RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479480.5

CTPS1-208, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTPS1, Length 777 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-208ENST00000479480 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
CTPS1-208ENST00000479480 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP10.99□□□□□ -0.65
CTPS1-208ENST00000479480 TAF1P21675 1872 aa10.99□□□□□ -0.65
CTPS1-208ENST00000479480 TRPM7Q96QT4 1865 aa10.99□□□□□ -0.65
CTPS1-208ENST00000479480 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
CTPS1-208ENST00000479480 SCARF1Q14162 830 aa10.98□□□□□ -0.65
CTPS1-208ENST00000479480 RIC3Q7Z5B4 369 aa10.98□□□□□ -0.65
CTPS1-208ENST00000479480 EFCAB3Q8N7B9 438 aa10.98□□□□□ -0.65
CTPS1-208ENST00000479480 FBXO22Q8NEZ5 403 aa10.98□□□□□ -0.65
CTPS1-208ENST00000479480 CCDC102AQ96A19 550 aa10.98□□□□□ -0.65
CTPS1-208ENST00000479480 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
CTPS1-208ENST00000479480 EYA3Q99504 573 aa10.98□□□□□ -0.65
CTPS1-208ENST00000479480 MBIPQ9NS73 344 aa10.98□□□□□ -0.65
CTPS1-208ENST00000479480 HYPKQ9NX55 129 aa10.98□□□□□ -0.65
CTPS1-208ENST00000479480 PODXL2Q9NZ53 605 aa10.98□□□□□ -0.65
CTPS1-208ENST00000479480 UFL1O94874 794 aa10.97□□□□□ -0.65
CTPS1-208ENST00000479480 HOXB7P09629 217 aa10.97□□□□□ -0.65
CTPS1-208ENST00000479480 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
CTPS1-208ENST00000479480 MOB2Q70IA6 237 aa10.97□□□□□ -0.65
CTPS1-208ENST00000479480 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP10.97□□□□□ -0.65
CTPS1-208ENST00000479480 CDCA5Q96FF9 252 aa10.97□□□□□ -0.65
CTPS1-208ENST00000479480 MYD88Q99836 296 aa10.97□□□□□ -0.65
CTPS1-208ENST00000479480 GGA3Q9NZ52 723 aa10.97□□□□□ -0.65
CTPS1-208ENST00000479480 LAMB2P55268 1798 aa10.97□□□□□ -0.65
CTPS1-208ENST00000479480 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa10.96□□□□□ -0.65
CTPS1-208ENST00000479480 SLC10A3P09131 477 aa10.96□□□□□ -0.65
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF853P0CG23 659 aa10.96□□□□□ -0.65
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP10.96□□□□□ -0.65
CTPS1-208ENST00000479480 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
CTPS1-208ENST00000479480 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa10.96□□□□□ -0.65
CTPS1-208ENST00000479480 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP10.96□□□□□ -0.65
CTPS1-208ENST00000479480 SULF1Q8IWU6 871 aa10.96□□□□□ -0.65
CTPS1-208ENST00000479480 GMLQ99445 158 aa10.96□□□□□ -0.65
CTPS1-208ENST00000479480 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP10.96□□□□□ -0.65
CTPS1-208ENST00000479480 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa10.96□□□□□ -0.65
CTPS1-208ENST00000479480 GGA1Q9UJY5 639 aa10.96□□□□□ -0.65
CTPS1-208ENST00000479480 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa10.95□□□□□ -0.66
CTPS1-208ENST00000479480 G3V3G9 751 aa10.95□□□□□ -0.66
CTPS1-208ENST00000479480 SOX10P56693 466 aa10.95□□□□□ -0.66
CTPS1-208ENST00000479480 C8orf58Q8NAV2 365 aa10.95□□□□□ -0.66
CTPS1-208ENST00000479480 MXD3Q9BW11 206 aa10.95□□□□□ -0.66
CTPS1-208ENST00000479480 SAGE1Q9NXZ1 904 aa10.95□□□□□ -0.66
CTPS1-208ENST00000479480 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP10.94□□□□□ -0.66
CTPS1-208ENST00000479480 UBE2Q2LH0YL09 131 aa10.94□□□□□ -0.66
CTPS1-208ENST00000479480 PDE8AO60658 829 aa10.94□□□□□ -0.66
CTPS1-208ENST00000479480 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP10.94□□□□□ -0.66
CTPS1-208ENST00000479480 RASAL3Q86YV0 1011 aa10.94□□□□□ -0.66
CTPS1-208ENST00000479480 AGBL3Q8NEM8 1001 aa10.94□□□□□ -0.66
CTPS1-208ENST00000479480 APAF1O14727 1248 aa10.93□□□□□ -0.66
