RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490302.1

PKDCC-208, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

TSL 2

Gene PKDCC, Length 1,447 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-208ENST00000490302 IGKV5-2P06315 115 aa22.37■■□□□ 1.17
PKDCC-208ENST00000490302 NBPF9Q3BBW0 867 aa22.37■■□□□ 1.17
PKDCC-208ENST00000490302 OGFOD1Q8N543 542 aa22.37■■□□□ 1.17
PKDCC-208ENST00000490302 FBXW7Q969H0 707 aa22.37■■□□□ 1.17
PKDCC-208ENST00000490302 GREM2Q9H772 168 aa22.37■■□□□ 1.17
PKDCC-208ENST00000490302 PI4KAP2A4QPH2 592 aa22.36■■□□□ 1.17
PKDCC-208ENST00000490302 CCT4P50991 539 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
PKDCC-208ENST00000490302 NEXNQ0ZGT2 675 aa22.36■■□□□ 1.17
PKDCC-208ENST00000490302 DACT2Q5SW24 774 aa22.36■■□□□ 1.17
PKDCC-208ENST00000490302 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa22.36■■□□□ 1.17
PKDCC-208ENST00000490302 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa22.36■■□□□ 1.17
PKDCC-208ENST00000490302 MYO3BQ8WXR4 1341 aa22.35■■□□□ 1.17
PKDCC-208ENST00000490302 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
PKDCC-208ENST00000490302 TSPYL6Q8N831 410 aa22.35■■□□□ 1.17
PKDCC-208ENST00000490302 MXD3Q9BW11 206 aa22.35■■□□□ 1.17
PKDCC-208ENST00000490302 NF2P35240 595 aa22.34■■□□□ 1.17
PKDCC-208ENST00000490302 STRIP1Q5VSL9 837 aa22.34■■□□□ 1.17
PKDCC-208ENST00000490302 COA1Q9GZY4 146 aa22.34■■□□□ 1.17
PKDCC-208ENST00000490302 WNT10BO00744 389 aa22.33■■□□□ 1.17
PKDCC-208ENST00000490302 STK31Q9BXU1 1019 aa22.33■■□□□ 1.17
PKDCC-208ENST00000490302 HDAC9Q9UKV0 1011 aa22.33■■□□□ 1.17
PKDCC-208ENST00000490302 LEMD3Q9Y2U8 911 aa22.33■■□□□ 1.17
PKDCC-208ENST00000490302 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
PKDCC-208ENST00000490302 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
PKDCC-208ENST00000490302 NEURL1BA8MQ27 555 aa22.31■■□□□ 1.16
PKDCC-208ENST00000490302 TBC1D8O95759 1140 aa22.31■■□□□ 1.16
PKDCC-208ENST00000490302 MMP14P50281 582 aa22.31■■□□□ 1.16
PKDCC-208ENST00000490302 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
PKDCC-208ENST00000490302 H7C1W4 665 aa22.31■■□□□ 1.16
PKDCC-208ENST00000490302 TM4SF4P48230 202 aa22.31■■□□□ 1.16
PKDCC-208ENST00000490302 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa22.31■■□□□ 1.16
PKDCC-208ENST00000490302 TXNRD3Q86VQ6 643 aa22.31■■□□□ 1.16
PKDCC-208ENST00000490302 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
PKDCC-208ENST00000490302 HPS5Q9UPZ3 1129 aa22.31■■□□□ 1.16
PKDCC-208ENST00000490302 SASH1O94885 1247 aa22.3■■□□□ 1.16
PKDCC-208ENST00000490302 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
PKDCC-208ENST00000490302 ANKRD2Q9GZV1 360 aa22.3■■□□□ 1.16
PKDCC-208ENST00000490302 ZNF804BA4D1E1 1349 aa22.29■■□□□ 1.16
PKDCC-208ENST00000490302 TTLL5Q6EMB2 1281 aa22.29■■□□□ 1.16
PKDCC-208ENST00000490302 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
PKDCC-208ENST00000490302 G2E3Q7L622 706 aa22.28■■□□□ 1.16
PKDCC-208ENST00000490302 ARMC9Q7Z3E5 817 aa22.28■■□□□ 1.16
PKDCC-208ENST00000490302 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
PKDCC-208ENST00000490302 SPEF2Q9C093 1822 aa22.27■■□□□ 1.16
PKDCC-208ENST00000490302 GPR25O00155 361 aa22.27■■□□□ 1.16
PKDCC-208ENST00000490302 ITGA6P23229 1130 aa22.27■■□□□ 1.16
PKDCC-208ENST00000490302 SREBF2Q12772 1141 aa22.27■■□□□ 1.16
PKDCC-208ENST00000490302 KIAA0825Q8IV33 1275 aa22.27■■□□□ 1.16
PKDCC-208ENST00000490302 MPHOSPH8Q99549 860 aa22.27■■□□□ 1.16
