RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485272.5

RIPPLY3-202, Transcript of ripply transcriptional repressor 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RIPPLY3, Length 2,005 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY3-202ENST00000485272 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
RIPPLY3-202ENST00000485272 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa14.71□□□□□ -0.06
RIPPLY3-202ENST00000485272 MROH5Q6ZUA9 1318 aa14.7□□□□□ -0.06
RIPPLY3-202ENST00000485272 SALL3Q9BXA9 1300 aa14.7□□□□□ -0.06
RIPPLY3-202ENST00000485272 A0A0G2JLW4 131 aa14.7□□□□□ -0.06
RIPPLY3-202ENST00000485272 HSCBQ8IWL3 235 aa14.7□□□□□ -0.06
RIPPLY3-202ENST00000485272 CHMP5Q9NZZ3 219 aa14.7□□□□□ -0.06
RIPPLY3-202ENST00000485272 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
RIPPLY3-202ENST00000485272 NEUROD6Q96NK8 337 aa14.7□□□□□ -0.06
RIPPLY3-202ENST00000485272 GRPEL1Q9HAV7 217 aa14.7□□□□□ -0.06
RIPPLY3-202ENST00000485272 A0A1B0GUL7 405 aa14.69□□□□□ -0.06
RIPPLY3-202ENST00000485272 PDE4CQ08493 712 aa14.69□□□□□ -0.06
RIPPLY3-202ENST00000485272 OLFM4Q6UX06 510 aa14.69□□□□□ -0.06
RIPPLY3-202ENST00000485272 KLHL34Q8N239 644 aa14.69□□□□□ -0.06
RIPPLY3-202ENST00000485272 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
RIPPLY3-202ENST00000485272 SPON1Q9HCB6 807 aa14.69□□□□□ -0.06
RIPPLY3-202ENST00000485272 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
RIPPLY3-202ENST00000485272 BBOX1O75936 387 aa14.68□□□□□ -0.06
RIPPLY3-202ENST00000485272 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
RIPPLY3-202ENST00000485272 DPEP1P16444 411 aa14.68□□□□□ -0.06
RIPPLY3-202ENST00000485272 KCNA3P22001 575 aa14.68□□□□□ -0.06
RIPPLY3-202ENST00000485272 ALDH1B1P30837 517 aa14.68□□□□□ -0.06
RIPPLY3-202ENST00000485272 DBNDD2Q9BQY9 259 aa14.68□□□□□ -0.06
RIPPLY3-202ENST00000485272 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
RIPPLY3-202ENST00000485272 LRRC37AA6NMS7 1700 aa14.68□□□□□ -0.06
RIPPLY3-202ENST00000485272 MX1P20591 662 aa14.68□□□□□ -0.06
RIPPLY3-202ENST00000485272 PDE1AP54750 535 aa14.68□□□□□ -0.06
RIPPLY3-202ENST00000485272 STYK1Q6J9G0 422 aa14.68□□□□□ -0.06
RIPPLY3-202ENST00000485272 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa14.68□□□□□ -0.06
RIPPLY3-202ENST00000485272 GPR108Q9NPR9 543 aa14.68□□□□□ -0.06
RIPPLY3-202ENST00000485272 TAOK2Q9UL54 1235 aa14.68□□□□□ -0.06
RIPPLY3-202ENST00000485272 ZNF609O15014 1411 aa14.68□□□□□ -0.06
RIPPLY3-202ENST00000485272 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
RIPPLY3-202ENST00000485272 ADORA1P30542 326 aa14.67□□□□□ -0.06
RIPPLY3-202ENST00000485272 ATP2B3Q16720 1220 aa14.67□□□□□ -0.06
RIPPLY3-202ENST00000485272 WWC3Q9ULE0 1092 aa14.67□□□□□ -0.06
RIPPLY3-202ENST00000485272 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
RIPPLY3-202ENST00000485272 FGFR2P21802 821 aa14.66□□□□□ -0.06
RIPPLY3-202ENST00000485272 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
RIPPLY3-202ENST00000485272 AKAP2Q9Y2D5 859 aa14.66□□□□□ -0.06
RIPPLY3-202ENST00000485272 ARAP2Q8WZ64 1704 aa14.66□□□□□ -0.06
RIPPLY3-202ENST00000485272 OFD1O75665 1012 aa14.66□□□□□ -0.06
RIPPLY3-202ENST00000485272 PTMSP20962 102 aa14.66□□□□□ -0.06
RIPPLY3-202ENST00000485272 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
RIPPLY3-202ENST00000485272 XAGE2Q96GT9 111 aa14.66□□□□□ -0.06
RIPPLY3-202ENST00000485272 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
RIPPLY3-202ENST00000485272 AK9Q5TCS8 1911 aa14.65□□□□□ -0.06
RIPPLY3-202ENST00000485272 TRAK2O60296 914 aa14.65□□□□□ -0.06
RIPPLY3-202ENST00000485272 GPSM2P81274 684 aa14.65□□□□□ -0.06
RIPPLY3-202ENST00000485272 OSBPL3Q9H4L5 887 aa14.65□□□□□ -0.06