CTPS1-208ENST00000479480 USP17L8P0C7I0 530 aa10.93□□□□□ -0.66
CTPS1-208ENST00000479480 GOLGA2Q08379 1002 aa10.93□□□□□ -0.66
CTPS1-208ENST00000479480 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP10.93□□□□□ -0.66
CTPS1-208ENST00000479480 NBPF9Q3BBW0 867 aa10.93□□□□□ -0.66
CTPS1-208ENST00000479480 CCDC152Q4G0S7 254 aa10.93□□□□□ -0.66
CTPS1-208ENST00000479480 CCDC191Q8NCU4 936 aa10.93□□□□□ -0.66
CTPS1-208ENST00000479480 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP10.93□□□□□ -0.66
CTPS1-208ENST00000479480 MYOZ2Q9NPC6 264 aa10.93□□□□□ -0.66
CTPS1-208ENST00000479480 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP10.92□□□□□ -0.66
CTPS1-208ENST00000479480 USP17L3A6NCW0 530 aa10.92□□□□□ -0.66
CTPS1-208ENST00000479480 USP17L4A6NCW7 530 aa10.92□□□□□ -0.66
CTPS1-208ENST00000479480 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP10.92□□□□□ -0.66
CTPS1-208ENST00000479480 TBC1D8O95759 1140 aa10.92□□□□□ -0.66
CTPS1-208ENST00000479480 IGKV5-2P06315 115 aa10.92□□□□□ -0.66
CTPS1-208ENST00000479480 ATP2B4P23634 1241 aa10.92□□□□□ -0.66
CTPS1-208ENST00000479480 USP17L1Q7RTZ2 530 aa10.92□□□□□ -0.66
CTPS1-208ENST00000479480 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa10.92□□□□□ -0.66
CTPS1-208ENST00000479480 TSPYL6Q8N831 410 aa10.92□□□□□ -0.66
CTPS1-208ENST00000479480 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP10.92□□□□□ -0.66
CTPS1-208ENST00000479480 MINPP1Q9UNW1 487 aa10.92□□□□□ -0.66
CTPS1-208ENST00000479480 LRRC37AA6NMS7 1700 aa10.92□□□□□ -0.66
CTPS1-208ENST00000479480 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP10.91□□□□□ -0.66
CTPS1-208ENST00000479480 PPP1R37O75864 691 aa10.91□□□□□ -0.66
CTPS1-208ENST00000479480 PODNQ7Z5L7 613 aa10.91□□□□□ -0.66
CTPS1-208ENST00000479480 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP10.91□□□□□ -0.66
CTPS1-208ENST00000479480 TXNRD3Q86VQ6 643 aa10.91□□□□□ -0.66
CTPS1-208ENST00000479480 TTLL11Q8NHH1 800 aa10.91□□□□□ -0.66
CTPS1-208ENST00000479480 TMEM106CQ9BVX2 250 aa10.91□□□□□ -0.66
CTPS1-208ENST00000479480 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa10.91□□□□□ -0.66
CTPS1-208ENST00000479480 XDHP47989 1333 aa10.9□□□□□ -0.66
CTPS1-208ENST00000479480 GNAI1P63096 354 aa10.9□□□□□ -0.66
CTPS1-208ENST00000479480 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP10.9□□□□□ -0.66
CTPS1-208ENST00000479480 DACT2Q5SW24 774 aa10.9□□□□□ -0.66
CTPS1-208ENST00000479480 MS4A4AQ96JQ5 239 aa10.9□□□□□ -0.66
CTPS1-208ENST00000479480 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa10.9□□□□□ -0.66
CTPS1-208ENST00000479480 GREM2Q9H772 168 aa10.9□□□□□ -0.66
CTPS1-208ENST00000479480 IFT57Q9NWB7 429 aa10.9□□□□□ -0.66
CTPS1-208ENST00000479480 HPS5Q9UPZ3 1129 aa10.9□□□□□ -0.66
CTPS1-208ENST00000479480 SCN9AQ15858 1988 aa10.9□□□□□ -0.66
CTPS1-208ENST00000479480 PI4KAP2A4QPH2 592 aa10.89□□□□□ -0.67
CTPS1-208ENST00000479480 HAX1O00165 279 aa10.89□□□□□ -0.67
CTPS1-208ENST00000479480 WNT10BO00744 389 aa10.89□□□□□ -0.67
CTPS1-208ENST00000479480 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP10.89□□□□□ -0.67
CTPS1-208ENST00000479480 TM4SF4P48230 202 aa10.89□□□□□ -0.67
CTPS1-208ENST00000479480 CCT4P50991 539 aaKnown RBP10.89□□□□□ -0.67
CTPS1-208ENST00000479480 CTSWP56202 376 aa10.89□□□□□ -0.67
CTPS1-208ENST00000479480 FKBP1BP68106 108 aa10.89□□□□□ -0.67
CTPS1-208ENST00000479480 G2E3Q7L622 706 aa10.89□□□□□ -0.67
CTPS1-208ENST00000479480 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa10.89□□□□□ -0.67
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP10.89□□□□□ -0.67
CTPS1-208ENST00000479480 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP10.89□□□□□ -0.67
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