211ENST00000490316 A0A1B0GUL6 1792 aa36.81■■■■□ 3.48
MTMR1-211ENST00000490316 SNAP23O00161 211 aa36.8■■■■□ 3.48
MTMR1-211ENST00000490316 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP36.8■■■■□ 3.48
MTMR1-211ENST00000490316 TTLL5Q6EMB2 1281 aa36.8■■■■□ 3.48
MTMR1-211ENST00000490316 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP36.8■■■■□ 3.48
MTMR1-211ENST00000490316 KAZALD1Q96I82 304 aa36.8■■■■□ 3.48
MTMR1-211ENST00000490316 ALDH1L2Q3SY69 923 aa36.79■■■■□ 3.48
MTMR1-211ENST00000490316 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP36.79■■■■□ 3.48
MTMR1-211ENST00000490316 OGFOD1Q8N543 542 aa36.79■■■■□ 3.48
MTMR1-211ENST00000490316 CNNM1Q9NRU3 951 aa36.79■■■■□ 3.48
MTMR1-211ENST00000490316 IRS2Q9Y4H2 1338 aa36.79■■■■□ 3.48
MTMR1-211ENST00000490316 MAP2K2P36507 400 aa36.78■■■■□ 3.48
MTMR1-211ENST00000490316 CD209Q9NNX6 404 aa36.78■■■■□ 3.48
MTMR1-211ENST00000490316 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP36.77■■■■□ 3.48
MTMR1-211ENST00000490316 PRDM10Q9NQV6 1147 aa36.77■■■■□ 3.48
MTMR1-211ENST00000490316 AOC2O75106 756 aa36.76■■■■□ 3.48
MTMR1-211ENST00000490316 HUNKP57058 714 aa36.76■■■■□ 3.48
MTMR1-211ENST00000490316 GTF2IP78347 998 aa36.76■■■■□ 3.48
MTMR1-211ENST00000490316 C2orf69Q8N8R5 385 aa36.76■■■■□ 3.48
MTMR1-211ENST00000490316 MMP14P50281 582 aa36.75■■■■□ 3.47
MTMR1-211ENST00000490316 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa36.75■■■■□ 3.47
MTMR1-211ENST00000490316 PLIN1O60240 522 aa36.74■■■■□ 3.47
MTMR1-211ENST00000490316 CDCA5Q96FF9 252 aa36.73■■■■□ 3.47
MTMR1-211ENST00000490316 BEGAINQ9BUH8 593 aa36.73■■■■□ 3.47
MTMR1-211ENST00000490316 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP36.73■■■■□ 3.47
MTMR1-211ENST00000490316 LBX1P52954 281 aa36.72■■■■□ 3.47
MTMR1-211ENST00000490316 NBPF9Q3BBW0 867 aa36.72■■■■□ 3.47
MTMR1-211ENST00000490316 ZNF804AQ7Z570 1209 aa36.72■■■■□ 3.47
MTMR1-211ENST00000490316 SMC4Q9NTJ3 1288 aa36.72■■■■□ 3.47
MTMR1-211ENST00000490316 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP36.71■■■■□ 3.47
MTMR1-211ENST00000490316 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP36.71■■■■□ 3.47
MTMR1-211ENST00000490316 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP36.7■■■■□ 3.47
MTMR1-211ENST00000490316 KIAA0825Q8IV33 1275 aa36.7■■■■□ 3.47
MTMR1-211ENST00000490316 HDAC9Q9UKV0 1011 aa36.7■■■■□ 3.47
MTMR1-211ENST00000490316 WNT10BO00744 389 aa36.69■■■■□ 3.46
MTMR1-211ENST00000490316 IL1R1P14778 569 aa36.69■■■■□ 3.46
MTMR1-211ENST00000490316 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP36.69■■■■□ 3.46
MTMR1-211ENST00000490316 RGMBQ6NW40 437 aa36.68■■■■□ 3.46
MTMR1-211ENST00000490316 USP44Q9H0E7 712 aa36.68■■■■□ 3.46
MTMR1-211ENST00000490316 ANKRD44Q8N8A2 993 aa36.67■■■■□ 3.46
MTMR1-211ENST00000490316 NOGQ13253 232 aa36.66■■■■□ 3.46
MTMR1-211ENST00000490316 UBE4AQ14139 1066 aa36.66■■■■□ 3.46
MTMR1-211ENST00000490316 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa36.66■■■■□ 3.46
MTMR1-211ENST00000490316 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP36.65■■■■□ 3.46
MTMR1-211ENST00000490316 MROH5Q6ZUA9 1318 aa36.64■■■■□ 3.46
MTMR1-211ENST00000490316 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP36.64■■■■□ 3.46
MTMR1-211ENST00000490316 SASH1O94885 1247 aa36.63■■■■□ 3.45
MTMR1-211ENST00000490316 CERS5Q8N5B7 392 aa36.63■■■■□ 3.45
MTMR1-211ENST00000490316 CCDC102AQ96A19 550 aa36.62■■■■□ 3.45
MTMR1-211ENST00000490316 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP36.61■■■■□ 3.45
MTMR1-211ENST00000490316 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP36.61■■■■□ 3.45
MTMR1-211ENST00000490316 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP36.61■■■■□ 3.45
MTMR1-211ENST00000490316 FKBP1BP68106 108 aa36.61■■■■□ 3.45
MTMR1-211ENST00000490316 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP36.61■■■■□ 3.45
MTMR1-211ENST00000490316 ZIC5Q96T25 663 aa36.6■■■■□ 3.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms