RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481641.1

CLK1-211, Transcript of CDC like kinase 1, humanhuman

TSL 4

Gene CLK1, Length 690 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1-211ENST00000481641 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
CLK1-211ENST00000481641 MPHOSPH8Q99549 860 aa23.61■■□□□ 1.37
CLK1-211ENST00000481641 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
CLK1-211ENST00000481641 FBXW7Q969H0 707 aa23.6■■□□□ 1.37
CLK1-211ENST00000481641 GGA3Q9NZ52 723 aa23.6■■□□□ 1.37
CLK1-211ENST00000481641 CHMP3Q9Y3E7 222 aa23.6■■□□□ 1.37
CLK1-211ENST00000481641 THSD7BQ9C0I4 1608 aa23.59■■□□□ 1.37
CLK1-211ENST00000481641 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa23.59■■□□□ 1.37
CLK1-211ENST00000481641 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
CLK1-211ENST00000481641 SCARF1Q14162 830 aa23.59■■□□□ 1.37
CLK1-211ENST00000481641 EPHA10Q5JZY3 1008 aa23.59■■□□□ 1.37
CLK1-211ENST00000481641 PRDM10Q9NQV6 1147 aa23.59■■□□□ 1.37
CLK1-211ENST00000481641 LEMD3Q9Y2U8 911 aa23.59■■□□□ 1.37
CLK1-211ENST00000481641 ZNF804BA4D1E1 1349 aa23.59■■□□□ 1.37
CLK1-211ENST00000481641 SNAP23O00161 211 aa23.58■■□□□ 1.37
CLK1-211ENST00000481641 USP17L8P0C7I0 530 aa23.58■■□□□ 1.37
CLK1-211ENST00000481641 CHRNDQ07001 517 aa23.58■■□□□ 1.37
CLK1-211ENST00000481641 SLC4A10Q6U841 1118 aa23.58■■□□□ 1.37
CLK1-211ENST00000481641 ANKRD2Q9GZV1 360 aa23.58■■□□□ 1.37
CLK1-211ENST00000481641 ZNF609O15014 1411 aa23.58■■□□□ 1.36
CLK1-211ENST00000481641 HUNKP57058 714 aa23.57■■□□□ 1.36
CLK1-211ENST00000481641 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
CLK1-211ENST00000481641 MYOZ2Q9NPC6 264 aa23.57■■□□□ 1.36
CLK1-211ENST00000481641 TAF5LO75529 589 aa23.56■■□□□ 1.36
CLK1-211ENST00000481641 DACT2Q5SW24 774 aa23.56■■□□□ 1.36
CLK1-211ENST00000481641 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
CLK1-211ENST00000481641 LMBR1LQ6UX01 489 aa23.56■■□□□ 1.36
CLK1-211ENST00000481641 HHIPL1Q96JK4 782 aa23.56■■□□□ 1.36
CLK1-211ENST00000481641 COA1Q9GZY4 146 aa23.56■■□□□ 1.36
CLK1-211ENST00000481641 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
CLK1-211ENST00000481641 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
CLK1-211ENST00000481641 GRM8O00222 908 aa23.55■■□□□ 1.36
CLK1-211ENST00000481641 MAP2K2P36507 400 aa23.55■■□□□ 1.36
CLK1-211ENST00000481641 KCNJ4P48050 445 aa23.55■■□□□ 1.36
CLK1-211ENST00000481641 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
CLK1-211ENST00000481641 SULF1Q8IWU6 871 aa23.55■■□□□ 1.36
CLK1-211ENST00000481641 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
CLK1-211ENST00000481641 ZIC5Q96T25 663 aa23.55■■□□□ 1.36
CLK1-211ENST00000481641 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
CLK1-211ENST00000481641 TSKSQ9UJT2 592 aa23.55■■□□□ 1.36
CLK1-211ENST00000481641 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
CLK1-211ENST00000481641 STRIP1Q5VSL9 837 aa23.53■■□□□ 1.36
CLK1-211ENST00000481641 C2orf69Q8N8R5 385 aa23.53■■□□□ 1.36
CLK1-211ENST00000481641 CDCA5Q96FF9 252 aa23.53■■□□□ 1.36
CLK1-211ENST00000481641 BEGAINQ9BUH8 593 aa23.53■■□□□ 1.36
CLK1-211ENST00000481641 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa23.53■■□□□ 1.36
CLK1-211ENST00000481641 ALDH1L1O75891 902 aa23.52■■□□□ 1.36
CLK1-211ENST00000481641 NBPF9Q3BBW0 867 aa23.52■■□□□ 1.36
CLK1-211ENST00000481641 TTLL5Q6EMB2 1281 aa23.52■■□□□ 1.36
CLK1-211ENST00000481641 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