RIPPLY3-202ENST00000485272 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa14.65□□□□□ -0.06
RIPPLY3-202ENST00000485272 STAP2Q9UGK3 403 aa14.65□□□□□ -0.06
RIPPLY3-202ENST00000485272 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
RIPPLY3-202ENST00000485272 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa14.65□□□□□ -0.06
RIPPLY3-202ENST00000485272 AKAP11Q9UKA4 1901 aa14.65□□□□□ -0.06
RIPPLY3-202ENST00000485272 LTBP1Q14766 1721 aa14.65□□□□□ -0.06
RIPPLY3-202ENST00000485272 CDC45O75419 566 aa14.65□□□□□ -0.06
RIPPLY3-202ENST00000485272 TGFB2P61812 414 aa14.65□□□□□ -0.06
RIPPLY3-202ENST00000485272 SP8Q8IXZ3 490 aa14.65□□□□□ -0.06
RIPPLY3-202ENST00000485272 LPIN2Q92539 896 aa14.65□□□□□ -0.06
RIPPLY3-202ENST00000485272 CNKSR1Q969H4 720 aa14.65□□□□□ -0.06
RIPPLY3-202ENST00000485272 ANKRD2Q9GZV1 360 aa14.65□□□□□ -0.06
RIPPLY3-202ENST00000485272 KLRK1P26718 216 aa14.64□□□□□ -0.07
RIPPLY3-202ENST00000485272 PI4K2BQ8TCG2 481 aa14.64□□□□□ -0.07
RIPPLY3-202ENST00000485272 ECHDC1Q9NTX5 307 aa14.64□□□□□ -0.07
RIPPLY3-202ENST00000485272 CD2APQ9Y5K6 639 aa14.64□□□□□ -0.07
RIPPLY3-202ENST00000485272 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY3-202ENST00000485272 NLGN2Q8NFZ4 835 aa14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY3-202ENST00000485272 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY3-202ENST00000485272 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY3-202ENST00000485272 UBE4AQ14139 1066 aa14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY3-202ENST00000485272 TTC22Q5TAA0 569 aa14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY3-202ENST00000485272 TMC4Q7Z404 712 aa14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY3-202ENST00000485272 TXNRD3Q86VQ6 643 aa14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY3-202ENST00000485272 TTLL6Q8N841 843 aa14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY3-202ENST00000485272 C7orf43Q8WVR3 580 aa14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY3-202ENST00000485272 ZNF804BA4D1E1 1349 aa14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY3-202ENST00000485272 XDHP47989 1333 aa14.63□□□□□ -0.07
RIPPLY3-202ENST00000485272 C21orf2O43822 256 aa14.62□□□□□ -0.07
RIPPLY3-202ENST00000485272 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
RIPPLY3-202ENST00000485272 SLC5A1P13866 664 aa14.62□□□□□ -0.07
RIPPLY3-202ENST00000485272 KCNJ4P48050 445 aa14.62□□□□□ -0.07
RIPPLY3-202ENST00000485272 GORABQ5T7V8 394 aa14.62□□□□□ -0.07
RIPPLY3-202ENST00000485272 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
RIPPLY3-202ENST00000485272 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
RIPPLY3-202ENST00000485272 BOLA2Q9H3K6 86 aa14.62□□□□□ -0.07
RIPPLY3-202ENST00000485272 POLLQ9UGP5 575 aa14.62□□□□□ -0.07
RIPPLY3-202ENST00000485272 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa14.62□□□□□ -0.07
RIPPLY3-202ENST00000485272 TTC41PQ6P2S7 1318 aa14.62□□□□□ -0.07
RIPPLY3-202ENST00000485272 MYH13Q9UKX3 1938 aa14.62□□□□□ -0.07
RIPPLY3-202ENST00000485272 DDX11L8A8MPP1 907 aa14.61□□□□□ -0.07
RIPPLY3-202ENST00000485272 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
RIPPLY3-202ENST00000485272 PHKA1P46020 1223 aa14.61□□□□□ -0.07
RIPPLY3-202ENST00000485272 GYG1P46976 350 aa14.61□□□□□ -0.07
RIPPLY3-202ENST00000485272 BCAMP50895 628 aa14.61□□□□□ -0.07
RIPPLY3-202ENST00000485272 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
RIPPLY3-202ENST00000485272 PIM2Q9P1W9 311 aa14.61□□□□□ -0.07
RIPPLY3-202ENST00000485272 CHD4Q14839 1912 aa14.61□□□□□ -0.07
RIPPLY3-202ENST00000485272 DUOX1Q9NRD9 1551 aa14.61□□□□□ -0.07
RIPPLY3-202ENST00000485272 CCDC102BQ68D86 513 aa14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39 ms