RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486480.1

PTPRN-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRN, Length 563 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-216ENST00000486480 RRP1P56182 461 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
PTPRN-216ENST00000486480 TNIP1Q15025 636 aa23.83■■□□□ 1.41
PTPRN-216ENST00000486480 ATG9AQ7Z3C6 839 aa23.83■■□□□ 1.41
PTPRN-216ENST00000486480 UBE4AQ14139 1066 aa23.82■■□□□ 1.4
PTPRN-216ENST00000486480 COA1Q9GZY4 146 aa23.82■■□□□ 1.4
PTPRN-216ENST00000486480 IQCA1LA6NCM1 817 aa23.81■■□□□ 1.4
PTPRN-216ENST00000486480 PDE8BO95263 885 aa23.81■■□□□ 1.4
PTPRN-216ENST00000486480 PODNQ7Z5L7 613 aa23.81■■□□□ 1.4
PTPRN-216ENST00000486480 KCNQ5Q9NR82 932 aa23.81■■□□□ 1.4
PTPRN-216ENST00000486480 PSMD14O00487 310 aa23.8■■□□□ 1.4
PTPRN-216ENST00000486480 SCNN1DP51172 638 aa23.8■■□□□ 1.4
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PTPRN-216ENST00000486480 HACL1Q9UJ83 578 aa23.8■■□□□ 1.4
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PTPRN-216ENST00000486480 ATP8B2P98198 1209 aa23.79■■□□□ 1.4
PTPRN-216ENST00000486480 POLA2Q14181 598 aa23.79■■□□□ 1.4
PTPRN-216ENST00000486480 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP23.79■■□□□ 1.4
PTPRN-216ENST00000486480 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
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PTPRN-216ENST00000486480 ZNF804AQ7Z570 1209 aa23.78■■□□□ 1.4
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PTPRN-216ENST00000486480 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa23.78■■□□□ 1.4
PTPRN-216ENST00000486480 ZNF609O15014 1411 aa23.77■■□□□ 1.4
PTPRN-216ENST00000486480 MYH13Q9UKX3 1938 aa23.77■■□□□ 1.4
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PTPRN-216ENST00000486480 CD209Q9NNX6 404 aa23.77■■□□□ 1.4
PTPRN-216ENST00000486480 GPRC5DQ9NZD1 345 aa23.77■■□□□ 1.4
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PTPRN-216ENST00000486480 EPHX2P34913 555 aa23.76■■□□□ 1.39
PTPRN-216ENST00000486480 CEP126Q9P2H0 1117 aa23.76■■□□□ 1.39
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PTPRN-216ENST00000486480 VIL1P09327 827 aaKnown RBP23.75■■□□□ 1.39
PTPRN-216ENST00000486480 USP17L1Q7RTZ2 530 aa23.75■■□□□ 1.39
PTPRN-216ENST00000486480 RPS12P25398 132 aaKnown RBP23.74■■□□□ 1.39
PTPRN-216ENST00000486480 EPS15P42566 896 aa23.74■■□□□ 1.39
PTPRN-216ENST00000486480 GYG1P46976 350 aa23.74■■□□□ 1.39
PTPRN-216ENST00000486480 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
PTPRN-216ENST00000486480 SLC5A1P13866 664 aa23.73■■□□□ 1.39
PTPRN-216ENST00000486480 IL1R1P14778 569 aa23.73■■□□□ 1.39
PTPRN-216ENST00000486480 ATP2B3Q16720 1220 aa23.73■■□□□ 1.39
PTPRN-216ENST00000486480 STRIP1Q5VSL9 837 aa23.73■■□□□ 1.39
PTPRN-216ENST00000486480 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
PTPRN-216ENST00000486480 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
PTPRN-216ENST00000486480 LPIN2Q92539 896 aa23.73■■□□□ 1.39
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PTPRN-216ENST00000486480 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP23.73■■□□□ 1.39
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PTPRN-216ENST00000486480 POTEJP0CG39 1038 aa23.71■■□□□ 1.39
PTPRN-216ENST00000486480 C1QTNF8P60827 252 aa23.71■■□□□ 1.39
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PTPRN-216ENST00000486480 SHTN1A0MZ66 631 aa23.7■■□□□ 1.38
PTPRN-216ENST00000486480 GTF2IP78347 998 aa23.7■■□□□ 1.38
PTPRN-216ENST00000486480 CAVIN4Q5BKX8 364 aa23.7■■□□□ 1.38
PTPRN-216ENST00000486480 FBXO33Q7Z6M2 555 aa23.7■■□□□ 1.38
PTPRN-216ENST00000486480 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
PTPRN-216ENST00000486480 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
PTPRN-216ENST00000486480 AGBL3Q8NEM8 1001 aa23.7■■□□□ 1.38
PTPRN-216ENST00000486480 GMLQ99445 158 aa23.7■■□□□ 1.38
PTPRN-216ENST00000486480 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
PTPRN-216ENST00000486480 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
PTPRN-216ENST00000486480 MYO3BQ8WXR4 1341 aa23.69■■□□□ 1.38
PTPRN-216ENST00000486480 SURF6O75683 361 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
PTPRN-216ENST00000486480 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
PTPRN-216ENST00000486480 TTLL5Q6EMB2 1281 aa23.69■■□□□ 1.38
PTPRN-216ENST00000486480 VPS37DQ86XT2 251 aa23.69■■□□□ 1.38
PTPRN-216ENST00000486480 SMC1BQ8NDV3 1235 aa23.69■■□□□ 1.38
PTPRN-216ENST00000486480 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
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PTPRN-216ENST00000486480 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
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PTPRN-216ENST00000486480 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
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PTPRN-216ENST00000486480 SIRT2Q8IXJ6 389 aa23.68■■□□□ 1.38
PTPRN-216ENST00000486480 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
PTPRN-216ENST00000486480 H7C1D1 291 aa23.67■■□□□ 1.38
PTPRN-216ENST00000486480 HMMRO75330 724 aa23.67■■□□□ 1.38
PTPRN-216ENST00000486480 BCAMP50895 628 aa23.67■■□□□ 1.38
PTPRN-216ENST00000486480 AKAP2Q9Y2D5 859 aa23.67■■□□□ 1.38
PTPRN-216ENST00000486480 FAM205AQ6ZU69 1335 aa23.66■■□□□ 1.38
PTPRN-216ENST00000486480 FSTL1Q12841 308 aa23.66■■□□□ 1.38
PTPRN-216ENST00000486480 TRPM4Q8TD43 1214 aa23.66■■□□□ 1.38
PTPRN-216ENST00000486480 CRBNQ96SW2 442 aa23.66■■□□□ 1.38
PTPRN-216ENST00000486480 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
PTPRN-216ENST00000486480 A0A1B0GUL7 405 aa23.65■■□□□ 1.38
PTPRN-216ENST00000486480 ADORA1P30542 326 aa23.65■■□□□ 1.38
PTPRN-216ENST00000486480 CHADLQ6NUI6 762 aa23.65■■□□□ 1.38
PTPRN-216ENST00000486480 CERS5Q8N5B7 392 aa23.65■■□□□ 1.38
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