CLK1-211ENST00000481641 GTF2IP78347 998 aa23.51■■□□□ 1.35
CLK1-211ENST00000481641 SUCLG2Q96I99 432 aa23.51■■□□□ 1.35
CLK1-211ENST00000481641 IRS2Q9Y4H2 1338 aa23.51■■□□□ 1.35
CLK1-211ENST00000481641 A0A1B0GUL6 1792 aa23.5■■□□□ 1.35
CLK1-211ENST00000481641 PLIN1O60240 522 aa23.5■■□□□ 1.35
CLK1-211ENST00000481641 CCDC57Q2TAC2 916 aa23.5■■□□□ 1.35
CLK1-211ENST00000481641 RGMBQ6NW40 437 aa23.5■■□□□ 1.35
CLK1-211ENST00000481641 CD209Q9NNX6 404 aa23.5■■□□□ 1.35
CLK1-211ENST00000481641 E9PSI1 815 aa23.49■■□□□ 1.35
CLK1-211ENST00000481641 TAF7LQ5H9L4 462 aa23.49■■□□□ 1.35
CLK1-211ENST00000481641 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa23.49■■□□□ 1.35
CLK1-211ENST00000481641 KAZALD1Q96I82 304 aa23.49■■□□□ 1.35
CLK1-211ENST00000481641 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
CLK1-211ENST00000481641 SLFN5Q08AF3 891 aa23.48■■□□□ 1.35
CLK1-211ENST00000481641 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa23.48■■□□□ 1.35
CLK1-211ENST00000481641 KIAA0825Q8IV33 1275 aa23.48■■□□□ 1.35
CLK1-211ENST00000481641 OGFOD1Q8N543 542 aa23.48■■□□□ 1.35
CLK1-211ENST00000481641 CDCA7LQ96GN5 454 aa23.48■■□□□ 1.35
CLK1-211ENST00000481641 MYO3BQ8WXR4 1341 aa23.48■■□□□ 1.35
CLK1-211ENST00000481641 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
CLK1-211ENST00000481641 WNT10BO00744 389 aa23.47■■□□□ 1.35
CLK1-211ENST00000481641 SASH1O94885 1247 aa23.47■■□□□ 1.35
CLK1-211ENST00000481641 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
CLK1-211ENST00000481641 NOGQ13253 232 aa23.47■■□□□ 1.35
CLK1-211ENST00000481641 SSH1Q8WYL5 1049 aa23.47■■□□□ 1.35
CLK1-211ENST00000481641 CNNM1Q9NRU3 951 aa23.47■■□□□ 1.35
CLK1-211ENST00000481641 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
CLK1-211ENST00000481641 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa23.46■■□□□ 1.35
CLK1-211ENST00000481641 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
CLK1-211ENST00000481641 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
CLK1-211ENST00000481641 MOB2Q70IA6 237 aa23.45■■□□□ 1.34
CLK1-211ENST00000481641 CERS5Q8N5B7 392 aa23.45■■□□□ 1.34
CLK1-211ENST00000481641 JAG2Q9Y219 1238 aa23.45■■□□□ 1.34
CLK1-211ENST00000481641 UTYO14607 1347 aa23.43■■□□□ 1.34
CLK1-211ENST00000481641 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
CLK1-211ENST00000481641 CCDC102AQ96A19 550 aa23.43■■□□□ 1.34
CLK1-211ENST00000481641 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
CLK1-211ENST00000481641 IL1R1P14778 569 aa23.42■■□□□ 1.34
CLK1-211ENST00000481641 ZNF804AQ7Z570 1209 aa23.42■■□□□ 1.34
CLK1-211ENST00000481641 HDAC9Q9UKV0 1011 aa23.42■■□□□ 1.34
CLK1-211ENST00000481641 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa23.42■■□□□ 1.34
CLK1-211ENST00000481641 PTPRCP08575 1304 aa23.41■■□□□ 1.34
CLK1-211ENST00000481641 F8W031 263 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
CLK1-211ENST00000481641 SLC10A3P09131 477 aa23.41■■□□□ 1.34
CLK1-211ENST00000481641 ANKRD44Q8N8A2 993 aa23.41■■□□□ 1.34
CLK1-211ENST00000481641 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
CLK1-211ENST00000481641 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa23.41■■□□□ 1.34
CLK1-211ENST00000481641 UBE2Q2LH0YL09 131 aa23.4■■□□□ 1.34
CLK1-211ENST00000481641 CA12O43570 354 aa23.4■■□□□ 1.34
CLK1-211ENST00000481641 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa23.39■■□□□ 1.33
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