PKDCC-208ENST00000490302 PLA2G12BQ9BX93 195 aa22.27■■□□□ 1.16
PKDCC-208ENST00000490302 SLC4A2P04920 1241 aa22.26■■□□□ 1.15
PKDCC-208ENST00000490302 KLRK1P26718 216 aa22.26■■□□□ 1.15
PKDCC-208ENST00000490302 GTF2IP78347 998 aa22.26■■□□□ 1.15
PKDCC-208ENST00000490302 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
PKDCC-208ENST00000490302 PRKG1Q13976 671 aa22.26■■□□□ 1.15
PKDCC-208ENST00000490302 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
PKDCC-208ENST00000490302 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
PKDCC-208ENST00000490302 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
PKDCC-208ENST00000490302 MYH3P11055 1940 aa22.25■■□□□ 1.15
PKDCC-208ENST00000490302 KCNJ4P48050 445 aa22.25■■□□□ 1.15
PKDCC-208ENST00000490302 GCKRQ14397 625 aa22.25■■□□□ 1.15
PKDCC-208ENST00000490302 PCDH10Q9P2E7 1040 aa22.24■■□□□ 1.15
PKDCC-208ENST00000490302 CSF1RP07333 972 aa22.23■■□□□ 1.15
PKDCC-208ENST00000490302 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
PKDCC-208ENST00000490302 MYH16Q9H6N6 1097 aa22.23■■□□□ 1.15
PKDCC-208ENST00000490302 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
PKDCC-208ENST00000490302 CASP7P55210 303 aa22.23■■□□□ 1.15
PKDCC-208ENST00000490302 CHRNDQ07001 517 aa22.23■■□□□ 1.15
PKDCC-208ENST00000490302 CCDC27Q2M243 656 aa22.23■■□□□ 1.15
PKDCC-208ENST00000490302 LDLRAD1Q5T700 205 aa22.23■■□□□ 1.15
PKDCC-208ENST00000490302 CFHR5Q9BXR6 569 aa22.23■■□□□ 1.15
PKDCC-208ENST00000490302 CD209Q9NNX6 404 aa22.23■■□□□ 1.15
PKDCC-208ENST00000490302 FKTNO75072 461 aa22.22■■□□□ 1.15
PKDCC-208ENST00000490302 FLIIQ13045 1269 aa22.22■■□□□ 1.15
PKDCC-208ENST00000490302 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
PKDCC-208ENST00000490302 SPRYD7Q5W111 196 aa22.22■■□□□ 1.15
PKDCC-208ENST00000490302 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
PKDCC-208ENST00000490302 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa22.21■■□□□ 1.15
PKDCC-208ENST00000490302 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
PKDCC-208ENST00000490302 DLGAP5Q15398 846 aa22.21■■□□□ 1.15
PKDCC-208ENST00000490302 WWC1Q8IX03 1113 aa22.21■■□□□ 1.15
PKDCC-208ENST00000490302 DNAAF4Q8WXU2 420 aa22.21■■□□□ 1.15
PKDCC-208ENST00000490302 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.15
PKDCC-208ENST00000490302 LINS1Q8NG48 757 aa22.2■■□□□ 1.14
PKDCC-208ENST00000490302 DEFB129Q9H1M3 183 aa22.2■■□□□ 1.14
PKDCC-208ENST00000490302 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
PKDCC-208ENST00000490302 ALDH1A1P00352 501 aa22.19■■□□□ 1.14
PKDCC-208ENST00000490302 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa22.19■■□□□ 1.14
PKDCC-208ENST00000490302 FZD1Q9UP38 647 aa22.19■■□□□ 1.14
PKDCC-208ENST00000490302 MTMR14Q8NCE2 650 aa22.18■■□□□ 1.14
PKDCC-208ENST00000490302 SLC10A4Q96EP9 437 aa22.18■■□□□ 1.14
PKDCC-208ENST00000490302 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
PKDCC-208ENST00000490302 IL16Q14005 1332 aa22.18■■□□□ 1.14
PKDCC-208ENST00000490302 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
PKDCC-208ENST00000490302 SNAP23O00161 211 aa22.17■■□□□ 1.14
PKDCC-208ENST00000490302 TAF5LO75529 589 aa22.17■■□□□ 1.14
PKDCC-208ENST00000490302 INHBEP58166 350 aa22.17■■□□□ 1.14
PKDCC-208ENST00000490302 MAP3K11Q16584 847 aa22.17■■□□□ 1.14
PKDCC-208ENST00000490302 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
PKDCC-208ENST00000490302 CERS5Q8N5B7 392 aa22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.8 ms