RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489581.1

TOP3B-217, Transcript of DNA topoisomerase III beta, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3B, Length 789 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3B-217ENST00000489581 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa21.85■■□□□ 1.09
TOP3B-217ENST00000489581 TTLL11Q8NHH1 800 aa21.85■■□□□ 1.09
TOP3B-217ENST00000489581 GREM2Q9H772 168 aa21.85■■□□□ 1.09
TOP3B-217ENST00000489581 MINPP1Q9UNW1 487 aa21.85■■□□□ 1.09
TOP3B-217ENST00000489581 UBE2Q2LH0YL09 131 aa21.84■■□□□ 1.09
TOP3B-217ENST00000489581 SOX10P56693 466 aa21.84■■□□□ 1.09
TOP3B-217ENST00000489581 FBXW7Q969H0 707 aa21.84■■□□□ 1.09
TOP3B-217ENST00000489581 CHMP4AQ9BY43 222 aa21.84■■□□□ 1.09
TOP3B-217ENST00000489581 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
TOP3B-217ENST00000489581 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
TOP3B-217ENST00000489581 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
TOP3B-217ENST00000489581 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.09
TOP3B-217ENST00000489581 MED23Q9ULK4 1368 aa21.83■■□□□ 1.08
TOP3B-217ENST00000489581 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
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TOP3B-217ENST00000489581 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
TOP3B-217ENST00000489581 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
TOP3B-217ENST00000489581 NEXNQ0ZGT2 675 aa21.81■■□□□ 1.08
TOP3B-217ENST00000489581 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
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TOP3B-217ENST00000489581 TXNRD3Q86VQ6 643 aa21.81■■□□□ 1.08
TOP3B-217ENST00000489581 OGFOD1Q8N543 542 aa21.8■■□□□ 1.08
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TOP3B-217ENST00000489581 WNT10BO00744 389 aa21.79■■□□□ 1.08
TOP3B-217ENST00000489581 TBC1D8O95759 1140 aa21.79■■□□□ 1.08
TOP3B-217ENST00000489581 STK31Q9BXU1 1019 aa21.79■■□□□ 1.08
TOP3B-217ENST00000489581 COA1Q9GZY4 146 aa21.79■■□□□ 1.08
TOP3B-217ENST00000489581 STRIP1Q5VSL9 837 aa21.78■■□□□ 1.08
TOP3B-217ENST00000489581 G2E3Q7L622 706 aa21.78■■□□□ 1.08
TOP3B-217ENST00000489581 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa21.78■■□□□ 1.08
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TOP3B-217ENST00000489581 SASH1O94885 1247 aa21.77■■□□□ 1.08
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TOP3B-217ENST00000489581 MYO3BQ8WXR4 1341 aa21.77■■□□□ 1.07
TOP3B-217ENST00000489581 KLRK1P26718 216 aa21.76■■□□□ 1.07
TOP3B-217ENST00000489581 NF2P35240 595 aa21.76■■□□□ 1.07
TOP3B-217ENST00000489581 TTLL5Q6EMB2 1281 aa21.76■■□□□ 1.07
TOP3B-217ENST00000489581 SLC4A2P04920 1241 aa21.75■■□□□ 1.07
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TOP3B-217ENST00000489581 PRKG1Q13976 671 aa21.75■■□□□ 1.07
TOP3B-217ENST00000489581 KIAA0825Q8IV33 1275 aa21.75■■□□□ 1.07
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TOP3B-217ENST00000489581 ZNF804BA4D1E1 1349 aa21.75■■□□□ 1.07
TOP3B-217ENST00000489581 TM4SF4P48230 202 aa21.74■■□□□ 1.07
TOP3B-217ENST00000489581 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
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TOP3B-217ENST00000489581 MPHOSPH8Q99549 860 aa21.73■■□□□ 1.07
TOP3B-217ENST00000489581 ANKRD2Q9GZV1 360 aa21.73■■□□□ 1.07
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TOP3B-217ENST00000489581 MMP14P50281 582 aa21.71■■□□□ 1.07
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TOP3B-217ENST00000489581 FLIIQ13045 1269 aa21.7■■□□□ 1.06
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TOP3B-217ENST00000489581 FZD1Q9UP38 647 aa21.7■■□□□ 1.06
TOP3B-217ENST00000489581 SNAP23O00161 211 aa21.69■■□□□ 1.06
TOP3B-217ENST00000489581 SREBF2Q12772 1141 aa21.69■■□□□ 1.06
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TOP3B-217ENST00000489581 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
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TOP3B-217ENST00000489581 MYH16Q9H6N6 1097 aa21.69■■□□□ 1.06
TOP3B-217ENST00000489581 CD209Q9NNX6 404 aa21.69■■□□□ 1.06
TOP3B-217ENST00000489581 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
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TOP3B-217ENST00000489581 DLGAP5Q15398 846 aa21.66■■□□□ 1.06
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TOP3B-217ENST00000489581 DEFB129Q9H1M3 183 aa21.66■■□□□ 1.06
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TOP3B-217ENST00000489581 ECM29Q5VYK3 1845 aa21.66■■□□□ 1.06
TOP3B-217ENST00000489581 SLC10A4Q96EP9 437 aa21.65■■□□□ 1.06
TOP3B-217ENST00000489581 A0A1B0GUL6 1792 aa21.64■■□□□ 1.06
TOP3B-217ENST00000489581 F8W031 263 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
TOP3B-217ENST00000489581 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
TOP3B-217ENST00000489581 IL16Q14005 1332 aa21.63■■□□□ 1.05
TOP3B-217ENST00000489581 IRS2Q9Y4H2 1338 aa21.63■■□□□ 1.05
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